30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1060 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1060  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  184  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.21005 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1127  hypothetical protein  98.86 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1653  YagBYeeUYfjZ family protein  97.73 
 
 		 122 aa  179  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0993574  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3412  hypothetical protein  94.32 
 
 		 122 aa  174  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3352  hypothetical protein  91.95 
 
 		 122 aa  170  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2857  YagB/YeeU/YfjZ family protein  97.56 
 
 		 82 aa  167  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0385463 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2243  YagB/YeeU/YfjZ family protein  88.64 
 
 		 162 aa  164  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1405  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  92.86 
 
 		 99 aa  163  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4677  hypothetical protein  87.5 
 
 		 97 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4806  hypothetical protein  90.24 
 
 		 82 aa  156  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3211  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  92.21 
 
 		 84 aa  152  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4899  hypothetical protein  90.8 
 
 		 122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1771  hypothetical protein  67.47 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00353643  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0476  hypothetical protein  69.51 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1030  YagBYeeUYfjZ family protein  67.47 
 
 		 105 aa  121  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.845421  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3445  hypothetical protein  79.76 
 
 		 119 aa  120  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0310  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  65.06 
 
 		 105 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221822  normal  0.0101783 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3361  YagBYeeUYfjZ family protein  65.06 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3132  hypothetical protein  66.28 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0836664  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3339  YagBYeeUYfjZ family protein  61.25 
 
 		 116 aa  100  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.110104  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2889  YagBYeeUYfjZ family protein  55.42 
 
 		 111 aa  97.1  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1382  YagBYeeUYfjZ family protein  53.01 
 
 		 111 aa  94.7  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5035  Aec75  89.36 
 
 		 47 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0747  hypothetical protein  53.09 
 
 		 106 aa  87.8  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1257  hypothetical protein  46.91 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3519  hypothetical protein  46.25 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1802  hypothetical protein  46.25 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447282  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1453  hypothetical protein  45 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1774  hypothetical protein  45 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.571009  normal  0.437879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1697  hypothetical protein  45 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.16974  normal  0.0657649 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>