30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1802 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1802  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  246  6e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447282  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1697  hypothetical protein  95.76 
 
 
118 aa  239  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.16974  normal  0.0657649 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1774  hypothetical protein  94.07 
 
 
118 aa  234  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.571009  normal  0.437879 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1453  hypothetical protein  96.49 
 
 
124 aa  234  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3519  hypothetical protein  94.74 
 
 
124 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1257  hypothetical protein  56.64 
 
 
113 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0310  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  49 
 
 
105 aa  114  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221822  normal  0.0101783 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0747  hypothetical protein  48.96 
 
 
106 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1771  hypothetical protein  49 
 
 
111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00353643  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3132  hypothetical protein  48.04 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0836664  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0476  hypothetical protein  47 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1030  YagBYeeUYfjZ family protein  48 
 
 
105 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.845421  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2889  YagBYeeUYfjZ family protein  49 
 
 
111 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3352  hypothetical protein  46.96 
 
 
122 aa  103  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2243  YagB/YeeU/YfjZ family protein  47.01 
 
 
162 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3412  hypothetical protein  48.54 
 
 
122 aa  101  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3445  hypothetical protein  51.46 
 
 
119 aa  100  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1127  hypothetical protein  48.98 
 
 
122 aa  98.6  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3361  YagBYeeUYfjZ family protein  46.94 
 
 
105 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1653  YagBYeeUYfjZ family protein  47.96 
 
 
122 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0993574  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3339  YagBYeeUYfjZ family protein  47.92 
 
 
116 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.110104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1382  YagBYeeUYfjZ family protein  45 
 
 
111 aa  94.7  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1405  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  47.47 
 
 
99 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4677  hypothetical protein  48.39 
 
 
97 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4899  hypothetical protein  46.96 
 
 
122 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3211  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  45.24 
 
 
84 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1060  hypothetical protein  46.25 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.21005 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4806  hypothetical protein  43.9 
 
 
82 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2857  YagB/YeeU/YfjZ family protein  46.67 
 
 
82 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0385463 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5035  Aec75  47.62 
 
 
47 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>