30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1127 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1127  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  255  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1653  YagBYeeUYfjZ family protein  99.18 
 
 
122 aa  253  6e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0993574  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3352  hypothetical protein  93.44 
 
 
122 aa  242  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3412  hypothetical protein  94.26 
 
 
122 aa  241  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2243  YagB/YeeU/YfjZ family protein  90.16 
 
 
162 aa  232  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4899  hypothetical protein  90.16 
 
 
122 aa  207  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1060  hypothetical protein  98.86 
 
 
88 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.21005 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4677  hypothetical protein  88.66 
 
 
97 aa  181  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1405  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  94.51 
 
 
99 aa  179  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2857  YagB/YeeU/YfjZ family protein  97.56 
 
 
82 aa  166  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0385463 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4806  hypothetical protein  90.24 
 
 
82 aa  155  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3445  hypothetical protein  76.58 
 
 
119 aa  155  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3211  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  92.21 
 
 
84 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1771  hypothetical protein  67.65 
 
 
111 aa  146  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00353643  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0476  hypothetical protein  69.07 
 
 
107 aa  144  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3132  hypothetical protein  67.33 
 
 
109 aa  140  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0836664  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1030  YagBYeeUYfjZ family protein  67.35 
 
 
105 aa  138  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.845421  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0310  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  65.31 
 
 
105 aa  138  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221822  normal  0.0101783 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3361  YagBYeeUYfjZ family protein  63 
 
 
105 aa  130  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3339  YagBYeeUYfjZ family protein  64.21 
 
 
116 aa  127  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.110104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1382  YagBYeeUYfjZ family protein  55.77 
 
 
111 aa  123  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2889  YagBYeeUYfjZ family protein  58.82 
 
 
111 aa  121  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0747  hypothetical protein  54.29 
 
 
106 aa  110  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1257  hypothetical protein  48.98 
 
 
113 aa  101  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3519  hypothetical protein  48.98 
 
 
124 aa  99.4  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1802  hypothetical protein  48.98 
 
 
118 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447282  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1453  hypothetical protein  47.96 
 
 
124 aa  97.8  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1774  hypothetical protein  47.96 
 
 
118 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.571009  normal  0.437879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1697  hypothetical protein  47.96 
 
 
118 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.16974  normal  0.0657649 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5035  Aec75  89.36 
 
 
47 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>