30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3339 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3339  YagBYeeUYfjZ family protein  100 
 
 		 116 aa  243  6.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.110104  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1771  hypothetical protein  72.82 
 
 		 111 aa  160  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00353643  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3132  hypothetical protein  71.43 
 
 		 109 aa  141  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0836664  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0476  hypothetical protein  69.79 
 
 		 107 aa  141  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0310  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  64.65 
 
 		 105 aa  140  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221822  normal  0.0101783 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1030  YagBYeeUYfjZ family protein  65.66 
 
 		 105 aa  140  8e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.845421  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3352  hypothetical protein  66.32 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3361  YagBYeeUYfjZ family protein  64.65 
 
 		 105 aa  130  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2243  YagB/YeeU/YfjZ family protein  63.73 
 
 		 162 aa  129  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3412  hypothetical protein  65.26 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1127  hypothetical protein  64.21 
 
 		 122 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3445  hypothetical protein  65.38 
 
 		 119 aa  124  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1653  YagBYeeUYfjZ family protein  63.16 
 
 		 122 aa  124  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0993574  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1405  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  66.29 
 
 		 99 aa  121  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4677  hypothetical protein  64.04 
 
 		 97 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4899  hypothetical protein  60.78 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2889  YagBYeeUYfjZ family protein  55.34 
 
 		 111 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1382  YagBYeeUYfjZ family protein  57.28 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0747  hypothetical protein  55.56 
 
 		 106 aa  114  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1060  hypothetical protein  61.25 
 
 		 88 aa  100  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.21005 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1257  hypothetical protein  52.63 
 
 		 113 aa  100  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3519  hypothetical protein  49 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1453  hypothetical protein  48 
 
 		 124 aa  97.4  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1697  hypothetical protein  48 
 
 		 118 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.16974  normal  0.0657649 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1802  hypothetical protein  47.92 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447282  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1774  hypothetical protein  47 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.571009  normal  0.437879 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3211  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  62.16 
 
 		 84 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4806  hypothetical protein  60.81 
 
 		 82 aa  92  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2857  YagB/YeeU/YfjZ family protein  58.11 
 
 		 82 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0385463 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5035  Aec75  69.23 
 
 		 47 aa  57  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>