30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1771 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1771  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  234  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00353643  normal  0.0121274 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3339  YagBYeeUYfjZ family protein  72.82 
 
 
116 aa  160  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.110104  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3352  hypothetical protein  69.61 
 
 
122 aa  150  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0310  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  66.67 
 
 
105 aa  149  8.999999999999999e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221822  normal  0.0101783 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3412  hypothetical protein  68.63 
 
 
122 aa  149  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3132  hypothetical protein  68.37 
 
 
109 aa  147  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0836664  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3445  hypothetical protein  71.15 
 
 
119 aa  148  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1030  YagBYeeUYfjZ family protein  63.46 
 
 
105 aa  147  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.845421  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1127  hypothetical protein  67.65 
 
 
122 aa  146  9e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2243  YagB/YeeU/YfjZ family protein  68.32 
 
 
162 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0476  hypothetical protein  68.37 
 
 
107 aa  145  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2889  YagBYeeUYfjZ family protein  62.75 
 
 
111 aa  144  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1653  YagBYeeUYfjZ family protein  66.67 
 
 
122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0993574  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3361  YagBYeeUYfjZ family protein  62.5 
 
 
105 aa  143  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1405  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  70.53 
 
 
99 aa  142  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4677  hypothetical protein  69.57 
 
 
97 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1382  YagBYeeUYfjZ family protein  58.49 
 
 
111 aa  136  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4899  hypothetical protein  68 
 
 
122 aa  131  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0747  hypothetical protein  58 
 
 
106 aa  130  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1060  hypothetical protein  67.47 
 
 
88 aa  122  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.21005 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3211  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  68.29 
 
 
84 aa  120  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4806  hypothetical protein  68.83 
 
 
82 aa  115  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3519  hypothetical protein  51 
 
 
124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1257  hypothetical protein  52.04 
 
 
113 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1453  hypothetical protein  50 
 
 
124 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1802  hypothetical protein  49 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447282  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2857  YagB/YeeU/YfjZ family protein  66.23 
 
 
82 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0385463 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1774  hypothetical protein  49 
 
 
118 aa  110  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.571009  normal  0.437879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1697  hypothetical protein  49 
 
 
118 aa  110  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.16974  normal  0.0657649 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5035  Aec75  76.19 
 
 
47 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>