30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1453 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1453  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  258  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3519  hypothetical protein  92.74 
 
 		 124 aa  245  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1697  hypothetical protein  97.37 
 
 		 118 aa  234  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.16974  normal  0.0657649 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1802  hypothetical protein  96.49 
 
 		 118 aa  234  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447282  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1774  hypothetical protein  93.86 
 
 		 118 aa  227  4e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.571009  normal  0.437879 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1257  hypothetical protein  56.64 
 
 		 113 aa  138  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0310  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  50.51 
 
 		 105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221822  normal  0.0101783 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0747  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  114  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1771  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  113  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00353643  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0476  hypothetical protein  48 
 
 		 107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3132  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  110  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0836664  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1030  YagBYeeUYfjZ family protein  49.49 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.845421  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2889  YagBYeeUYfjZ family protein  50 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3352  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3412  hypothetical protein  48.98 
 
 		 122 aa  100  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2243  YagB/YeeU/YfjZ family protein  46.67 
 
 		 162 aa  100  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3445  hypothetical protein  50.49 
 
 		 119 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3361  YagBYeeUYfjZ family protein  47.96 
 
 		 105 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1127  hypothetical protein  47.96 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3339  YagBYeeUYfjZ family protein  48 
 
 		 116 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.110104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1382  YagBYeeUYfjZ family protein  46 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1405  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  49 
 
 		 99 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1653  YagBYeeUYfjZ family protein  46.94 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0993574  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4677  hypothetical protein  47.31 
 
 		 97 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4899  hypothetical protein  48.98 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3211  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  48.24 
 
 		 84 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4806  hypothetical protein  45.45 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1060  hypothetical protein  45 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.21005 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2857  YagB/YeeU/YfjZ family protein  44.16 
 
 		 82 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0385463 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5035  Aec75  47.62 
 
 		 47 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>