30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3412 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3412  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  256  7e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3352  hypothetical protein  93.44 
 
 
122 aa  241  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1127  hypothetical protein  94.26 
 
 
122 aa  241  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1653  YagBYeeUYfjZ family protein  93.44 
 
 
122 aa  238  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0993574  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2243  YagB/YeeU/YfjZ family protein  90.16 
 
 
162 aa  232  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4899  hypothetical protein  93.44 
 
 
122 aa  217  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4677  hypothetical protein  91.67 
 
 
97 aa  184  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1405  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  93.55 
 
 
99 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1060  hypothetical protein  94.32 
 
 
88 aa  174  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.21005 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4806  hypothetical protein  93.9 
 
 
82 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2857  YagB/YeeU/YfjZ family protein  92.68 
 
 
82 aa  157  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0385463 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3445  hypothetical protein  78.18 
 
 
119 aa  156  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3211  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  93.51 
 
 
84 aa  153  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1771  hypothetical protein  68.63 
 
 
111 aa  149  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00353643  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0476  hypothetical protein  66.02 
 
 
107 aa  146  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3132  hypothetical protein  68.32 
 
 
109 aa  142  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0836664  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1030  YagBYeeUYfjZ family protein  68.37 
 
 
105 aa  140  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.845421  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0310  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  66.33 
 
 
105 aa  140  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221822  normal  0.0101783 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3361  YagBYeeUYfjZ family protein  64 
 
 
105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3339  YagBYeeUYfjZ family protein  65.26 
 
 
116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.110104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1382  YagBYeeUYfjZ family protein  56.73 
 
 
111 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2889  YagBYeeUYfjZ family protein  59.8 
 
 
111 aa  124  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0747  hypothetical protein  56.19 
 
 
106 aa  115  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1257  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  103  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3519  hypothetical protein  50 
 
 
124 aa  101  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1802  hypothetical protein  48.54 
 
 
118 aa  101  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447282  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1774  hypothetical protein  50 
 
 
118 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.571009  normal  0.437879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1697  hypothetical protein  50 
 
 
118 aa  100  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.16974  normal  0.0657649 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1453  hypothetical protein  48.98 
 
 
124 aa  100  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5035  Aec75  93.62 
 
 
47 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>