43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3066 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1923  Primary-amine oxidase  60.6 
 
 		 656 aa  820    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265873  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3502  tyramine oxidase  55.98 
 
 		 641 aa  726    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3572  tyramine oxidase  55.42 
 
 		 669 aa  712    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3066  Amine oxidase (copper-containing)  100 
 
 		 674 aa  1379    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0325099  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2627  tyramine oxidase  56.25 
 
 		 644 aa  704    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.818449  normal  0.540036 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1997  tyramine oxidase  44.43 
 
 		 661 aa  568  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.809964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1115  tyramine oxidase  44.33 
 
 		 670 aa  544  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.458692 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1871  tyramine oxidase  44.58 
 
 		 641 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7247  tyramine oxidase  44.33 
 
 		 675 aa  515  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0305424 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2979  tyramine oxidase  41.26 
 
 		 644 aa  489  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4125  tyramine oxidase  41.76 
 
 		 673 aa  473  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.918709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2000  tyramine oxidase  42.3 
 
 		 671 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1981  tyramine oxidase  42.3 
 
 		 671 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2218  tyramine oxidase  42.06 
 
 		 659 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523259  normal  0.291041 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2046  tyramine oxidase  42.3 
 
 		 671 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3876  Primary-amine oxidase  42.53 
 
 		 643 aa  467  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1133  tyramine oxidase  41.69 
 
 		 652 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1742  Primary-amine oxidase  40.94 
 
 		 645 aa  431  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3451  tyramine oxidase  37.29 
 
 		 660 aa  430  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2477  Primary-amine oxidase  36.27 
 
 		 660 aa  415  1e-114  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4963  tyramine oxidase  37.35 
 
 		 643 aa  402  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3407  tyramine oxidase  37.78 
 
 		 670 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.417873 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07641  peroxisomal copper amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_5G07360)  36.19 
 
 		 683 aa  389  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.619902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3126  tyramine oxidase  37.62 
 
 		 670 aa  388  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12808  predicted protein  47.74 
 
 		 415 aa  389  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976255  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1383  tyramine oxidase  34.47 
 
 		 664 aa  374  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05690  conserved hypothetical protein  34.52 
 
 		 668 aa  330  5.0000000000000004e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08454  copper amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_3G00680)  32.94 
 
 		 666 aa  330  5.0000000000000004e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.601756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55523  peroxisomal copper amine oxidase  32.06 
 
 		 714 aa  326  7e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01371  hypothetical protein  31.22 
 
 		 650 aa  306  9.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1473  tyramine oxidase  31.22 
 
 		 757 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2269  tyramine oxidase  31.22 
 
 		 757 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2259  Amine oxidase (copper-containing)  31.22 
 
 		 757 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1571  tyramine oxidase  30.85 
 
 		 757 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01586  amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_1G13440)  31.55 
 
 		 682 aa  300  8e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83878  copper-containing amine oxidase  31.52 
 
 		 663 aa  297  4e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02532  copper amine oxidase 1 (Broad)  33.24 
 
 		 674 aa  284  4.0000000000000003e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.708919  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01358  tyramine oxidase, copper-requiring  31.01 
 
 		 572 aa  282  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06092  conserved hypothetical protein  26.91 
 
 		 817 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0222386 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01110  copper amine oxidase, putative  23.58 
 
 		 801 aa  96.7  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8167  Cu2+-containing amine oxidase-like protein  25.49 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3112  tyramine oxidase  21.94 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00819948  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05060  hypothetical protein  47.83 
 
 		 80 aa  55.5  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>