43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_55523 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001304  ANIA_07641  peroxisomal copper amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_5G07360)  54.56 
 
 		 683 aa  758    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.619902 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55523  peroxisomal copper amine oxidase  100 
 
 		 714 aa  1501    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1871  tyramine oxidase  36.06 
 
 		 641 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2218  tyramine oxidase  35.38 
 
 		 659 aa  382  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523259  normal  0.291041 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1997  tyramine oxidase  36.01 
 
 		 661 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.809964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1115  tyramine oxidase  34.71 
 
 		 670 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.458692 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1133  tyramine oxidase  35.45 
 
 		 652 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4125  tyramine oxidase  34.8 
 
 		 673 aa  375  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.918709  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01586  amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_1G13440)  34.48 
 
 		 682 aa  372  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08454  copper amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_3G00680)  35.2 
 
 		 666 aa  369  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.601756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2046  tyramine oxidase  35.59 
 
 		 671 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2979  tyramine oxidase  36.18 
 
 		 644 aa  369  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2000  tyramine oxidase  35.59 
 
 		 671 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1981  tyramine oxidase  35.59 
 
 		 671 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05690  conserved hypothetical protein  34.78 
 
 		 668 aa  363  6e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4963  tyramine oxidase  35.34 
 
 		 643 aa  358  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7247  tyramine oxidase  33.28 
 
 		 675 aa  354  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0305424 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12808  predicted protein  42.62 
 
 		 415 aa  345  2e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976255  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3876  Primary-amine oxidase  33.89 
 
 		 643 aa  343  7e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83878  copper-containing amine oxidase  34.58 
 
 		 663 aa  342  1e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3407  tyramine oxidase  33.03 
 
 		 670 aa  338  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.417873 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3126  tyramine oxidase  33.78 
 
 		 670 aa  336  7e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1923  Primary-amine oxidase  31.59 
 
 		 656 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265873  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1742  Primary-amine oxidase  32.89 
 
 		 645 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02532  copper amine oxidase 1 (Broad)  35.01 
 
 		 674 aa  326  1e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.708919  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2477  Primary-amine oxidase  30.28 
 
 		 660 aa  316  9.999999999999999e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3066  Amine oxidase (copper-containing)  32.28 
 
 		 674 aa  314  3.9999999999999997e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0325099  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2627  tyramine oxidase  32.63 
 
 		 644 aa  299  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.818449  normal  0.540036 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3451  tyramine oxidase  31.1 
 
 		 660 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3502  tyramine oxidase  35.18 
 
 		 641 aa  289  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3572  tyramine oxidase  35.57 
 
 		 669 aa  286  8e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1383  tyramine oxidase  30.22 
 
 		 664 aa  262  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1473  tyramine oxidase  26.65 
 
 		 757 aa  219  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1571  tyramine oxidase  26.65 
 
 		 757 aa  219  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2269  tyramine oxidase  26.65 
 
 		 757 aa  219  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2259  Amine oxidase (copper-containing)  26.65 
 
 		 757 aa  219  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01371  hypothetical protein  26.65 
 
 		 650 aa  219  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01358  tyramine oxidase, copper-requiring  26.42 
 
 		 572 aa  196  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06092  conserved hypothetical protein  21.59 
 
 		 817 aa  89.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0222386 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01110  copper amine oxidase, putative  21.29 
 
 		 801 aa  73.6  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3112  tyramine oxidase  23.45 
 
 		 392 aa  50.8  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00819948  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05060  hypothetical protein  36.36 
 
 		 80 aa  48.9  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8167  Cu2+-containing amine oxidase-like protein  23.06 
 
 		 431 aa  45.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769663 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>