43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4963 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1742  Primary-amine oxidase  56.65 
 
 		 645 aa  725    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3407  tyramine oxidase  57.38 
 
 		 670 aa  759    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.417873 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4963  tyramine oxidase  100 
 
 		 643 aa  1327    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3126  tyramine oxidase  58.73 
 
 		 670 aa  764    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1871  tyramine oxidase  45.94 
 
 		 641 aa  568  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7247  tyramine oxidase  43.16 
 
 		 675 aa  526  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0305424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2218  tyramine oxidase  42.64 
 
 		 659 aa  515  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523259  normal  0.291041 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4125  tyramine oxidase  41.47 
 
 		 673 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.918709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1981  tyramine oxidase  41.58 
 
 		 671 aa  505  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2046  tyramine oxidase  41.58 
 
 		 671 aa  505  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2000  tyramine oxidase  41.58 
 
 		 671 aa  505  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3876  Primary-amine oxidase  44.1 
 
 		 643 aa  499  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2627  tyramine oxidase  41.61 
 
 		 644 aa  464  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.818449  normal  0.540036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1115  tyramine oxidase  39.97 
 
 		 670 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.458692 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1997  tyramine oxidase  38.64 
 
 		 661 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.809964 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1133  tyramine oxidase  38.18 
 
 		 652 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.572136 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2477  Primary-amine oxidase  38.58 
 
 		 660 aa  443  1e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2979  tyramine oxidase  38.52 
 
 		 644 aa  440  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1923  Primary-amine oxidase  37.67 
 
 		 656 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265873  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07641  peroxisomal copper amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_5G07360)  37.69 
 
 		 683 aa  399  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.619902 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3066  Amine oxidase (copper-containing)  37.35 
 
 		 674 aa  396  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0325099  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12808  predicted protein  47.73 
 
 		 415 aa  394  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976255  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3451  tyramine oxidase  35.12 
 
 		 660 aa  392  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3502  tyramine oxidase  36.15 
 
 		 641 aa  382  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3572  tyramine oxidase  35.82 
 
 		 669 aa  382  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05690  conserved hypothetical protein  36.32 
 
 		 668 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1383  tyramine oxidase  35.52 
 
 		 664 aa  370  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08454  copper amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_3G00680)  35.99 
 
 		 666 aa  367  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.601756  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01586  amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_1G13440)  33.93 
 
 		 682 aa  360  5e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55523  peroxisomal copper amine oxidase  35.34 
 
 		 714 aa  358  9.999999999999999e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83878  copper-containing amine oxidase  33.8 
 
 		 663 aa  344  2.9999999999999997e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02532  copper amine oxidase 1 (Broad)  37.27 
 
 		 674 aa  317  4e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.708919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2269  tyramine oxidase  31.64 
 
 		 757 aa  314  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2259  Amine oxidase (copper-containing)  31.64 
 
 		 757 aa  314  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01371  hypothetical protein  31.64 
 
 		 650 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1473  tyramine oxidase  31.64 
 
 		 757 aa  314  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1571  tyramine oxidase  31.49 
 
 		 757 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01358  tyramine oxidase, copper-requiring  31.78 
 
 		 572 aa  286  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06092  conserved hypothetical protein  24.55 
 
 		 817 aa  103  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0222386 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3112  tyramine oxidase  23.27 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00819948  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01110  copper amine oxidase, putative  22.81 
 
 		 801 aa  84.7  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8167  Cu2+-containing amine oxidase-like protein  25.99 
 
 		 431 aa  75.5  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769663 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05060  hypothetical protein  58.97 
 
 		 80 aa  56.2  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>