43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_83878 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001305  ANIA_05690  conserved hypothetical protein  49.32 
 
 		 668 aa  674    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08454  copper amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_3G00680)  50 
 
 		 666 aa  691    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.601756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83878  copper-containing amine oxidase  100 
 
 		 663 aa  1384    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01586  amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_1G13440)  41.9 
 
 		 682 aa  499  1e-140  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02532  copper amine oxidase 1 (Broad)  40.59 
 
 		 674 aa  453  1.0000000000000001e-126  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.708919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12808  predicted protein  45.78 
 
 		 415 aa  358  1.9999999999999998e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976255  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07641  peroxisomal copper amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_5G07360)  34.65 
 
 		 683 aa  351  3e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.619902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1742  Primary-amine oxidase  34.82 
 
 		 645 aa  350  3e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1997  tyramine oxidase  32.84 
 
 		 661 aa  350  4e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.809964 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1871  tyramine oxidase  34.21 
 
 		 641 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4963  tyramine oxidase  33.8 
 
 		 643 aa  344  2.9999999999999997e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55523  peroxisomal copper amine oxidase  34.58 
 
 		 714 aa  342  1e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7247  tyramine oxidase  32.31 
 
 		 675 aa  339  8e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0305424 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4125  tyramine oxidase  33.69 
 
 		 673 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.918709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3407  tyramine oxidase  33.89 
 
 		 670 aa  333  6e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.417873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2218  tyramine oxidase  32.67 
 
 		 659 aa  331  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523259  normal  0.291041 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3126  tyramine oxidase  34.43 
 
 		 670 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112129  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2979  tyramine oxidase  32.57 
 
 		 644 aa  327  6e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1133  tyramine oxidase  32.71 
 
 		 652 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2000  tyramine oxidase  40.1 
 
 		 671 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2046  tyramine oxidase  40.1 
 
 		 671 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1981  tyramine oxidase  40.1 
 
 		 671 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1115  tyramine oxidase  32.54 
 
 		 670 aa  316  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.458692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2627  tyramine oxidase  32.92 
 
 		 644 aa  315  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.818449  normal  0.540036 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3876  Primary-amine oxidase  32.87 
 
 		 643 aa  313  7.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1923  Primary-amine oxidase  36.6 
 
 		 656 aa  310  6.999999999999999e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265873  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3502  tyramine oxidase  38.53 
 
 		 641 aa  289  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3572  tyramine oxidase  37.81 
 
 		 669 aa  286  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3066  Amine oxidase (copper-containing)  39.03 
 
 		 674 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0325099  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2477  Primary-amine oxidase  28.98 
 
 		 660 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3451  tyramine oxidase  34.32 
 
 		 660 aa  273  9e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1383  tyramine oxidase  26.79 
 
 		 664 aa  249  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1571  tyramine oxidase  27.95 
 
 		 757 aa  238  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2269  tyramine oxidase  27.95 
 
 		 757 aa  237  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01371  hypothetical protein  27.95 
 
 		 650 aa  238  4e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1473  tyramine oxidase  27.95 
 
 		 757 aa  237  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2259  Amine oxidase (copper-containing)  27.95 
 
 		 757 aa  238  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01358  tyramine oxidase, copper-requiring  29.23 
 
 		 572 aa  223  6e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06092  conserved hypothetical protein  23 
 
 		 817 aa  122  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0222386 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01110  copper amine oxidase, putative  25.8 
 
 		 801 aa  115  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3112  tyramine oxidase  26.87 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00819948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8167  Cu2+-containing amine oxidase-like protein  25.38 
 
 		 431 aa  69.7  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769663 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05060  hypothetical protein  43.48 
 
 		 80 aa  47.4  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>