53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2269 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012892  B21_01371  hypothetical protein  100 
 
 		 650 aa  1343    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01358  tyramine oxidase, copper-requiring  100 
 
 		 572 aa  1186    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2259  Amine oxidase (copper-containing)  100 
 
 		 757 aa  1560    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1473  tyramine oxidase  100 
 
 		 757 aa  1562    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2269  tyramine oxidase  100 
 
 		 757 aa  1562    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1571  tyramine oxidase  99.6 
 
 		 757 aa  1556    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1383  tyramine oxidase  34.13 
 
 		 664 aa  366  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3451  tyramine oxidase  33.12 
 
 		 660 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1871  tyramine oxidase  32.23 
 
 		 641 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4125  tyramine oxidase  32.56 
 
 		 673 aa  357  5.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.918709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1981  tyramine oxidase  31.78 
 
 		 671 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2046  tyramine oxidase  31.78 
 
 		 671 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2000  tyramine oxidase  31.78 
 
 		 671 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1997  tyramine oxidase  31.73 
 
 		 661 aa  331  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.809964 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7247  tyramine oxidase  30.15 
 
 		 675 aa  329  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0305424 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1115  tyramine oxidase  32.03 
 
 		 670 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.458692 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2979  tyramine oxidase  31.73 
 
 		 644 aa  325  2e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2218  tyramine oxidase  30.12 
 
 		 659 aa  324  3e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523259  normal  0.291041 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3876  Primary-amine oxidase  31.24 
 
 		 643 aa  319  1e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4963  tyramine oxidase  31.64 
 
 		 643 aa  314  4.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2627  tyramine oxidase  30.58 
 
 		 644 aa  305  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.818449  normal  0.540036 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1923  Primary-amine oxidase  30.31 
 
 		 656 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265873  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1133  tyramine oxidase  30.84 
 
 		 652 aa  303  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3066  Amine oxidase (copper-containing)  31.22 
 
 		 674 aa  290  9e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0325099  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1742  Primary-amine oxidase  30.22 
 
 		 645 aa  283  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3572  tyramine oxidase  28.15 
 
 		 669 aa  267  4e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3126  tyramine oxidase  28.26 
 
 		 670 aa  267  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112129  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07641  peroxisomal copper amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_5G07360)  28.92 
 
 		 683 aa  266  7e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.619902 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2477  Primary-amine oxidase  29.18 
 
 		 660 aa  266  2e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3502  tyramine oxidase  30.65 
 
 		 641 aa  264  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3407  tyramine oxidase  27.79 
 
 		 670 aa  263  8.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.417873 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83878  copper-containing amine oxidase  27.95 
 
 		 663 aa  237  5.0000000000000005e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05690  conserved hypothetical protein  25.68 
 
 		 668 aa  227  5.0000000000000005e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08454  copper amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_3G00680)  25.38 
 
 		 666 aa  223  9e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.601756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55523  peroxisomal copper amine oxidase  26.65 
 
 		 714 aa  219  2e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01586  amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_1G13440)  29.08 
 
 		 682 aa  215  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12808  predicted protein  28.94 
 
 		 415 aa  207  8e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976255  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02532  copper amine oxidase 1 (Broad)  28.63 
 
 		 674 aa  203  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.708919  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06092  conserved hypothetical protein  27.05 
 
 		 817 aa  141  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0222386 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01110  copper amine oxidase, putative  24.19 
 
 		 801 aa  103  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3112  tyramine oxidase  24.46 
 
 		 392 aa  92  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00819948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8167  Cu2+-containing amine oxidase-like protein  21.84 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769663 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  33.77 
 
 		 216 aa  53.5  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  34.65 
 
 		 298 aa  53.1  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0523  copper amine oxidase-like  29.49 
 
 		 298 aa  53.1  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000809861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  32.14 
 
 		 480 aa  51.6  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  25.26 
 
 		 514 aa  49.3  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  32.39 
 
 		 175 aa  46.6  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  31.71 
 
 		 478 aa  46.6  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  33.33 
 
 		 483 aa  46.6  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1575  copper amine oxidase-like  31.67 
 
 		 176 aa  45.4  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000369494  normal  0.0457717 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  27.4 
 
 		 452 aa  45.1  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2042  VanW family protein  32.29 
 
 		 366 aa  44.7  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>