43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12808 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_12808  predicted protein  100 
 
 
415 aa  867    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976255  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1871  tyramine oxidase  51.55 
 
 
641 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160307  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1997  tyramine oxidase  51.07 
 
 
661 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.809964 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1923  Primary-amine oxidase  47.13 
 
 
656 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265873  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7247  tyramine oxidase  49.4 
 
 
675 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0305424 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1133  tyramine oxidase  49.88 
 
 
652 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4963  tyramine oxidase  47.73 
 
 
643 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4125  tyramine oxidase  47.97 
 
 
673 aa  393  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.918709  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2627  tyramine oxidase  47.23 
 
 
644 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.818449  normal  0.540036 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3066  Amine oxidase (copper-containing)  47.74 
 
 
674 aa  387  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0325099  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1115  tyramine oxidase  49.64 
 
 
670 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.458692 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3502  tyramine oxidase  47.26 
 
 
641 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1742  Primary-amine oxidase  46.27 
 
 
645 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2000  tyramine oxidase  47.73 
 
 
671 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2046  tyramine oxidase  47.73 
 
 
671 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2218  tyramine oxidase  47.02 
 
 
659 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523259  normal  0.291041 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3407  tyramine oxidase  47.49 
 
 
670 aa  378  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.417873 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3572  tyramine oxidase  46.67 
 
 
669 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1981  tyramine oxidase  47.73 
 
 
671 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3876  Primary-amine oxidase  46.78 
 
 
643 aa  376  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08454  copper amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_3G00680)  47.12 
 
 
666 aa  373  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.601756  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3126  tyramine oxidase  45.93 
 
 
670 aa  371  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112129  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2979  tyramine oxidase  47.02 
 
 
644 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05690  conserved hypothetical protein  47.24 
 
 
668 aa  367  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07641  peroxisomal copper amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_5G07360)  44.63 
 
 
683 aa  359  6e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.619902 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83878  copper-containing amine oxidase  45.78 
 
 
663 aa  358  9.999999999999999e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2477  Primary-amine oxidase  43.93 
 
 
660 aa  358  9.999999999999999e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55523  peroxisomal copper amine oxidase  42.62 
 
 
714 aa  345  1e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01586  amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_1G13440)  43.63 
 
 
682 aa  343  4e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02532  copper amine oxidase 1 (Broad)  46.28 
 
 
674 aa  341  2e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.708919  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3451  tyramine oxidase  40.24 
 
 
660 aa  313  4.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1383  tyramine oxidase  38.86 
 
 
664 aa  298  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01358  tyramine oxidase, copper-requiring  28.94 
 
 
572 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1571  tyramine oxidase  28.94 
 
 
757 aa  207  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01371  hypothetical protein  28.94 
 
 
650 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1473  tyramine oxidase  28.94 
 
 
757 aa  207  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2269  tyramine oxidase  28.94 
 
 
757 aa  207  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2259  Amine oxidase (copper-containing)  28.94 
 
 
757 aa  207  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06092  conserved hypothetical protein  24.64 
 
 
817 aa  113  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0222386 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01110  copper amine oxidase, putative  23.06 
 
 
801 aa  96.7  7e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3112  tyramine oxidase  23.21 
 
 
392 aa  83.2  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00819948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8167  Cu2+-containing amine oxidase-like protein  25.3 
 
 
431 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0769663 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05060  hypothetical protein  47.5 
 
 
80 aa  43.9  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>