38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL05060 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006681  CNL05060  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1871  tyramine oxidase  57.78 
 
 
641 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160307  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1923  Primary-amine oxidase  52.83 
 
 
656 aa  61.6  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265873  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1742  Primary-amine oxidase  60.98 
 
 
645 aa  59.3  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02532  copper amine oxidase 1 (Broad)  45.28 
 
 
674 aa  59.3  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.708919  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2627  tyramine oxidase  59.52 
 
 
644 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.818449  normal  0.540036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3407  tyramine oxidase  57.89 
 
 
670 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.417873 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4963  tyramine oxidase  58.97 
 
 
643 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1115  tyramine oxidase  49.12 
 
 
670 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.458692 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3066  Amine oxidase (copper-containing)  47.83 
 
 
674 aa  55.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0325099  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7247  tyramine oxidase  54.76 
 
 
675 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0305424 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1997  tyramine oxidase  51.06 
 
 
661 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.809964 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3126  tyramine oxidase  55.26 
 
 
670 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112129  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1981  tyramine oxidase  48.89 
 
 
671 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3572  tyramine oxidase  45.1 
 
 
669 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4125  tyramine oxidase  48.89 
 
 
673 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.918709  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2046  tyramine oxidase  48.89 
 
 
671 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2000  tyramine oxidase  48.89 
 
 
671 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01586  amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_1G13440)  46.94 
 
 
682 aa  52.4  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3502  tyramine oxidase  51.11 
 
 
641 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08454  copper amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_3G00680)  54.76 
 
 
666 aa  51.6  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.601756  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2218  tyramine oxidase  46 
 
 
659 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523259  normal  0.291041 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05690  conserved hypothetical protein  52.38 
 
 
668 aa  51.2  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07641  peroxisomal copper amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_5G07360)  52.38 
 
 
683 aa  51.2  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.619902 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3876  Primary-amine oxidase  59.46 
 
 
643 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55523  peroxisomal copper amine oxidase  36.36 
 
 
714 aa  48.9  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1383  tyramine oxidase  52.5 
 
 
664 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2979  tyramine oxidase  42.31 
 
 
644 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3451  tyramine oxidase  43.75 
 
 
660 aa  47.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83878  copper-containing amine oxidase  43.48 
 
 
663 aa  47.4  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2477  Primary-amine oxidase  43.48 
 
 
660 aa  44.7  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12808  predicted protein  47.5 
 
 
415 aa  43.9  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2269  tyramine oxidase  51.43 
 
 
757 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01371  hypothetical protein  51.43 
 
 
650 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2259  Amine oxidase (copper-containing)  51.43 
 
 
757 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01358  tyramine oxidase, copper-requiring  51.43 
 
 
572 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1571  tyramine oxidase  51.43 
 
 
757 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1473  tyramine oxidase  51.43 
 
 
757 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>