42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01358 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012892  B21_01371  hypothetical protein  100 
 
 		 650 aa  1184    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2269  tyramine oxidase  100 
 
 		 757 aa  1186    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01358  tyramine oxidase, copper-requiring  100 
 
 		 572 aa  1181    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2259  Amine oxidase (copper-containing)  100 
 
 		 757 aa  1184    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1571  tyramine oxidase  99.82 
 
 		 757 aa  1182    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1473  tyramine oxidase  100 
 
 		 757 aa  1186    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1383  tyramine oxidase  35.4 
 
 		 664 aa  341  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3451  tyramine oxidase  33.27 
 
 		 660 aa  338  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1871  tyramine oxidase  32.74 
 
 		 641 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4125  tyramine oxidase  31.89 
 
 		 673 aa  325  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.918709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1981  tyramine oxidase  31.79 
 
 		 671 aa  319  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2046  tyramine oxidase  31.79 
 
 		 671 aa  319  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2000  tyramine oxidase  31.79 
 
 		 671 aa  319  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1997  tyramine oxidase  32 
 
 		 661 aa  306  6e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.809964 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2979  tyramine oxidase  32.4 
 
 		 644 aa  306  9.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3876  Primary-amine oxidase  31.11 
 
 		 643 aa  305  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7247  tyramine oxidase  30.1 
 
 		 675 aa  303  7.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0305424 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1115  tyramine oxidase  31.63 
 
 		 670 aa  299  8e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.458692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2218  tyramine oxidase  29.46 
 
 		 659 aa  293  5e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523259  normal  0.291041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1923  Primary-amine oxidase  31.73 
 
 		 656 aa  289  8e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2627  tyramine oxidase  31.06 
 
 		 644 aa  286  5.999999999999999e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.818449  normal  0.540036 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4963  tyramine oxidase  31.78 
 
 		 643 aa  286  8e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3066  Amine oxidase (copper-containing)  31.57 
 
 		 674 aa  282  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0325099  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1133  tyramine oxidase  30.14 
 
 		 652 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3502  tyramine oxidase  30.65 
 
 		 641 aa  265  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3572  tyramine oxidase  30.21 
 
 		 669 aa  260  4e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3126  tyramine oxidase  28.32 
 
 		 670 aa  253  9.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1742  Primary-amine oxidase  29.95 
 
 		 645 aa  251  4e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2477  Primary-amine oxidase  30.02 
 
 		 660 aa  249  9e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3407  tyramine oxidase  27.4 
 
 		 670 aa  246  8e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.417873 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07641  peroxisomal copper amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_5G07360)  28.02 
 
 		 683 aa  237  5.0000000000000005e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.619902 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83878  copper-containing amine oxidase  29.23 
 
 		 663 aa  223  4.9999999999999996e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05690  conserved hypothetical protein  26.57 
 
 		 668 aa  219  7.999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08454  copper amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_3G00680)  29.83 
 
 		 666 aa  216  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.601756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12808  predicted protein  28.94 
 
 		 415 aa  207  3e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976255  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01586  amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_1G13440)  28.81 
 
 		 682 aa  202  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55523  peroxisomal copper amine oxidase  26.42 
 
 		 714 aa  196  8.000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02532  copper amine oxidase 1 (Broad)  27.23 
 
 		 674 aa  187  5e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.708919  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06092  conserved hypothetical protein  27.05 
 
 		 817 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0222386 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01110  copper amine oxidase, putative  24.19 
 
 		 801 aa  103  9e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3112  tyramine oxidase  24.46 
 
 		 392 aa  91.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00819948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8167  Cu2+-containing amine oxidase-like protein  21.84 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769663 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>