43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2627 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1923  Primary-amine oxidase  59.43 
 
 		 656 aa  774    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265873  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3502  tyramine oxidase  55.19 
 
 		 641 aa  670    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3572  tyramine oxidase  55.5 
 
 		 669 aa  681    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3066  Amine oxidase (copper-containing)  56.25 
 
 		 674 aa  689    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0325099  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2627  tyramine oxidase  100 
 
 		 644 aa  1315    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.818449  normal  0.540036 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1997  tyramine oxidase  49.44 
 
 		 661 aa  623  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.809964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1115  tyramine oxidase  47.93 
 
 		 670 aa  589  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.458692 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1871  tyramine oxidase  46.79 
 
 		 641 aa  568  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160307  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2979  tyramine oxidase  44.12 
 
 		 644 aa  550  1e-155  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7247  tyramine oxidase  46.86 
 
 		 675 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0305424 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1981  tyramine oxidase  45.2 
 
 		 671 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2000  tyramine oxidase  45.2 
 
 		 671 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2046  tyramine oxidase  45.2 
 
 		 671 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4125  tyramine oxidase  43.83 
 
 		 673 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.918709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2218  tyramine oxidase  43.56 
 
 		 659 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523259  normal  0.291041 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3876  Primary-amine oxidase  45.6 
 
 		 643 aa  513  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1133  tyramine oxidase  41.9 
 
 		 652 aa  492  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4963  tyramine oxidase  41.61 
 
 		 643 aa  464  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1742  Primary-amine oxidase  43.18 
 
 		 645 aa  451  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3407  tyramine oxidase  41.65 
 
 		 670 aa  435  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.417873 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3126  tyramine oxidase  41.36 
 
 		 670 aa  425  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112129  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2477  Primary-amine oxidase  36.89 
 
 		 660 aa  415  1e-114  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3451  tyramine oxidase  35.27 
 
 		 660 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12808  predicted protein  47.23 
 
 		 415 aa  389  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976255  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08454  copper amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_3G00680)  35.54 
 
 		 666 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.601756  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07641  peroxisomal copper amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_5G07360)  38.58 
 
 		 683 aa  367  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.619902 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01586  amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_1G13440)  35.25 
 
 		 682 aa  358  9.999999999999999e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1383  tyramine oxidase  34.34 
 
 		 664 aa  357  2.9999999999999997e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05690  conserved hypothetical protein  35.19 
 
 		 668 aa  355  2e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83878  copper-containing amine oxidase  32.92 
 
 		 663 aa  315  1.9999999999999998e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1571  tyramine oxidase  30.58 
 
 		 757 aa  306  7e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1473  tyramine oxidase  30.58 
 
 		 757 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2269  tyramine oxidase  30.58 
 
 		 757 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01371  hypothetical protein  30.58 
 
 		 650 aa  306  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2259  Amine oxidase (copper-containing)  30.58 
 
 		 757 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55523  peroxisomal copper amine oxidase  32.63 
 
 		 714 aa  299  1e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02532  copper amine oxidase 1 (Broad)  40.42 
 
 		 674 aa  297  5e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.708919  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01358  tyramine oxidase, copper-requiring  31.06 
 
 		 572 aa  286  7e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06092  conserved hypothetical protein  26.21 
 
 		 817 aa  120  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0222386 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01110  copper amine oxidase, putative  24.47 
 
 		 801 aa  114  5e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8167  Cu2+-containing amine oxidase-like protein  27.82 
 
 		 431 aa  79.7  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3112  tyramine oxidase  21.89 
 
 		 392 aa  70.1  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00819948  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05060  hypothetical protein  59.52 
 
 		 80 aa  58.5  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>