43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1997 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1115  tyramine oxidase  67.23 
 
 		 670 aa  943    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.458692 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2979  tyramine oxidase  55.86 
 
 		 644 aa  761    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1997  tyramine oxidase  100 
 
 		 661 aa  1386    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.809964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2627  tyramine oxidase  49.44 
 
 		 644 aa  623  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.818449  normal  0.540036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1871  tyramine oxidase  47.03 
 
 		 641 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1923  Primary-amine oxidase  47.01 
 
 		 656 aa  608  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265873  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7247  tyramine oxidase  43.87 
 
 		 675 aa  568  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0305424 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3066  Amine oxidase (copper-containing)  45.13 
 
 		 674 aa  553  1e-156  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0325099  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2218  tyramine oxidase  43.89 
 
 		 659 aa  547  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523259  normal  0.291041 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1981  tyramine oxidase  42.72 
 
 		 671 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2046  tyramine oxidase  42.72 
 
 		 671 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2000  tyramine oxidase  42.72 
 
 		 671 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4125  tyramine oxidase  42.13 
 
 		 673 aa  538  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.918709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3502  tyramine oxidase  43.57 
 
 		 641 aa  526  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3876  Primary-amine oxidase  44.22 
 
 		 643 aa  518  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3572  tyramine oxidase  45.36 
 
 		 669 aa  511  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1133  tyramine oxidase  41.65 
 
 		 652 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3451  tyramine oxidase  42.19 
 
 		 660 aa  507  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2477  Primary-amine oxidase  40.16 
 
 		 660 aa  479  1e-134  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4963  tyramine oxidase  38.64 
 
 		 643 aa  450  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3407  tyramine oxidase  40.12 
 
 		 670 aa  443  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.417873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1742  Primary-amine oxidase  39.68 
 
 		 645 aa  438  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3126  tyramine oxidase  38.22 
 
 		 670 aa  431  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12808  predicted protein  51.07 
 
 		 415 aa  410  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976255  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07641  peroxisomal copper amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_5G07360)  38.33 
 
 		 683 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.619902 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1383  tyramine oxidase  36.32 
 
 		 664 aa  408  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08454  copper amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_3G00680)  35.76 
 
 		 666 aa  387  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.601756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55523  peroxisomal copper amine oxidase  36.01 
 
 		 714 aa  376  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05690  conserved hypothetical protein  34.42 
 
 		 668 aa  366  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83878  copper-containing amine oxidase  32.84 
 
 		 663 aa  350  4e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01586  amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_1G13440)  35.01 
 
 		 682 aa  349  7e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1571  tyramine oxidase  31.73 
 
 		 757 aa  332  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1473  tyramine oxidase  31.73 
 
 		 757 aa  331  3e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01371  hypothetical protein  31.73 
 
 		 650 aa  330  3e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2259  Amine oxidase (copper-containing)  31.73 
 
 		 757 aa  331  3e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2269  tyramine oxidase  31.73 
 
 		 757 aa  331  3e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01358  tyramine oxidase, copper-requiring  32 
 
 		 572 aa  306  7e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02532  copper amine oxidase 1 (Broad)  33.43 
 
 		 674 aa  303  8.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.708919  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01110  copper amine oxidase, putative  24.89 
 
 		 801 aa  107  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06092  conserved hypothetical protein  24.12 
 
 		 817 aa  92.8  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0222386 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3112  tyramine oxidase  23.5 
 
 		 392 aa  87  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00819948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8167  Cu2+-containing amine oxidase-like protein  24.26 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769663 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05060  hypothetical protein  51.06 
 
 		 80 aa  54.3  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>