136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1841 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1841  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  100 
 
 
151 aa  307  2.9999999999999997e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.682129  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0381  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.33 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000428364  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0507  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31.07 
 
 
119 aa  63.5  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105387  hitchhiker  0.0000332373 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2572  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  34.34 
 
 
111 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1608  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  30.56 
 
 
112 aa  61.2  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.439148  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1614  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  34.65 
 
 
114 aa  60.8  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2162  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  30.77 
 
 
130 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1474  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  32.99 
 
 
111 aa  60.5  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.273986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4835  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.73 
 
 
122 aa  60.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4786  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  33.7 
 
 
111 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0954  hypothetical protein  36.19 
 
 
115 aa  60.1  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0333861  normal  0.110098 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0469  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3665  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  28.28 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0572265  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1636  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  30.93 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1743  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.5 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3283  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  27.27 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0233642  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0892  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31.31 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0510919  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1215  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  31.91 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2762  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29.91 
 
 
113 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29.91 
 
 
113 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0554454  normal  0.387715 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12070  NADH dehydrogenase I subunit K  29.52 
 
 
110 aa  57  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000348654  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0792  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  30.36 
 
 
133 aa  57  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2211  membrane bound protein complex subunit mbxG  31.78 
 
 
119 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.756272  normal  0.135903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3542  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.43 
 
 
111 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148667  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5154  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  29.75 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1161  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  33.66 
 
 
108 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2862  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.68 
 
 
118 aa  54.7  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3448  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.04 
 
 
121 aa  54.7  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.458831  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0843  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31.07 
 
 
164 aa  54.3  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0864644  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0402  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  53.5  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0579  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  29.79 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1773  Na(+)/H(+) antiporter subunit C  33.33 
 
 
123 aa  53.5  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3952  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  24.24 
 
 
120 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0556  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  25 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1162  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  28.57 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.660845  normal  0.977203 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2100  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  34.41 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.696094  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1770  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  34.91 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2872  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29.29 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2342  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  34.34 
 
 
120 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.556255  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2285  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  28.57 
 
 
119 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2711  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.56 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0804  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  27.08 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0670  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  30.48 
 
 
114 aa  50.4  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2968  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  25.23 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3123  NADH dehydrogenase subunit K  33.64 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.714884  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2092  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  34.41 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25025  normal  0.290063 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0096  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  35.11 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000417  Na(+) H(+) antiporter subunit C  29.59 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0562  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  35.56 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.759234  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0149  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  28.83 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0950  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.43 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0969  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.43 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3816  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.38 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102397  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0938  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.43 
 
 
118 aa  48.1  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0283  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  34.65 
 
 
114 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0647  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  37.86 
 
 
114 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0662  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  37.86 
 
 
114 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115013  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1463  NADH dehydrogenase subunit K  31.78 
 
 
100 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1807  NADH dehydrogenase subunit K  31.78 
 
 
100 aa  47.4  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.637688 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1569  NADH dehydrogenase subunit K  31.78 
 
 
100 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0868  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.01 
 
 
131 aa  47  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2033  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  32.26 
 
 
115 aa  47.4  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1501  NADH dehydrogenase subunit K  29.91 
 
 
100 aa  47  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2763  NADH dehydrogenase subunit K  29.91 
 
 
100 aa  47  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.369555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1403  NADH dehydrogenase subunit K  29.91 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186448  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0536  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  28.26 
 
 
115 aa  47  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0609  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.25 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1396  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  29.07 
 
 
102 aa  47  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0076  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.91 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3612  NADH dehydrogenase subunit K  28.97 
 
 
102 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2541  NADH dehydrogenase subunit K  30.84 
 
 
100 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  32.26 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1780  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.43 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1442  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  34.78 
 
 
109 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.312329  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0876  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.43 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000659238 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1041  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.43 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.371299  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3374  NADH dehydrogenase I, K subunit  28.97 
 
 
102 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0675  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29.66 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3220  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  32.97 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0979  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.07 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.215867  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0581  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  32.43 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0234647 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2421  NADH dehydrogenase subunit K  28.04 
 
 
102 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.141986 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1352  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  33.33 
 
 
123 aa  45.1  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.687552  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4128  NADH dehydrogenase subunit K  28.97 
 
 
102 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.816541  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1737  NADH dehydrogenase subunit K  28.97 
 
 
102 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0907851  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3700  NADH dehydrogenase subunit K  28.97 
 
 
102 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.695488  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0742  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  28.89 
 
 
103 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3206  NADH dehydrogenase subunit K  28.04 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00833679  normal  0.168152 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3856  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29.7 
 
 
123 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0134  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29.77 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2740  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  28.05 
 
 
102 aa  44.3  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.287866  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1864  NADH dehydrogenase subunit K  28.04 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0919453 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3299  NADH dehydrogenase subunit K  27.78 
 
 
100 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.347485  normal  0.702847 
 
 
-
 
NC_002978  WD1299  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  22.34 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.11215  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0750  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.26 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0132388  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29890  NADH dehydrogenase subunit K  28.04 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0682293  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2823  NADH dehydrogenase subunit K  28.97 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167717  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1122  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.96 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.042488  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2560  NADH dehydrogenase subunit K  28.04 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5102  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  28.93 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>