More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1501 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1501  NADH dehydrogenase subunit K  100 
 
 
100 aa  194  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2763  NADH dehydrogenase subunit K  100 
 
 
100 aa  194  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.369555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1403  NADH dehydrogenase subunit K  95 
 
 
100 aa  186  9e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186448  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3299  NADH dehydrogenase subunit K  93 
 
 
100 aa  186  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.347485  normal  0.702847 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2541  NADH dehydrogenase subunit K  94 
 
 
100 aa  184  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1463  NADH dehydrogenase subunit K  94 
 
 
100 aa  183  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1807  NADH dehydrogenase subunit K  94 
 
 
100 aa  183  7e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.637688 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1569  NADH dehydrogenase subunit K  94 
 
 
100 aa  183  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02204  NADH dehydrogenase subunit K  90 
 
 
100 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1378  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  90 
 
 
100 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.110911  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02164  hypothetical protein  90 
 
 
100 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.971424  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1373  NADH dehydrogenase subunit K  90 
 
 
100 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.25258 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3418  NADH dehydrogenase subunit K  90 
 
 
100 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2572  NADH dehydrogenase subunit K  90 
 
 
100 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2428  NADH dehydrogenase subunit K  90 
 
 
100 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2433  NADH dehydrogenase subunit K  90 
 
 
100 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2823  NADH dehydrogenase subunit K  89 
 
 
100 aa  176  9e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167717  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2655  NADH dehydrogenase subunit K  89 
 
 
100 aa  176  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2665  NADH dehydrogenase subunit K  89 
 
 
100 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2458  NADH dehydrogenase subunit K  89 
 
 
100 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2547  NADH dehydrogenase subunit K  89 
 
 
100 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2503  NADH dehydrogenase subunit K  89 
 
 
100 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2558  NADH dehydrogenase subunit K  89 
 
 
100 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668631  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3374  NADH dehydrogenase I, K subunit  73.74 
 
 
102 aa  152  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3206  NADH dehydrogenase subunit K  73.74 
 
 
102 aa  152  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00833679  normal  0.168152 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29890  NADH dehydrogenase subunit K  73.74 
 
 
102 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0682293  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2560  NADH dehydrogenase subunit K  73.74 
 
 
102 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2421  NADH dehydrogenase subunit K  72.73 
 
 
102 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.141986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4128  NADH dehydrogenase subunit K  72.73 
 
 
102 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.816541  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3700  NADH dehydrogenase subunit K  72.73 
 
 
102 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.695488  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1737  NADH dehydrogenase subunit K  72.73 
 
 
102 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0907851  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1864  NADH dehydrogenase subunit K  71.72 
 
 
102 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0919453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3612  NADH dehydrogenase subunit K  70.71 
 
 
102 aa  149  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3123  NADH dehydrogenase subunit K  70.71 
 
 
102 aa  148  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.714884  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28530  NADH dehydrogenase subunit K  70.71 
 
 
102 aa  147  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146402  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1012  NADH dehydrogenase I, K subunit  75.76 
 
 
102 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1690  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  64.65 
 
 
124 aa  140  6e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1350  NADH dehydrogenase I, K subunit  64.65 
 
 
102 aa  136  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0372  NADH-quinone oxidoreductase, chain K  71.72 
 
 
100 aa  130  6e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3816  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  57.61 
 
 
102 aa  120  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102397  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0593  NADH dehydrogenase I, K subunit  65 
 
 
135 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0495543  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0582  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  65 
 
 
135 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0916912  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1022  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  66.67 
 
 
115 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1111  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  62.5 
 
 
102 aa  107  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.383646  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2869  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  49 
 
 
100 aa  101  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.680399  normal  0.0281081 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0321  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  50.5 
 
 
102 aa  100  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1118  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  61.62 
 
 
103 aa  100  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0167  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  44.55 
 
 
102 aa  92  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1356  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  51.61 
 
 
102 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156431  normal  0.258523 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4062  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  47.31 
 
 
102 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.078452  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1335  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  48.39 
 
 
102 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0191  NADH dehydrogenase subunit K  42.42 
 
 
101 aa  89.4  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0213  NADH dehydrogenase I chain K  47 
 
 
101 aa  87  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0878  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38 
 
 
100 aa  84  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174909  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1039  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  40 
 
 
100 aa  83.6  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1658  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  40 
 
 
100 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.708964  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3629  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38 
 
 
100 aa  83.6  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0170  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  42 
 
 
102 aa  82  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.840543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0152  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  42 
 
 
102 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0206  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  45.83 
 
 
102 aa  82  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.370737  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4734  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.31 
 
 
102 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0754034  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0919  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  37 
 
 
100 aa  80.1  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1607  NADH dehydrogenase (ubiquinone), K subunit  40.59 
 
 
101 aa  79.3  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0556  NADH-quinone oxidoreductase chain K  40.59 
 
 
101 aa  79.3  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1511  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  40.59 
 
 
101 aa  78.6  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505168 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0711  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  42.86 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00926088  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1818  NADH dehydrogenase subunit K  35.35 
 
 
102 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118979  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0148  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38 
 
 
100 aa  78.2  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000206273  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1306  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  34.69 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1607  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  41.35 
 
 
105 aa  77.8  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.267693  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0476  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.62 
 
 
102 aa  78.2  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0959  NADH dehydrogenase subunit K  37 
 
 
103 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.158616  normal  0.425824 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3294  NADH dehydrogenase subunit K  43 
 
 
104 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4072  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  34.69 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.035212  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1752  NADH dehydrogenase subunit K  37.62 
 
 
101 aa  76.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3744  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38.38 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1212  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38.14 
 
 
106 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0142409  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2555  NADH dehydrogenase subunit K  37.62 
 
 
101 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.485548  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1101  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  34.65 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4491  NADH dehydrogenase subunit K  40.22 
 
 
99 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5943  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.73 
 
 
114 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1413  putative transmembrane NADH dehydrogenase I (chain K) oxidoreductase protein  40 
 
 
102 aa  75.1  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.272363  normal  0.0563536 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2052  NADH dehydrogenase subunit K  35.64 
 
 
101 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1152  NADH dehydrogenase subunit K  34.65 
 
 
101 aa  74.7  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1159  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  35.48 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2995  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  37.62 
 
 
101 aa  73.9  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1540  NADH dehydrogenase subunit K  39.13 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0449834  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1570  NADH dehydrogenase subunit K  39.13 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1924  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38.38 
 
 
100 aa  73.9  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.171281  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1594  NADH dehydrogenase subunit K  39.13 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1881  NADH dehydrogenase subunit K  36 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2204  NADH dehydrogenase subunit K  36 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0553  NADH dehydrogenase I, K subunit  37.37 
 
 
108 aa  73.6  0.0000000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.719312  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0814  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  38.38 
 
 
101 aa  73.6  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3432  NADH dehydrogenase I, K subunit  42.57 
 
 
102 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.298613  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0549  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39.78 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.924204  normal  0.59827 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1565  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  38 
 
 
102 aa  73.2  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199091  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2290  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  36.63 
 
 
101 aa  73.2  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2051  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  34 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2049  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38.61 
 
 
101 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>