More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3432 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3432  NADH dehydrogenase I, K subunit  100 
 
 
102 aa  199  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.298613  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0167  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  95.1 
 
 
102 aa  193  8.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0321  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  79.41 
 
 
102 aa  167  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0170  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  69.61 
 
 
102 aa  152  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.840543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0152  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  69.61 
 
 
102 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1350  NADH dehydrogenase I, K subunit  51 
 
 
102 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3816  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53.19 
 
 
102 aa  97.8  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102397  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1807  NADH dehydrogenase subunit K  47.52 
 
 
100 aa  95.1  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.637688 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1463  NADH dehydrogenase subunit K  47.52 
 
 
100 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1569  NADH dehydrogenase subunit K  47.52 
 
 
100 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02204  NADH dehydrogenase subunit K  45.54 
 
 
100 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1378  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45.54 
 
 
100 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.110911  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02164  hypothetical protein  45.54 
 
 
100 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.971424  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2572  NADH dehydrogenase subunit K  45.54 
 
 
100 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3418  NADH dehydrogenase subunit K  45.54 
 
 
100 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1373  NADH dehydrogenase subunit K  45.54 
 
 
100 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.25258 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2428  NADH dehydrogenase subunit K  45.54 
 
 
100 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2433  NADH dehydrogenase subunit K  45.54 
 
 
100 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2823  NADH dehydrogenase subunit K  46.53 
 
 
100 aa  94  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167717  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2655  NADH dehydrogenase subunit K  44.55 
 
 
100 aa  93.6  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0213  NADH dehydrogenase I chain K  54.9 
 
 
101 aa  93.6  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28530  NADH dehydrogenase subunit K  46 
 
 
102 aa  93.6  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146402  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2665  NADH dehydrogenase subunit K  45.54 
 
 
100 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2560  NADH dehydrogenase subunit K  48 
 
 
102 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2558  NADH dehydrogenase subunit K  45.54 
 
 
100 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668631  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2503  NADH dehydrogenase subunit K  45.54 
 
 
100 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2458  NADH dehydrogenase subunit K  45.54 
 
 
100 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2547  NADH dehydrogenase subunit K  45.54 
 
 
100 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29890  NADH dehydrogenase subunit K  48 
 
 
102 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0682293  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3299  NADH dehydrogenase subunit K  45.54 
 
 
100 aa  92  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.347485  normal  0.702847 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3123  NADH dehydrogenase subunit K  48 
 
 
102 aa  92.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.714884  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3206  NADH dehydrogenase subunit K  46 
 
 
102 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00833679  normal  0.168152 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2541  NADH dehydrogenase subunit K  43.56 
 
 
100 aa  90.1  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2421  NADH dehydrogenase subunit K  47 
 
 
102 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.141986 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3374  NADH dehydrogenase I, K subunit  45 
 
 
102 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3612  NADH dehydrogenase subunit K  44 
 
 
102 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1403  NADH dehydrogenase subunit K  44.55 
 
 
100 aa  89.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186448  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4128  NADH dehydrogenase subunit K  46 
 
 
102 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.816541  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1501  NADH dehydrogenase subunit K  42.57 
 
 
100 aa  88.6  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2763  NADH dehydrogenase subunit K  42.57 
 
 
100 aa  88.6  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.369555  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3700  NADH dehydrogenase subunit K  46 
 
 
102 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.695488  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1737  NADH dehydrogenase subunit K  46 
 
 
102 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0907851  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1864  NADH dehydrogenase subunit K  45 
 
 
102 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0919453 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1938  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  53.61 
 
 
114 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.499668 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1012  NADH dehydrogenase I, K subunit  44 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1690  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  41 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1022  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  50 
 
 
115 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0919  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  40.4 
 
 
100 aa  75.5  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0878  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39 
 
 
100 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174909  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1159  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43.62 
 
 
99 aa  74.7  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1111  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  47.56 
 
 
102 aa  73.9  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.383646  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0148  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.63 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000206273  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1118  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  48 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0476  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39.78 
 
 
102 aa  70.1  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0593  NADH dehydrogenase I, K subunit  40.59 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0495543  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0582  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  40.59 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0916912  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1273  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  38.24 
 
 
102 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.326847 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0882  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38.24 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5170  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38.24 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.896952  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1511  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  40 
 
 
101 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505168 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1152  NADH dehydrogenase subunit K  35 
 
 
101 aa  68.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3500  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.25 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1607  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.54 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.267693  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3246  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  38.24 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244776  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1413  putative transmembrane NADH dehydrogenase I (chain K) oxidoreductase protein  39.22 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.272363  normal  0.0563536 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2869  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.84 
 
 
100 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.680399  normal  0.0281081 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0549  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39.39 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.924204  normal  0.59827 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2803  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  38.24 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.383978  normal  0.173 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0967  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  37.25 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0704138 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1101  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  36.27 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1503  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  37.25 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0163297  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1818  NADH dehydrogenase subunit K  31.37 
 
 
102 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118979  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0372  NADH-quinone oxidoreductase, chain K  40 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1920  NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  39.18 
 
 
98 aa  67  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00149289  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1740  NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  39.18 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0477  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  37.14 
 
 
104 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.235495  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5943  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.36 
 
 
114 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1554  NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  39.18 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000262612  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1607  NADH dehydrogenase (ubiquinone), K subunit  33 
 
 
101 aa  66.6  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0556  NADH-quinone oxidoreductase chain K  33 
 
 
101 aa  66.6  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3248  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  41.94 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.798847  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2204  NADH dehydrogenase subunit K  38.54 
 
 
103 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1434  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  36.27 
 
 
102 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.598892  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1881  NADH dehydrogenase subunit K  38.54 
 
 
103 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0638  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  38.78 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1633  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  38.78 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3183  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  38.78 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1752  NADH dehydrogenase subunit K  35.35 
 
 
101 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504148  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2052  NADH dehydrogenase subunit K  37.5 
 
 
101 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1039  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36 
 
 
100 aa  64.7  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0191  NADH dehydrogenase subunit K  31.31 
 
 
101 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2051  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  34.31 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4072  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.33 
 
 
109 aa  63.5  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.035212  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2996  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  40 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0971  NADH dehydrogenase subunit K  36.84 
 
 
101 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593359  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2095  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  40 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1293  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  40 
 
 
101 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1924  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  34.74 
 
 
100 aa  62.4  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.171281  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1041  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  35.29 
 
 
102 aa  61.6  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1212  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  35.71 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0142409  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>