More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1818 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1818  NADH dehydrogenase subunit K  100 
 
 
102 aa  203  7e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118979  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0148  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  70.71 
 
 
100 aa  150  4e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000206273  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0191  NADH dehydrogenase subunit K  63.27 
 
 
101 aa  137  3e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2204  NADH dehydrogenase subunit K  44.66 
 
 
103 aa  100  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1881  NADH dehydrogenase subunit K  44.66 
 
 
103 aa  100  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3248  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45 
 
 
101 aa  100  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.798847  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0695  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.96 
 
 
100 aa  99.8  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2052  NADH dehydrogenase subunit K  45 
 
 
101 aa  98.6  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0959  NADH dehydrogenase subunit K  45.63 
 
 
103 aa  99.4  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.158616  normal  0.425824 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0971  NADH dehydrogenase subunit K  46.46 
 
 
101 aa  98.2  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593359  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1752  NADH dehydrogenase subunit K  46 
 
 
101 aa  97.8  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504148  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1511  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43 
 
 
101 aa  97.4  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505168 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2051  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  42.16 
 
 
102 aa  97.4  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2803  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  43.14 
 
 
102 aa  97.1  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.383978  normal  0.173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2995  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  46 
 
 
101 aa  96.7  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1413  putative transmembrane NADH dehydrogenase I (chain K) oxidoreductase protein  43.14 
 
 
102 aa  96.7  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.272363  normal  0.0563536 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1740  NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  40.21 
 
 
98 aa  96.3  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1110  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1554  NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  40.21 
 
 
98 aa  96.3  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000262612  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1101  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  44 
 
 
106 aa  96.7  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1920  NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  40.21 
 
 
98 aa  96.3  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00149289  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1519  NADH dehydrogenase subunit K  59.18 
 
 
100 aa  95.9  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153961  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0882  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  42.16 
 
 
102 aa  94.4  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1924  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43.88 
 
 
100 aa  94  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.171281  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1435  NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  39.78 
 
 
104 aa  92.8  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1273  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  41.18 
 
 
102 aa  93.2  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.326847 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0967  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  41.18 
 
 
102 aa  92.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0704138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5943  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  42.55 
 
 
114 aa  92.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3500  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  41.18 
 
 
102 aa  92.8  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1152  NADH dehydrogenase subunit K  42 
 
 
101 aa  90.9  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0711  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43.43 
 
 
106 aa  90.9  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00926088  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2290  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  42 
 
 
101 aa  90.5  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1503  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  40.2 
 
 
102 aa  90.5  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0163297  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2049  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  42 
 
 
101 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3629  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  44.44 
 
 
100 aa  90.1  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0919  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  37.89 
 
 
100 aa  90.1  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1041  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  46.08 
 
 
102 aa  89.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0937  NADH dehydrogenase subunit K  48 
 
 
101 aa  89.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142932  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0878  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.37 
 
 
100 aa  89.4  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174909  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3246  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  39.22 
 
 
102 aa  88.6  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244776  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0831  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.08 
 
 
102 aa  89.4  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.22951  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0476  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39.6 
 
 
102 aa  88.6  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4072  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38.78 
 
 
109 aa  88.2  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.035212  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5170  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  40.2 
 
 
102 aa  88.6  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.896952  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1434  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  38.24 
 
 
102 aa  87.4  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.598892  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0812  NADH dehydrogenase subunit K  43.14 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.907264  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0807  NADH dehydrogenase I, K subunit  43.14 
 
 
136 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1293  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  41.58 
 
 
101 aa  85.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2655  NADH dehydrogenase subunit K  39.39 
 
 
100 aa  85.9  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1350  NADH dehydrogenase I, K subunit  37.25 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1607  NADH dehydrogenase (ubiquinone), K subunit  37 
 
 
101 aa  85.1  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0556  NADH-quinone oxidoreductase chain K  37 
 
 
101 aa  85.1  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02204  NADH dehydrogenase subunit K  38.38 
 
 
100 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1378  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38.38 
 
 
100 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.110911  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2572  NADH dehydrogenase subunit K  38.38 
 
 
100 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0477  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  39.39 
 
 
108 aa  84.3  4e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0157234  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2428  NADH dehydrogenase subunit K  38.38 
 
 
100 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2413  NADH dehydrogenase subunit K  42.16 
 
 
102 aa  84.3  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.122214  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1373  NADH dehydrogenase subunit K  38.38 
 
 
100 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.25258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2433  NADH dehydrogenase subunit K  38.38 
 
 
100 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1299  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  39 
 
 
101 aa  84.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162862  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1658  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38.38 
 
 
100 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.708964  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02164  hypothetical protein  38.38 
 
 
100 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.971424  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3418  NADH dehydrogenase subunit K  38.38 
 
 
100 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2156  NADH dehydrogenase subunit K  43.88 
 
 
101 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853972  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2503  NADH dehydrogenase subunit K  38.38 
 
 
100 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1819  NADH dehydrogenase subunit K  43.88 
 
 
101 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.667027  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1445  NADH dehydrogenase subunit K  43.88 
 
 
101 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0727  NADH dehydrogenase subunit K  43.88 
 
 
101 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.458993  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1309  NADH dehydrogenase subunit K  43.88 
 
 
101 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311292  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1071  NADH dehydrogenase subunit K  43.88 
 
 
101 aa  84.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2547  NADH dehydrogenase subunit K  38.38 
 
 
100 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1300  NADH dehydrogenase subunit K  43.88 
 
 
101 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.607429  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1039  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38.38 
 
 
100 aa  84.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1038  NADH dehydrogenase subunit K  43.88 
 
 
101 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198172  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2277  NADH dehydrogenase subunit K  43.88 
 
 
101 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2558  NADH dehydrogenase subunit K  38.38 
 
 
100 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668631  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1140  NADH dehydrogenase subunit K  43.88 
 
 
101 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22812  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2458  NADH dehydrogenase subunit K  38.38 
 
 
100 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0423  NADH dehydrogenase subunit K  43.88 
 
 
101 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2665  NADH dehydrogenase subunit K  38.38 
 
 
100 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1565  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  36.27 
 
 
102 aa  84  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199091  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1159  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38.38 
 
 
99 aa  84  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0900  NADH dehydrogenase subunit K  40.2 
 
 
102 aa  84  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0252714  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4234  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  45.92 
 
 
100 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341359  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2826  NADH-quinone oxidoreductase chain K  44.21 
 
 
101 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2695  NADH-quinone oxidoreductase chain K  44.21 
 
 
101 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2263  NADH dehydrogenase subunit K  42.86 
 
 
101 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157663 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3338  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.62 
 
 
107 aa  83.2  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.12599  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5567  NADH dehydrogenase subunit K  42.86 
 
 
101 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2823  NADH dehydrogenase subunit K  37.37 
 
 
100 aa  83.2  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167717  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3123  NADH dehydrogenase subunit K  39.39 
 
 
102 aa  83.2  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.714884  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1627  NADH dehydrogenase subunit K  42.86 
 
 
101 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2239  NADH dehydrogenase subunit K  42.86 
 
 
101 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150044  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1726  NADH dehydrogenase subunit K  39.22 
 
 
102 aa  82  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.700117  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1807  NADH dehydrogenase subunit K  36.36 
 
 
100 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.637688 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1569  NADH dehydrogenase subunit K  36.36 
 
 
100 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1032  NADH dehydrogenase subunit K  40.2 
 
 
102 aa  82  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1372  NADH dehydrogenase I chain K  36.46 
 
 
97 aa  82.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00536426  normal  0.982278 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1463  NADH dehydrogenase subunit K  36.36 
 
 
100 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>