More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0549 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0549  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  100 
 
 
99 aa  192  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.924204  normal  0.59827 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07480  NADH dehydrogenase subunit K  81.82 
 
 
99 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1540  NADH dehydrogenase subunit K  70.71 
 
 
99 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0449834  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1570  NADH dehydrogenase subunit K  69.7 
 
 
99 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1594  NADH dehydrogenase subunit K  69.7 
 
 
99 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1875  NADH dehydrogenase subunit K  69.7 
 
 
99 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13176  NADH dehydrogenase subunit K  66.33 
 
 
99 aa  138  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4491  NADH dehydrogenase subunit K  65.66 
 
 
99 aa  136  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0479  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  75.51 
 
 
99 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.476668  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0392  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  71.43 
 
 
99 aa  128  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2706  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  72.73 
 
 
99 aa  128  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7681  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  68.37 
 
 
99 aa  125  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5063  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  68.69 
 
 
99 aa  122  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0594  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  69.47 
 
 
98 aa  120  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2685  NADH dehydrogenase subunit K  70.53 
 
 
96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0903531  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0291  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  68.75 
 
 
98 aa  118  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.834143  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3219  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  74.75 
 
 
99 aa  118  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.893545  normal  0.177018 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0548  NADH dehydrogenase subunit K  66.33 
 
 
99 aa  117  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.530448  normal  0.623297 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0277  NADH dehydrogenase subunit K  73.12 
 
 
99 aa  117  6e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4055  NADH dehydrogenase subunit K  69.07 
 
 
105 aa  116  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.7005  normal  0.327685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4408  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  65.31 
 
 
99 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6084  NADH dehydrogenase subunit K  67.35 
 
 
99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4453  NADH dehydrogenase subunit K  68.04 
 
 
105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1039  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  60.42 
 
 
100 aa  114  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4548  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  66.33 
 
 
99 aa  111  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03260  NADH dehydrogenase subunit K  65.31 
 
 
99 aa  110  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0530  NADH dehydrogenase subunit K  65.31 
 
 
99 aa  110  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1284  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  66.33 
 
 
99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0476  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  57.29 
 
 
102 aa  109  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6672  NADH dehydrogenase subunit K  65.31 
 
 
99 aa  107  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0919  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  56.38 
 
 
100 aa  107  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1159  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50.51 
 
 
99 aa  106  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3178  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  71.76 
 
 
99 aa  105  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0984  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  62.24 
 
 
99 aa  104  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1372  NADH dehydrogenase I chain K  53.68 
 
 
97 aa  101  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00536426  normal  0.982278 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1607  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.12 
 
 
105 aa  100  7e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.267693  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5943  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  59.14 
 
 
114 aa  98.6  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4072  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50.53 
 
 
109 aa  98.2  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.035212  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1236  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  60 
 
 
106 aa  97.1  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4234  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  54.74 
 
 
100 aa  96.3  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341359  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3916  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  56.84 
 
 
100 aa  96.3  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1212  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54.64 
 
 
106 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0142409  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4000  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  56.84 
 
 
100 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.72795e-16 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1246  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54.84 
 
 
101 aa  94  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0581596  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3128  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  55.79 
 
 
100 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1752  NADH dehydrogenase subunit K  47.47 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504148  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1293  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  50 
 
 
101 aa  92  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1152  NADH dehydrogenase subunit K  50 
 
 
101 aa  91.3  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1881  NADH dehydrogenase subunit K  48.48 
 
 
103 aa  90.9  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2051  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  50 
 
 
102 aa  90.9  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1306  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  50.54 
 
 
103 aa  90.9  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2204  NADH dehydrogenase subunit K  48.48 
 
 
103 aa  90.9  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1101  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  51.55 
 
 
106 aa  90.5  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0348  NADH dehydrogenase I, K subunit  53.19 
 
 
100 aa  90.5  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1511  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50 
 
 
101 aa  90.1  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505168 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2052  NADH dehydrogenase subunit K  47.47 
 
 
101 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0971  NADH dehydrogenase subunit K  47.47 
 
 
101 aa  90.1  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593359  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2555  NADH dehydrogenase subunit K  50 
 
 
101 aa  89.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.485548  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3345  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  53.19 
 
 
100 aa  89.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.552125  normal  0.40692 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5091  NADH dehydrogenase subunit K  52.58 
 
 
104 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3744  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.08 
 
 
110 aa  89.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1413  putative transmembrane NADH dehydrogenase I (chain K) oxidoreductase protein  49.47 
 
 
102 aa  89.4  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.272363  normal  0.0563536 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3629  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.67 
 
 
100 aa  87.8  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3214  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54.84 
 
 
100 aa  88.2  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1867  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.94 
 
 
96 aa  87.4  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.937168  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3248  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.14 
 
 
101 aa  87.4  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.798847  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3294  NADH dehydrogenase subunit K  50 
 
 
104 aa  87  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3812  NADH dehydrogenase subunit K  50.52 
 
 
104 aa  87  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5143  NADH dehydrogenase subunit K  53.61 
 
 
104 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1954  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.96 
 
 
101 aa  87  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.287114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5535  NADH dehydrogenase subunit K  53.61 
 
 
104 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0996  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.04 
 
 
101 aa  87  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7009  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  49.52 
 
 
105 aa  86.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0959  NADH dehydrogenase subunit K  44.44 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.158616  normal  0.425824 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0322  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  51.61 
 
 
113 aa  86.3  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1110  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.11 
 
 
101 aa  85.5  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4993  NADH dehydrogenase subunit K  53.61 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2049  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  44.79 
 
 
101 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1999  NADH dehydrogenase subunit K  51.52 
 
 
101 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.211776 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1353  NADH dehydrogenase subunit K  51.52 
 
 
101 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000622565  normal  0.0242296 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2388  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.96 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00132006  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1920  NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  43.48 
 
 
98 aa  85.5  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00149289  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3204  NADH dehydrogenase subunit K  51.52 
 
 
101 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00316387  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0814  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  44 
 
 
101 aa  85.5  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0671  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)-like protein  54.84 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0695  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53.49 
 
 
100 aa  85.1  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_801  NADH:quinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)  44 
 
 
101 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  44 
 
 
101 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1554  NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  43.48 
 
 
98 aa  85.1  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000262612  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1740  NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  43.48 
 
 
98 aa  85.1  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5536  NADH dehydrogenase subunit K  52.58 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0475445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5414  NADH dehydrogenase subunit K  52.58 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5418  NADH dehydrogenase subunit K  52.58 
 
 
104 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5384  NADH dehydrogenase subunit K  52.58 
 
 
104 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.60096e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4975  NADH dehydrogenase subunit K  52.58 
 
 
104 aa  84.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2617  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain K  45.16 
 
 
101 aa  84.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.109952 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3338  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.37 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.12599  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2263  NADH dehydrogenase subunit K  50.51 
 
 
101 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157663 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1627  NADH dehydrogenase subunit K  50.51 
 
 
101 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2239  NADH dehydrogenase subunit K  50.51 
 
 
101 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>