More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2869 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2869  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  100 
 
 
100 aa  192  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.680399  normal  0.0281081 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3123  NADH dehydrogenase subunit K  53.76 
 
 
102 aa  103  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.714884  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1463  NADH dehydrogenase subunit K  49 
 
 
100 aa  103  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1807  NADH dehydrogenase subunit K  49 
 
 
100 aa  103  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.637688 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1569  NADH dehydrogenase subunit K  49 
 
 
100 aa  103  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2541  NADH dehydrogenase subunit K  48 
 
 
100 aa  102  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2823  NADH dehydrogenase subunit K  48 
 
 
100 aa  101  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167717  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3299  NADH dehydrogenase subunit K  48 
 
 
100 aa  101  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.347485  normal  0.702847 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1501  NADH dehydrogenase subunit K  49 
 
 
100 aa  101  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2763  NADH dehydrogenase subunit K  49 
 
 
100 aa  101  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.369555  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2458  NADH dehydrogenase subunit K  47 
 
 
100 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2665  NADH dehydrogenase subunit K  47 
 
 
100 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2547  NADH dehydrogenase subunit K  47 
 
 
100 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2503  NADH dehydrogenase subunit K  47 
 
 
100 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2558  NADH dehydrogenase subunit K  47 
 
 
100 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668631  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1403  NADH dehydrogenase subunit K  47 
 
 
100 aa  100  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186448  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2655  NADH dehydrogenase subunit K  47 
 
 
100 aa  100  9e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02204  NADH dehydrogenase subunit K  46 
 
 
100 aa  99  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1378  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46 
 
 
100 aa  99  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.110911  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02164  hypothetical protein  46 
 
 
100 aa  99  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.971424  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2433  NADH dehydrogenase subunit K  46 
 
 
100 aa  99  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2572  NADH dehydrogenase subunit K  46 
 
 
100 aa  99  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4062  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  51.04 
 
 
102 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.078452  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1373  NADH dehydrogenase subunit K  46 
 
 
100 aa  99  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.25258 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2428  NADH dehydrogenase subunit K  46 
 
 
100 aa  99  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3418  NADH dehydrogenase subunit K  46 
 
 
100 aa  99  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2560  NADH dehydrogenase subunit K  47.25 
 
 
102 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29890  NADH dehydrogenase subunit K  47.25 
 
 
102 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0682293  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1350  NADH dehydrogenase I, K subunit  49.49 
 
 
102 aa  97.1  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2421  NADH dehydrogenase subunit K  47.25 
 
 
102 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.141986 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3206  NADH dehydrogenase subunit K  46.59 
 
 
102 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00833679  normal  0.168152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3816  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.96 
 
 
102 aa  94.7  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102397  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1159  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.42 
 
 
99 aa  95.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28530  NADH dehydrogenase subunit K  46.15 
 
 
102 aa  94  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3374  NADH dehydrogenase I, K subunit  45.45 
 
 
102 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3612  NADH dehydrogenase subunit K  46.59 
 
 
102 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1690  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  47.31 
 
 
124 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1356  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  47.96 
 
 
102 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156431  normal  0.258523 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1012  NADH dehydrogenase I, K subunit  49.46 
 
 
102 aa  90.5  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1864  NADH dehydrogenase subunit K  45.45 
 
 
102 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0919453 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3700  NADH dehydrogenase subunit K  44.32 
 
 
102 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.695488  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4128  NADH dehydrogenase subunit K  44.32 
 
 
102 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.816541  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1737  NADH dehydrogenase subunit K  44.32 
 
 
102 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0907851  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1335  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  46.94 
 
 
102 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4734  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.96 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0754034  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5943  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43.88 
 
 
114 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0919  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  43 
 
 
100 aa  84  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1111  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  53.75 
 
 
102 aa  83.2  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.383646  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1039  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  41 
 
 
100 aa  82.4  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1658  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  41 
 
 
100 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.708964  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1818  NADH dehydrogenase subunit K  41.94 
 
 
102 aa  81.3  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118979  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3248  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45.65 
 
 
101 aa  81.3  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.798847  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1022  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  48.19 
 
 
115 aa  80.5  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0476  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43.48 
 
 
102 aa  79.7  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1372  NADH dehydrogenase I chain K  38.04 
 
 
97 aa  79.7  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00536426  normal  0.982278 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4072  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  41.3 
 
 
109 aa  79.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.035212  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1924  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  42.42 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.171281  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3867  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38.54 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0148  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  42 
 
 
100 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000206273  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0695  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  42.42 
 
 
100 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0549  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  40 
 
 
99 aa  77  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.924204  normal  0.59827 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1540  NADH dehydrogenase subunit K  41.11 
 
 
99 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0449834  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0372  NADH-quinone oxidoreductase, chain K  42.42 
 
 
100 aa  76.6  0.00000000000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1570  NADH dehydrogenase subunit K  41.11 
 
 
99 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1594  NADH dehydrogenase subunit K  41.11 
 
 
99 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0593  NADH dehydrogenase I, K subunit  46 
 
 
135 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0495543  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0582  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  46 
 
 
135 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0916912  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1110  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39.8 
 
 
101 aa  76.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0322  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  40 
 
 
113 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0878  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38.61 
 
 
100 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174909  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3629  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39 
 
 
100 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1867  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43.16 
 
 
96 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.937168  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1607  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  40.38 
 
 
105 aa  75.1  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.267693  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4491  NADH dehydrogenase subunit K  40 
 
 
99 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0711  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.73 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00926088  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13176  NADH dehydrogenase subunit K  38.46 
 
 
99 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0671  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)-like protein  37.76 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0191  NADH dehydrogenase subunit K  35.35 
 
 
101 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1875  NADH dehydrogenase subunit K  38.89 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1920  NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  38 
 
 
98 aa  72  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00149289  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1740  NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  38.46 
 
 
98 aa  71.6  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1236  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  45.16 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1554  NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  38.46 
 
 
98 aa  71.6  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000262612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0470  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  40.66 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.144201 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0206  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  39.39 
 
 
102 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.370737  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4381  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  34.31 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0402  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  39.36 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3744  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39.36 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1698  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  44.55 
 
 
102 aa  70.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0108549  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1745  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  47.67 
 
 
102 aa  70.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0245983  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0109  putative NADH dehydrogenase I chain K  48.24 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0513658  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0167  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  35.79 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0170  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.68 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.840543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0152  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.68 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0321  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  34.74 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0548  NADH dehydrogenase subunit K  43.48 
 
 
99 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.530448  normal  0.623297 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1293  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  36.73 
 
 
101 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1212  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39.36 
 
 
106 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0142409  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0594  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43.33 
 
 
98 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1152  NADH dehydrogenase subunit K  36.63 
 
 
101 aa  67.8  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>