More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3299 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3299  NADH dehydrogenase subunit K  100 
 
 
100 aa  194  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.347485  normal  0.702847 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1807  NADH dehydrogenase subunit K  95 
 
 
100 aa  187  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.637688 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1569  NADH dehydrogenase subunit K  95 
 
 
100 aa  187  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1463  NADH dehydrogenase subunit K  95 
 
 
100 aa  187  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1501  NADH dehydrogenase subunit K  93 
 
 
100 aa  186  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2763  NADH dehydrogenase subunit K  93 
 
 
100 aa  186  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.369555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1403  NADH dehydrogenase subunit K  92 
 
 
100 aa  185  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186448  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2541  NADH dehydrogenase subunit K  91 
 
 
100 aa  182  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02204  NADH dehydrogenase subunit K  89 
 
 
100 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1378  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  89 
 
 
100 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.110911  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2433  NADH dehydrogenase subunit K  89 
 
 
100 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2428  NADH dehydrogenase subunit K  89 
 
 
100 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3418  NADH dehydrogenase subunit K  89 
 
 
100 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1373  NADH dehydrogenase subunit K  89 
 
 
100 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.25258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02164  hypothetical protein  89 
 
 
100 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.971424  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2572  NADH dehydrogenase subunit K  89 
 
 
100 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2823  NADH dehydrogenase subunit K  88 
 
 
100 aa  176  9e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167717  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2655  NADH dehydrogenase subunit K  88 
 
 
100 aa  176  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2547  NADH dehydrogenase subunit K  88 
 
 
100 aa  175  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2558  NADH dehydrogenase subunit K  88 
 
 
100 aa  175  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668631  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2503  NADH dehydrogenase subunit K  88 
 
 
100 aa  175  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2458  NADH dehydrogenase subunit K  88 
 
 
100 aa  175  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2665  NADH dehydrogenase subunit K  88 
 
 
100 aa  175  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2560  NADH dehydrogenase subunit K  78.79 
 
 
102 aa  160  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29890  NADH dehydrogenase subunit K  78.79 
 
 
102 aa  160  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0682293  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3206  NADH dehydrogenase subunit K  76.77 
 
 
102 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00833679  normal  0.168152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3374  NADH dehydrogenase I, K subunit  75.76 
 
 
102 aa  156  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1864  NADH dehydrogenase subunit K  77.78 
 
 
102 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0919453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3612  NADH dehydrogenase subunit K  76.77 
 
 
102 aa  155  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4128  NADH dehydrogenase subunit K  76.77 
 
 
102 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.816541  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1737  NADH dehydrogenase subunit K  76.77 
 
 
102 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0907851  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3700  NADH dehydrogenase subunit K  76.77 
 
 
102 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.695488  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2421  NADH dehydrogenase subunit K  74.75 
 
 
102 aa  154  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.141986 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28530  NADH dehydrogenase subunit K  72.73 
 
 
102 aa  149  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146402  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3123  NADH dehydrogenase subunit K  71.72 
 
 
102 aa  149  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.714884  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1012  NADH dehydrogenase I, K subunit  75.76 
 
 
102 aa  147  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1690  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  64.65 
 
 
124 aa  137  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1350  NADH dehydrogenase I, K subunit  63.64 
 
 
102 aa  135  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0372  NADH-quinone oxidoreductase, chain K  68.69 
 
 
100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3816  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  56.52 
 
 
102 aa  117  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102397  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0593  NADH dehydrogenase I, K subunit  63 
 
 
135 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0495543  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0582  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  63 
 
 
135 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0916912  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1022  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  66.67 
 
 
115 aa  113  8.999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1111  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  63.75 
 
 
102 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.383646  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1118  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  62.63 
 
 
103 aa  103  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0321  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  51.49 
 
 
102 aa  102  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2869  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48 
 
 
100 aa  101  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.680399  normal  0.0281081 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0167  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  47.52 
 
 
102 aa  95.9  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4062  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  49.46 
 
 
102 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.078452  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0191  NADH dehydrogenase subunit K  41.41 
 
 
101 aa  91.3  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1356  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  50.54 
 
 
102 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156431  normal  0.258523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1335  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  47.31 
 
 
102 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0206  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  47.37 
 
 
102 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.370737  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0213  NADH dehydrogenase I chain K  46 
 
 
101 aa  84.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3629  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  40 
 
 
100 aa  84  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0170  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  41 
 
 
102 aa  83.6  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.840543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0152  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  41 
 
 
102 aa  83.6  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0711  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43.88 
 
 
106 aa  82  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00926088  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1658  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39 
 
 
100 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.708964  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0919  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  36 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0556  NADH-quinone oxidoreductase chain K  40.59 
 
 
101 aa  80.5  0.000000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1607  NADH dehydrogenase (ubiquinone), K subunit  40.59 
 
 
101 aa  80.5  0.000000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1039  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38 
 
 
100 aa  80.1  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0148  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37 
 
 
100 aa  80.1  0.000000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000206273  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1607  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43.27 
 
 
105 aa  80.1  0.000000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.267693  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1818  NADH dehydrogenase subunit K  35.35 
 
 
102 aa  80.1  0.000000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118979  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4734  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  49.46 
 
 
102 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0754034  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1511  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  40.59 
 
 
101 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505168 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0878  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  35 
 
 
100 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174909  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1924  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39.39 
 
 
100 aa  77.4  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.171281  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3432  NADH dehydrogenase I, K subunit  45.54 
 
 
102 aa  77  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.298613  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0476  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.63 
 
 
102 aa  77  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1159  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.63 
 
 
99 aa  77  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5943  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.76 
 
 
114 aa  76.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1152  NADH dehydrogenase subunit K  36.63 
 
 
101 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3744  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  40.4 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4491  NADH dehydrogenase subunit K  40.22 
 
 
99 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1413  putative transmembrane NADH dehydrogenase I (chain K) oxidoreductase protein  40 
 
 
102 aa  75.5  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.272363  normal  0.0563536 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1540  NADH dehydrogenase subunit K  39.13 
 
 
99 aa  74.7  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0449834  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2052  NADH dehydrogenase subunit K  35.64 
 
 
101 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1212  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39.18 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0142409  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1570  NADH dehydrogenase subunit K  38.89 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4072  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.67 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.035212  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1594  NADH dehydrogenase subunit K  38.89 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3294  NADH dehydrogenase subunit K  42 
 
 
104 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2995  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  36.63 
 
 
101 aa  73.9  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1752  NADH dehydrogenase subunit K  35.64 
 
 
101 aa  73.9  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504148  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0814  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  38.38 
 
 
101 aa  73.6  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1881  NADH dehydrogenase subunit K  36 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2204  NADH dehydrogenase subunit K  36 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1306  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  32.65 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0971  NADH dehydrogenase subunit K  36 
 
 
101 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593359  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3248  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38.78 
 
 
101 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.798847  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3867  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  40.91 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0549  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38.71 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.924204  normal  0.59827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3500  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36 
 
 
102 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3214  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1057  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  39.56 
 
 
92 aa  72  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.722396  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1875  NADH dehydrogenase subunit K  38.04 
 
 
99 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3812  NADH dehydrogenase subunit K  41.58 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>