More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3214 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3214  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  100 
 
 
100 aa  190  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1039  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  73 
 
 
100 aa  143  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1540  NADH dehydrogenase subunit K  56.12 
 
 
99 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0449834  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1570  NADH dehydrogenase subunit K  56.12 
 
 
99 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1594  NADH dehydrogenase subunit K  56.12 
 
 
99 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0919  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  58 
 
 
100 aa  118  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1607  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.92 
 
 
105 aa  116  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.267693  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13176  NADH dehydrogenase subunit K  57.45 
 
 
99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1875  NADH dehydrogenase subunit K  54.08 
 
 
99 aa  115  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4072  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  56.12 
 
 
109 aa  113  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.035212  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4408  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  62.24 
 
 
99 aa  111  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4491  NADH dehydrogenase subunit K  51.02 
 
 
99 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0549  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54.84 
 
 
99 aa  110  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.924204  normal  0.59827 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0548  NADH dehydrogenase subunit K  64.52 
 
 
99 aa  110  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.530448  normal  0.623297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5943  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54.08 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2233  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  68 
 
 
100 aa  108  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315965  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0530  NADH dehydrogenase subunit K  60.2 
 
 
99 aa  107  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0476  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50.53 
 
 
102 aa  106  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3385  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  68 
 
 
100 aa  106  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03260  NADH dehydrogenase subunit K  59.18 
 
 
99 aa  106  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1372  NADH dehydrogenase I chain K  52.69 
 
 
97 aa  106  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00536426  normal  0.982278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4453  NADH dehydrogenase subunit K  59.18 
 
 
105 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0291  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  58.33 
 
 
98 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.834143  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0277  NADH dehydrogenase subunit K  59.18 
 
 
99 aa  105  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1212  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53 
 
 
106 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0142409  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4548  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  61.22 
 
 
99 aa  104  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5063  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  59.14 
 
 
99 aa  104  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7681  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  56.12 
 
 
99 aa  103  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4055  NADH dehydrogenase subunit K  57.14 
 
 
105 aa  103  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.7005  normal  0.327685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6672  NADH dehydrogenase subunit K  56.12 
 
 
99 aa  102  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2685  NADH dehydrogenase subunit K  60.22 
 
 
96 aa  103  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0903531  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1284  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  61.29 
 
 
99 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0594  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  58.33 
 
 
98 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6084  NADH dehydrogenase subunit K  60.22 
 
 
99 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3744  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.62 
 
 
110 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0392  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  55.91 
 
 
99 aa  101  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1159  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.94 
 
 
99 aa  101  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1306  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  48.39 
 
 
103 aa  100  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1152  NADH dehydrogenase subunit K  47.52 
 
 
101 aa  97.8  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1101  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  45 
 
 
106 aa  97.8  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07480  NADH dehydrogenase subunit K  56.99 
 
 
99 aa  98.2  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1293  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  51.02 
 
 
101 aa  97.8  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1752  NADH dehydrogenase subunit K  46.53 
 
 
101 aa  97.8  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504148  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2052  NADH dehydrogenase subunit K  47.52 
 
 
101 aa  97.4  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1511  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.53 
 
 
101 aa  97.4  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505168 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2706  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  56.12 
 
 
99 aa  97.1  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1246  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53.06 
 
 
101 aa  96.7  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0581596  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0984  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54.08 
 
 
99 aa  96.3  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2204  NADH dehydrogenase subunit K  48 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1881  NADH dehydrogenase subunit K  48 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0878  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  42 
 
 
100 aa  96.3  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174909  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0971  NADH dehydrogenase subunit K  48 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593359  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2051  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  48 
 
 
102 aa  95.9  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0191  NADH dehydrogenase subunit K  44.44 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4234  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  55.56 
 
 
100 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341359  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1299  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  47.52 
 
 
101 aa  95.9  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162862  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1658  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47 
 
 
100 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.708964  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3816  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  44.9 
 
 
102 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102397  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1867  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.06 
 
 
96 aa  94  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.937168  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0959  NADH dehydrogenase subunit K  45 
 
 
103 aa  93.6  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.158616  normal  0.425824 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1236  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  55.56 
 
 
106 aa  94  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1818  NADH dehydrogenase subunit K  43.43 
 
 
102 aa  93.6  8e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0671  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)-like protein  52.75 
 
 
156 aa  93.6  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3629  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48 
 
 
100 aa  93.6  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0479  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  55.32 
 
 
99 aa  93.2  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.476668  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3500  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45 
 
 
102 aa  92.8  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3299  NADH dehydrogenase subunit K  43 
 
 
100 aa  92  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.347485  normal  0.702847 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2555  NADH dehydrogenase subunit K  43.56 
 
 
101 aa  92.8  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.485548  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3916  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53.54 
 
 
100 aa  92.8  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2995  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  46.53 
 
 
101 aa  92  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4000  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54.55 
 
 
100 aa  92.8  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.72795e-16 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2290  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  47.52 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1503  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  45 
 
 
102 aa  92  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0163297  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1413  putative transmembrane NADH dehydrogenase I (chain K) oxidoreductase protein  45 
 
 
102 aa  92.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.272363  normal  0.0563536 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3625  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  53 
 
 
100 aa  92  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.068454 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0348  NADH dehydrogenase I, K subunit  53.54 
 
 
100 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1350  NADH dehydrogenase I, K subunit  42.42 
 
 
102 aa  91.3  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1434  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  43.56 
 
 
102 aa  91.3  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.598892  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3345  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  51.52 
 
 
100 aa  91.3  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.552125  normal  0.40692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2049  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.52 
 
 
101 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1501  NADH dehydrogenase subunit K  41 
 
 
100 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3246  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  42.57 
 
 
102 aa  90.9  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244776  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2541  NADH dehydrogenase subunit K  41 
 
 
100 aa  90.9  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2763  NADH dehydrogenase subunit K  41 
 
 
100 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.369555  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5170  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45 
 
 
102 aa  90.5  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.896952  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0556  NADH-quinone oxidoreductase chain K  44.55 
 
 
101 aa  90.5  7e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1607  NADH dehydrogenase (ubiquinone), K subunit  44.55 
 
 
101 aa  90.5  7e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1273  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  56.25 
 
 
97 aa  90.5  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1999  NADH dehydrogenase subunit K  49.5 
 
 
101 aa  90.5  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.211776 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1273  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  43 
 
 
102 aa  90.1  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.326847 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1924  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  44.44 
 
 
100 aa  89.7  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.171281  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0148  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  40 
 
 
100 aa  89.7  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000206273  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2263  NADH dehydrogenase subunit K  49.5 
 
 
101 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157663 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1403  NADH dehydrogenase subunit K  40 
 
 
100 aa  89.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186448  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0967  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  43 
 
 
102 aa  89.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0704138 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5567  NADH dehydrogenase subunit K  49.5 
 
 
101 aa  90.1  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0882  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43 
 
 
102 aa  89.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1627  NADH dehydrogenase subunit K  49.5 
 
 
101 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2239  NADH dehydrogenase subunit K  49.5 
 
 
101 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150044  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1353  NADH dehydrogenase subunit K  48.51 
 
 
101 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000622565  normal  0.0242296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>