More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_03260 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_03260  NADH dehydrogenase subunit K  100 
 
 
99 aa  193  7e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6672  NADH dehydrogenase subunit K  86.87 
 
 
99 aa  159  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1875  NADH dehydrogenase subunit K  75.76 
 
 
99 aa  152  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1284  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  83.84 
 
 
99 aa  152  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1570  NADH dehydrogenase subunit K  72.73 
 
 
99 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1594  NADH dehydrogenase subunit K  72.73 
 
 
99 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1540  NADH dehydrogenase subunit K  72.73 
 
 
99 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0449834  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0277  NADH dehydrogenase subunit K  82.83 
 
 
99 aa  150  8e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13176  NADH dehydrogenase subunit K  73.47 
 
 
99 aa  149  8.999999999999999e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0548  NADH dehydrogenase subunit K  82.83 
 
 
99 aa  148  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.530448  normal  0.623297 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4491  NADH dehydrogenase subunit K  70.71 
 
 
99 aa  147  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7681  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  80.81 
 
 
99 aa  145  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4055  NADH dehydrogenase subunit K  81.44 
 
 
105 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.7005  normal  0.327685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4453  NADH dehydrogenase subunit K  81.44 
 
 
105 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6084  NADH dehydrogenase subunit K  81.82 
 
 
99 aa  144  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4408  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  75.76 
 
 
99 aa  140  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0984  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  78.79 
 
 
99 aa  140  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4548  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  79.8 
 
 
99 aa  140  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0392  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  78.57 
 
 
99 aa  140  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5063  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  76.77 
 
 
99 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0291  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  78.35 
 
 
98 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.834143  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0594  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  76.29 
 
 
98 aa  134  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0530  NADH dehydrogenase subunit K  74.75 
 
 
99 aa  131  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2685  NADH dehydrogenase subunit K  78.49 
 
 
96 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0903531  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0549  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  65.31 
 
 
99 aa  129  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.924204  normal  0.59827 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2706  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  72.45 
 
 
99 aa  123  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1039  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  60.61 
 
 
100 aa  122  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07480  NADH dehydrogenase subunit K  74.49 
 
 
99 aa  122  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0479  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  71.43 
 
 
99 aa  117  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.476668  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1607  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53.85 
 
 
105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.267693  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1159  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  56.12 
 
 
99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1212  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  55.56 
 
 
106 aa  110  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0142409  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0919  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  54.55 
 
 
100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3178  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  68.37 
 
 
99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5943  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  59.38 
 
 
114 aa  108  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4072  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  55.21 
 
 
109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.035212  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1306  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  53.19 
 
 
103 aa  107  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4000  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  63.44 
 
 
100 aa  105  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.72795e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3916  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  62.37 
 
 
100 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3128  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  61.7 
 
 
100 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1293  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  54.74 
 
 
101 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4234  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  58.51 
 
 
100 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341359  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1372  NADH dehydrogenase I chain K  55.32 
 
 
97 aa  104  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00536426  normal  0.982278 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0476  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54.64 
 
 
102 aa  103  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3219  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  67.35 
 
 
99 aa  99.8  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.893545  normal  0.177018 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0348  NADH dehydrogenase I, K subunit  56.99 
 
 
100 aa  99  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3744  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.51 
 
 
110 aa  99  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3214  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  59.18 
 
 
100 aa  99  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0322  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  55.32 
 
 
113 aa  97.8  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1246  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.52 
 
 
101 aa  97.4  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0581596  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2039  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  47.52 
 
 
105 aa  97.1  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0098763  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1867  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.61 
 
 
96 aa  95.5  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.937168  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3345  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  52.69 
 
 
100 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.552125  normal  0.40692 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4381  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50.52 
 
 
128 aa  92.8  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0671  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)-like protein  52.69 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1924  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48 
 
 
100 aa  91.7  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.171281  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  43.56 
 
 
101 aa  90.5  6e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_801  NADH:quinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)  43.56 
 
 
101 aa  90.5  6e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1511  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.37 
 
 
101 aa  90.1  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505168 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7009  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53.85 
 
 
105 aa  90.1  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1607  NADH dehydrogenase (ubiquinone), K subunit  45 
 
 
101 aa  89.4  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0556  NADH-quinone oxidoreductase chain K  45 
 
 
101 aa  89.4  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0470  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.49 
 
 
118 aa  90.1  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.144201 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3294  NADH dehydrogenase subunit K  48.96 
 
 
104 aa  89.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1752  NADH dehydrogenase subunit K  45.45 
 
 
101 aa  88.6  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504148  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0971  NADH dehydrogenase subunit K  45 
 
 
101 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593359  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1110  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.32 
 
 
101 aa  89  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2233  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  59.6 
 
 
100 aa  88.6  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315965  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0814  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  43.56 
 
 
101 aa  88.6  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3248  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45.26 
 
 
101 aa  88.2  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.798847  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3385  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  58.59 
 
 
100 aa  87.8  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1290  F420H2 dehydrogenase subunit K  45 
 
 
100 aa  87.8  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  7.20191e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0402  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  50.5 
 
 
127 aa  87.4  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4400  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.96 
 
 
101 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1236  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  59.14 
 
 
106 aa  87  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2204  NADH dehydrogenase subunit K  46.46 
 
 
103 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1881  NADH dehydrogenase subunit K  46.46 
 
 
103 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0695  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  56.25 
 
 
100 aa  87  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1413  putative transmembrane NADH dehydrogenase I (chain K) oxidoreductase protein  45.45 
 
 
102 aa  86.7  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.272363  normal  0.0563536 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2052  NADH dehydrogenase subunit K  45.45 
 
 
101 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1152  NADH dehydrogenase subunit K  42.42 
 
 
101 aa  86.3  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1299  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  47.37 
 
 
101 aa  86.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162862  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0373  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  58.59 
 
 
100 aa  85.5  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5170  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.47 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.896952  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2049  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  44.79 
 
 
101 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0882  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  44.44 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1273  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  44.44 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.326847 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0967  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  44.44 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0704138 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0959  NADH dehydrogenase subunit K  43.43 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.158616  normal  0.425824 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1346  NADH dehydrogenase subunit K  53.61 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.948415  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3867  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  42.7 
 
 
158 aa  84.7  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5091  NADH dehydrogenase subunit K  48.42 
 
 
104 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1503  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  43.43 
 
 
102 aa  84.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0163297  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2051  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  43.75 
 
 
102 aa  84.7  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1273  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50.54 
 
 
97 aa  84.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5469  NADH dehydrogenase subunit K  49.47 
 
 
104 aa  84  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0938  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.55 
 
 
110 aa  83.6  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103381  normal  0.508582 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0711  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.81 
 
 
106 aa  83.6  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00926088  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2995  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  44.79 
 
 
101 aa  83.6  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26871  NADH dehydrogenase subunit K  55.21 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>