More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1246 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1246  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  100 
 
 
101 aa  191  4e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0581596  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5943  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54 
 
 
114 aa  111  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1413  putative transmembrane NADH dehydrogenase I (chain K) oxidoreductase protein  56.44 
 
 
102 aa  110  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.272363  normal  0.0563536 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1039  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  57.14 
 
 
100 aa  107  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0882  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53.47 
 
 
102 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1273  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  53.47 
 
 
102 aa  106  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.326847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4072  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53.54 
 
 
109 aa  105  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.035212  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1511  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54.55 
 
 
101 aa  105  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505168 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0967  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  52.48 
 
 
102 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0704138 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1503  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  53.47 
 
 
102 aa  104  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0163297  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0476  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  57.73 
 
 
102 aa  104  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1658  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  61.8 
 
 
100 aa  103  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.708964  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3500  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  52.48 
 
 
102 aa  103  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1306  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  54.08 
 
 
103 aa  103  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5170  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53.47 
 
 
102 aa  103  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.896952  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0549  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54.84 
 
 
99 aa  102  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.924204  normal  0.59827 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0919  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  54.26 
 
 
100 aa  102  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0971  NADH dehydrogenase subunit K  51 
 
 
101 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593359  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3246  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  53.06 
 
 
102 aa  101  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244776  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1152  NADH dehydrogenase subunit K  53.54 
 
 
101 aa  100  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2204  NADH dehydrogenase subunit K  52 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1434  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  53.06 
 
 
102 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.598892  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1881  NADH dehydrogenase subunit K  52 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2052  NADH dehydrogenase subunit K  51.52 
 
 
101 aa  98.6  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2803  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  51.49 
 
 
102 aa  98.6  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.383978  normal  0.173 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1101  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  49.49 
 
 
106 aa  97.8  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4453  NADH dehydrogenase subunit K  56 
 
 
105 aa  97.8  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1752  NADH dehydrogenase subunit K  49.49 
 
 
101 aa  97.4  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504148  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1293  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  57 
 
 
101 aa  97.1  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4055  NADH dehydrogenase subunit K  55 
 
 
105 aa  97.1  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.7005  normal  0.327685 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2555  NADH dehydrogenase subunit K  51.52 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.485548  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2051  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  48.51 
 
 
102 aa  96.7  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1159  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.37 
 
 
99 aa  95.5  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0548  NADH dehydrogenase subunit K  56.38 
 
 
99 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.530448  normal  0.623297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7681  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  56.38 
 
 
99 aa  95.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0878  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.96 
 
 
100 aa  94.7  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174909  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1212  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.92 
 
 
106 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0142409  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1565  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  49.5 
 
 
102 aa  94.7  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4234  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  56.57 
 
 
100 aa  94.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341359  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4000  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  61.29 
 
 
100 aa  94.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.72795e-16 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6672  NADH dehydrogenase subunit K  54.55 
 
 
99 aa  94.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5567  NADH dehydrogenase subunit K  56.57 
 
 
101 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2263  NADH dehydrogenase subunit K  56.57 
 
 
101 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157663 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1627  NADH dehydrogenase subunit K  56.57 
 
 
101 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2239  NADH dehydrogenase subunit K  56.57 
 
 
101 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150044  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0277  NADH dehydrogenase subunit K  56.84 
 
 
99 aa  94  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3345  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  55.1 
 
 
100 aa  93.6  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.552125  normal  0.40692 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1299  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  53.54 
 
 
101 aa  93.6  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162862  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6084  NADH dehydrogenase subunit K  57.45 
 
 
99 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0959  NADH dehydrogenase subunit K  51.58 
 
 
103 aa  92.8  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.158616  normal  0.425824 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03260  NADH dehydrogenase subunit K  51.52 
 
 
99 aa  93.2  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3916  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  59.14 
 
 
100 aa  92.8  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1570  NADH dehydrogenase subunit K  48.94 
 
 
99 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2821  NADH dehydrogenase subunit K  56.57 
 
 
101 aa  93.2  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0637292  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3744  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.49 
 
 
110 aa  93.2  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1594  NADH dehydrogenase subunit K  48.94 
 
 
99 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1300  NADH dehydrogenase subunit K  55.56 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.607429  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0348  NADH dehydrogenase I, K subunit  55.1 
 
 
100 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2156  NADH dehydrogenase subunit K  55.56 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853972  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1819  NADH dehydrogenase subunit K  55.56 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.667027  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1038  NADH dehydrogenase subunit K  55.56 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198172  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1445  NADH dehydrogenase subunit K  55.56 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1140  NADH dehydrogenase subunit K  55.56 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22812  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1071  NADH dehydrogenase subunit K  55.56 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1540  NADH dehydrogenase subunit K  48.94 
 
 
99 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0449834  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1309  NADH dehydrogenase subunit K  55.56 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311292  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0423  NADH dehydrogenase subunit K  55.56 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0727  NADH dehydrogenase subunit K  55.56 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.458993  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2277  NADH dehydrogenase subunit K  55.56 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1607  NADH dehydrogenase (ubiquinone), K subunit  44.44 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0556  NADH-quinone oxidoreductase chain K  44.44 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1924  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.61 
 
 
100 aa  91.7  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.171281  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4548  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.52 
 
 
99 aa  91.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1041  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  53.47 
 
 
102 aa  91.7  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1607  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45.63 
 
 
105 aa  92  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.267693  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2049  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  49.49 
 
 
101 aa  92  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1284  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  52.53 
 
 
99 aa  91.3  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13176  NADH dehydrogenase subunit K  50.54 
 
 
99 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1372  NADH dehydrogenase I chain K  47.87 
 
 
97 aa  91.3  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00536426  normal  0.982278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1875  NADH dehydrogenase subunit K  46.46 
 
 
99 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3204  NADH dehydrogenase subunit K  54.55 
 
 
101 aa  90.9  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00316387  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1353  NADH dehydrogenase subunit K  54.55 
 
 
101 aa  90.9  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000622565  normal  0.0242296 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1818  NADH dehydrogenase subunit K  44.09 
 
 
102 aa  90.5  7e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118979  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1346  NADH dehydrogenase subunit K  52.43 
 
 
103 aa  90.5  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.948415  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0322  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  56.18 
 
 
113 aa  90.1  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3629  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45.92 
 
 
100 aa  90.1  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0671  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)-like protein  58.82 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3338  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47 
 
 
107 aa  90.1  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.12599  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26871  NADH dehydrogenase subunit K  54.46 
 
 
109 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2706  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53.06 
 
 
99 aa  89.4  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0159  NADH dehydrogenase subunit K  54.17 
 
 
107 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0831  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53.47 
 
 
102 aa  89.4  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.22951  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1999  NADH dehydrogenase subunit K  53.54 
 
 
101 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.211776 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01861  NADH dehydrogenase subunit K  51.96 
 
 
106 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3128  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  55.32 
 
 
100 aa  88.2  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01741  NADH dehydrogenase subunit K  53.92 
 
 
107 aa  88.2  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.359361  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3248  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  49.46 
 
 
101 aa  88.2  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.798847  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0996  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  52.53 
 
 
101 aa  88.6  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0695  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53.49 
 
 
100 aa  88.2  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2039  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  44.9 
 
 
105 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0098763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>