More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2039 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2039  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  100 
 
 
105 aa  202  8e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0098763  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1212  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  66.34 
 
 
106 aa  142  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0142409  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0814  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  51.02 
 
 
101 aa  108  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1346  NADH dehydrogenase subunit K  54.08 
 
 
103 aa  107  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.948415  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2526  NADH dehydrogenase subunit K  51.49 
 
 
103 aa  104  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  50 
 
 
101 aa  102  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_801  NADH:quinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)  50 
 
 
101 aa  102  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3744  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  52.88 
 
 
110 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2095  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53.61 
 
 
108 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2996  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  52.58 
 
 
108 aa  100  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0671  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)-like protein  53.33 
 
 
156 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26871  NADH dehydrogenase subunit K  49.52 
 
 
109 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0984  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  60.2 
 
 
102 aa  98.2  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2409  NADH dehydrogenase subunit K  51.04 
 
 
109 aa  97.4  5e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0322  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  54.44 
 
 
113 aa  97.1  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3294  NADH dehydrogenase subunit K  54.64 
 
 
104 aa  96.7  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01771  NADH dehydrogenase subunit K  51.04 
 
 
106 aa  96.7  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01751  NADH dehydrogenase subunit K  51.04 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0159  NADH dehydrogenase subunit K  51.04 
 
 
107 aa  96.7  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01741  NADH dehydrogenase subunit K  50 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.359361  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0283  NADH dehydrogenase subunit K  48.96 
 
 
109 aa  95.5  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01861  NADH dehydrogenase subunit K  51.04 
 
 
106 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1565  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  47.96 
 
 
102 aa  95.5  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199091  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1293  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  47.42 
 
 
101 aa  95.9  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1042  NADH dehydrogenase subunit K  53.76 
 
 
103 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.514853  hitchhiker  0.00000310035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1013  NADH dehydrogenase subunit K  53.76 
 
 
103 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1524  NADH dehydrogenase subunit K  47.92 
 
 
109 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02301  NADH dehydrogenase subunit K  47.92 
 
 
109 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4381  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45.74 
 
 
128 aa  91.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0399  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  54.46 
 
 
101 aa  91.3  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4987  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53.12 
 
 
105 aa  90.9  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.666678  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1576  NADH dehydrogenase subunit K  52.48 
 
 
108 aa  90.9  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.343884  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2717  NADH dehydrogenase subunit K  53.47 
 
 
101 aa  90.5  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.290842 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5091  NADH dehydrogenase subunit K  49.48 
 
 
104 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3812  NADH dehydrogenase subunit K  49.48 
 
 
104 aa  89.4  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5943  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43.88 
 
 
114 aa  89.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0206  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  40.21 
 
 
102 aa  88.6  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.370737  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5469  NADH dehydrogenase subunit K  50.52 
 
 
104 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0971  NADH dehydrogenase subunit K  46.08 
 
 
101 aa  87.8  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593359  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1413  putative transmembrane NADH dehydrogenase I (chain K) oxidoreductase protein  46.39 
 
 
102 aa  87  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.272363  normal  0.0563536 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1658  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45.65 
 
 
100 aa  87  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.708964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5418  NADH dehydrogenase subunit K  49.48 
 
 
104 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4975  NADH dehydrogenase subunit K  49.48 
 
 
104 aa  86.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5384  NADH dehydrogenase subunit K  49.48 
 
 
104 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.60096e-18 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2204  NADH dehydrogenase subunit K  45.63 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4993  NADH dehydrogenase subunit K  49.48 
 
 
104 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1881  NADH dehydrogenase subunit K  45.63 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5536  NADH dehydrogenase subunit K  49.48 
 
 
104 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0475445 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1511  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.39 
 
 
101 aa  86.7  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505168 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5414  NADH dehydrogenase subunit K  49.48 
 
 
104 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2052  NADH dehydrogenase subunit K  46.53 
 
 
101 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2526  NADH dehydrogenase subunit K  51.02 
 
 
101 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.313411  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1994  NADH dehydrogenase subunit K  51.02 
 
 
101 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0298291  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1363  NADH dehydrogenase subunit K  48.98 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1752  NADH dehydrogenase subunit K  47.52 
 
 
101 aa  85.5  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504148  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2049  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.96 
 
 
101 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1188  NADH dehydrogenase subunit K  51.02 
 
 
101 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.288181  normal  0.242913 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5143  NADH dehydrogenase subunit K  48.45 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5535  NADH dehydrogenase subunit K  48.45 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1271  NADH dehydrogenase subunit K  47.96 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0495478  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0851  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  52.75 
 
 
133 aa  85.5  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0132836  hitchhiker  0.000000191003 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1434  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  44.55 
 
 
102 aa  84.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.598892  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1152  NADH dehydrogenase subunit K  45.92 
 
 
101 aa  84.3  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0477  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  40 
 
 
104 aa  84.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.235495  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0757  NADH dehydrogenase subunit K  50 
 
 
101 aa  84.3  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.588315  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3629  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.39 
 
 
100 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3246  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  44.55 
 
 
102 aa  84  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244776  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2555  NADH dehydrogenase subunit K  48.98 
 
 
101 aa  84  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.485548  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2414  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  51.55 
 
 
103 aa  83.6  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0025365  hitchhiker  0.00922504 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1726  NADH dehydrogenase subunit K  46.94 
 
 
102 aa  83.6  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.700117  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3216  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50.48 
 
 
102 aa  83.6  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2995  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  45.92 
 
 
101 aa  83.6  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1326  NADH dehydrogenase subunit K  51.02 
 
 
101 aa  83.6  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.341038  normal  0.0221651 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0959  NADH dehydrogenase subunit K  47.52 
 
 
103 aa  83.2  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.158616  normal  0.425824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7681  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.53 
 
 
99 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1924  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  42.42 
 
 
100 aa  83.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.171281  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03260  NADH dehydrogenase subunit K  47.52 
 
 
99 aa  82.8  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1503  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  45.54 
 
 
102 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0163297  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4136  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.98 
 
 
101 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0556  NADH-quinone oxidoreductase chain K  45.92 
 
 
101 aa  82.4  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6084  NADH dehydrogenase subunit K  50.5 
 
 
99 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0900  NADH dehydrogenase subunit K  47.96 
 
 
102 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0252714  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1607  NADH dehydrogenase (ubiquinone), K subunit  45.92 
 
 
101 aa  82.4  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2875  NADH dehydrogenase subunit K  49.48 
 
 
103 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.542064  normal  0.368336 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0548  NADH dehydrogenase subunit K  48.51 
 
 
99 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.530448  normal  0.623297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2051  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  45.71 
 
 
102 aa  82  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1570  NADH dehydrogenase subunit K  42.57 
 
 
99 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0882  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  44.55 
 
 
102 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0402  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  46.74 
 
 
127 aa  82  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1594  NADH dehydrogenase subunit K  42.57 
 
 
99 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0470  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45.65 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.144201 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3248  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  42.86 
 
 
101 aa  81.3  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.798847  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1540  NADH dehydrogenase subunit K  43 
 
 
99 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0449834  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0919  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  42.86 
 
 
100 aa  81.6  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4072  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38.24 
 
 
109 aa  81.3  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.035212  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1039  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45.45 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0553  NADH dehydrogenase I, K subunit  45.1 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.719312  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6672  NADH dehydrogenase subunit K  47.52 
 
 
99 aa  80.9  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1299  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  44.55 
 
 
101 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162862  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1273  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  43.56 
 
 
102 aa  80.9  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.326847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>