More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0348 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0348  NADH dehydrogenase I, K subunit  100 
 
 
100 aa  196  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3345  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  93 
 
 
100 aa  165  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.552125  normal  0.40692 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4234  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  90.91 
 
 
100 aa  155  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341359  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3916  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  88 
 
 
100 aa  154  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4000  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  86 
 
 
100 aa  151  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.72795e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3128  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  78.79 
 
 
100 aa  140  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1306  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  55.56 
 
 
103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1540  NADH dehydrogenase subunit K  55.32 
 
 
99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0449834  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1594  NADH dehydrogenase subunit K  55.32 
 
 
99 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1570  NADH dehydrogenase subunit K  55.32 
 
 
99 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1039  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53.54 
 
 
100 aa  110  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4072  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  55.1 
 
 
109 aa  110  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.035212  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1607  NADH dehydrogenase (ubiquinone), K subunit  52 
 
 
101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0556  NADH-quinone oxidoreductase chain K  52 
 
 
101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0549  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53.19 
 
 
99 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.924204  normal  0.59827 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1511  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51 
 
 
101 aa  109  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4548  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  59.79 
 
 
99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5943  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  59.34 
 
 
114 aa  108  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2049  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  52 
 
 
101 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0548  NADH dehydrogenase subunit K  61.7 
 
 
99 aa  107  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.530448  normal  0.623297 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1607  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  49.04 
 
 
105 aa  107  5e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.267693  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1293  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  54.64 
 
 
101 aa  107  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13176  NADH dehydrogenase subunit K  53.19 
 
 
99 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4400  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  57 
 
 
101 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6672  NADH dehydrogenase subunit K  62.37 
 
 
99 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4491  NADH dehydrogenase subunit K  52.13 
 
 
99 aa  105  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0476  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  49.48 
 
 
102 aa  105  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0291  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  58.06 
 
 
98 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.834143  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1875  NADH dehydrogenase subunit K  51.55 
 
 
99 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2052  NADH dehydrogenase subunit K  47 
 
 
101 aa  104  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1212  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50.53 
 
 
106 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0142409  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1159  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50.52 
 
 
99 aa  104  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0594  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  58.06 
 
 
98 aa  103  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1881  NADH dehydrogenase subunit K  48.48 
 
 
103 aa  103  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2204  NADH dehydrogenase subunit K  48.48 
 
 
103 aa  103  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0984  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  55.67 
 
 
99 aa  103  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4408  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  58.16 
 
 
99 aa  103  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0971  NADH dehydrogenase subunit K  46 
 
 
101 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593359  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1152  NADH dehydrogenase subunit K  46 
 
 
101 aa  102  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03260  NADH dehydrogenase subunit K  56.99 
 
 
99 aa  102  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1752  NADH dehydrogenase subunit K  49 
 
 
101 aa  102  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504148  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0148  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45.45 
 
 
100 aa  103  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000206273  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4055  NADH dehydrogenase subunit K  58.16 
 
 
105 aa  102  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.7005  normal  0.327685 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0919  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  48.48 
 
 
100 aa  103  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0530  NADH dehydrogenase subunit K  57.45 
 
 
99 aa  102  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2051  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  51.52 
 
 
102 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1954  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  55 
 
 
101 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.287114  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1246  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  55.1 
 
 
101 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0581596  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0695  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  49.49 
 
 
100 aa  102  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3338  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.47 
 
 
107 aa  101  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.12599  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1273  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  47.47 
 
 
102 aa  101  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.326847 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2234  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  56 
 
 
101 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0392  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54.74 
 
 
99 aa  101  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0882  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.47 
 
 
102 aa  101  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7681  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  55.32 
 
 
99 aa  101  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0277  NADH dehydrogenase subunit K  56.99 
 
 
99 aa  101  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1413  putative transmembrane NADH dehydrogenase I (chain K) oxidoreductase protein  47.47 
 
 
102 aa  100  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.272363  normal  0.0563536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0967  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  46.46 
 
 
102 aa  100  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0704138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1204  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  55 
 
 
101 aa  100  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1075  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  55 
 
 
101 aa  100  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.203782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4453  NADH dehydrogenase subunit K  57.14 
 
 
105 aa  100  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1009  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  55 
 
 
101 aa  100  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0939643  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6084  NADH dehydrogenase subunit K  59.57 
 
 
99 aa  100  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0959  NADH dehydrogenase subunit K  48.48 
 
 
103 aa  100  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.158616  normal  0.425824 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1565  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  49.49 
 
 
102 aa  100  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199091  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1101  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  46.46 
 
 
106 aa  100  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5170  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.46 
 
 
102 aa  99.8  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.896952  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2803  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  47.47 
 
 
102 aa  99.4  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.383978  normal  0.173 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3216  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53.54 
 
 
102 aa  99.4  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2685  NADH dehydrogenase subunit K  54.26 
 
 
96 aa  98.6  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0903531  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1284  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  56.99 
 
 
99 aa  98.6  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1818  NADH dehydrogenase subunit K  42.86 
 
 
102 aa  99  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118979  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2388  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54.55 
 
 
102 aa  99  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00132006  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4136  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  55 
 
 
101 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5063  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54.26 
 
 
99 aa  99.4  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2995  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  46 
 
 
101 aa  98.2  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1434  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  46 
 
 
102 aa  98.2  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.598892  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0878  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45.45 
 
 
100 aa  97.8  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174909  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1188  NADH dehydrogenase subunit K  56 
 
 
101 aa  97.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.288181  normal  0.242913 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2526  NADH dehydrogenase subunit K  56 
 
 
101 aa  97.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.313411  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0191  NADH dehydrogenase subunit K  45.45 
 
 
101 aa  97.4  5e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1994  NADH dehydrogenase subunit K  56 
 
 
101 aa  97.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0298291  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1960  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  52 
 
 
101 aa  97.4  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.308145  normal  0.0401346 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3500  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.46 
 
 
102 aa  97.1  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1503  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  46.46 
 
 
102 aa  97.1  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0163297  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1299  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  47 
 
 
101 aa  97.1  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162862  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1999  NADH dehydrogenase subunit K  52 
 
 
101 aa  96.7  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.211776 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0814  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  47.47 
 
 
101 aa  96.7  9e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1924  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45.45 
 
 
100 aa  96.7  9e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.171281  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0718  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51 
 
 
101 aa  95.9  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0812  NADH dehydrogenase subunit K  53.54 
 
 
102 aa  96.3  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.907264  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4623  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54.55 
 
 
104 aa  96.3  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0763865 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0807  NADH dehydrogenase I, K subunit  57.45 
 
 
136 aa  96.3  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1372  NADH dehydrogenase I chain K  46.88 
 
 
97 aa  96.3  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00536426  normal  0.982278 
 
 
-
 
NC_002936  DET0930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  47.47 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2263  NADH dehydrogenase subunit K  51 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157663 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5567  NADH dehydrogenase subunit K  51 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1627  NADH dehydrogenase subunit K  51 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544547  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_801  NADH:quinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)  47.47 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2239  NADH dehydrogenase subunit K  51 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>