More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4623 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4623  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  100 
 
 
104 aa  196  7e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0763865 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2049  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  84 
 
 
101 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0900  NADH dehydrogenase subunit K  85.29 
 
 
102 aa  160  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0252714  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4136  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  88 
 
 
101 aa  158  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1271  NADH dehydrogenase subunit K  85.29 
 
 
102 aa  156  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0495478  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1363  NADH dehydrogenase subunit K  84.31 
 
 
102 aa  155  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1726  NADH dehydrogenase subunit K  82.35 
 
 
102 aa  155  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.700117  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2210  NADH dehydrogenase subunit K  85.29 
 
 
102 aa  154  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.650214  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1877  NADH dehydrogenase subunit K  84.31 
 
 
102 aa  154  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446252  normal  0.260889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4551  NADH dehydrogenase subunit K  84.31 
 
 
102 aa  154  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348577  normal  0.172733 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3216  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  86.27 
 
 
102 aa  154  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4400  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  87 
 
 
101 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0807  NADH dehydrogenase I, K subunit  81.37 
 
 
136 aa  154  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1204  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  87 
 
 
101 aa  153  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1009  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  87 
 
 
101 aa  153  7e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0939643  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1565  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  73.53 
 
 
102 aa  153  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199091  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1075  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  87 
 
 
101 aa  153  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.203782 
 
 
-
 
NC_004310  BR0812  NADH dehydrogenase subunit K  81.37 
 
 
102 aa  151  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.907264  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2995  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  75 
 
 
101 aa  152  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1032  NADH dehydrogenase subunit K  80.39 
 
 
102 aa  152  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2413  NADH dehydrogenase subunit K  80.39 
 
 
102 aa  150  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.122214  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2875  NADH dehydrogenase subunit K  82.18 
 
 
103 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.542064  normal  0.368336 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2584  NADH dehydrogenase subunit K  82.18 
 
 
103 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.322248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2414  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  83 
 
 
103 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0025365  hitchhiker  0.00922504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3288  NADH dehydrogenase subunit K  80.2 
 
 
103 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2290  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  73 
 
 
101 aa  148  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0788  NADH dehydrogenase (quinone), K subunit  77.45 
 
 
102 aa  148  3e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0860266  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1299  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  73 
 
 
101 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162862  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2928  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  79.41 
 
 
102 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1326  NADH dehydrogenase subunit K  81 
 
 
101 aa  144  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.341038  normal  0.0221651 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0757  NADH dehydrogenase subunit K  78 
 
 
101 aa  144  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.588315  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1994  NADH dehydrogenase subunit K  78 
 
 
101 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0298291  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2526  NADH dehydrogenase subunit K  78 
 
 
101 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.313411  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1188  NADH dehydrogenase subunit K  78 
 
 
101 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.288181  normal  0.242913 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2388  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  77.45 
 
 
102 aa  141  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00132006  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3338  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  69.31 
 
 
107 aa  139  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.12599  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2234  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  77 
 
 
101 aa  139  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1413  putative transmembrane NADH dehydrogenase I (chain K) oxidoreductase protein  61.76 
 
 
102 aa  130  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.272363  normal  0.0563536 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5170  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  61.76 
 
 
102 aa  130  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.896952  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1365  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  75.49 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.259286  normal  0.0139863 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2822  NADH dehydrogenase subunit K  78 
 
 
101 aa  128  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.652905  normal  0.0640076 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1511  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  62 
 
 
101 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505168 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0882  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  60.78 
 
 
102 aa  127  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1273  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  59.8 
 
 
102 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.326847 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2052  NADH dehydrogenase subunit K  61 
 
 
101 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2204  NADH dehydrogenase subunit K  61 
 
 
103 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1881  NADH dehydrogenase subunit K  61 
 
 
103 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0967  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  58.82 
 
 
102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0704138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2051  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  58.82 
 
 
102 aa  125  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1434  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  58.82 
 
 
102 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.598892  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1503  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  57.84 
 
 
102 aa  124  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0163297  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0718  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  67 
 
 
101 aa  123  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0553  NADH dehydrogenase I, K subunit  60.61 
 
 
108 aa  122  1e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.719312  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1193  NADH dehydrogenase subunit K  73.53 
 
 
102 aa  123  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3500  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  55.88 
 
 
102 aa  122  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1752  NADH dehydrogenase subunit K  58 
 
 
101 aa  122  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504148  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1152  NADH dehydrogenase subunit K  59 
 
 
101 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1101  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  58.25 
 
 
106 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0959  NADH dehydrogenase subunit K  56.86 
 
 
103 aa  121  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.158616  normal  0.425824 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0971  NADH dehydrogenase subunit K  59.6 
 
 
101 aa  121  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593359  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2803  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  58.82 
 
 
102 aa  121  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.383978  normal  0.173 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0931  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  67 
 
 
103 aa  120  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2555  NADH dehydrogenase subunit K  61 
 
 
101 aa  120  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.485548  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0477  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  58.59 
 
 
108 aa  120  6e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0157234  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3246  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  55.88 
 
 
102 aa  120  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244776  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0996  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  66 
 
 
101 aa  120  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1607  NADH dehydrogenase (ubiquinone), K subunit  60 
 
 
101 aa  119  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0556  NADH-quinone oxidoreductase chain K  60 
 
 
101 aa  119  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1954  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  66 
 
 
101 aa  118  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.287114  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1960  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  64 
 
 
101 aa  117  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.308145  normal  0.0401346 
 
 
-
 
NC_002978  WD0966  NADH dehydrogenase I, K subunit  64.36 
 
 
102 aa  115  3e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0831  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  61.76 
 
 
102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.22951  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3625  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  66 
 
 
100 aa  114  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.068454 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1755  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  63 
 
 
101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5567  NADH dehydrogenase subunit K  62.24 
 
 
101 aa  110  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2263  NADH dehydrogenase subunit K  62.24 
 
 
101 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157663 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1627  NADH dehydrogenase subunit K  62.24 
 
 
101 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2239  NADH dehydrogenase subunit K  62.24 
 
 
101 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150044  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1041  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  59.8 
 
 
102 aa  110  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1999  NADH dehydrogenase subunit K  60 
 
 
101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.211776 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3204  NADH dehydrogenase subunit K  61.22 
 
 
101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00316387  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1353  NADH dehydrogenase subunit K  61.22 
 
 
101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000622565  normal  0.0242296 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1038  NADH dehydrogenase subunit K  60.2 
 
 
101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198172  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1819  NADH dehydrogenase subunit K  60.2 
 
 
101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.667027  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1300  NADH dehydrogenase subunit K  60.2 
 
 
101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.607429  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0727  NADH dehydrogenase subunit K  60.2 
 
 
101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.458993  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1445  NADH dehydrogenase subunit K  60.2 
 
 
101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0423  NADH dehydrogenase subunit K  60.2 
 
 
101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1071  NADH dehydrogenase subunit K  60.2 
 
 
101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1140  NADH dehydrogenase subunit K  60.2 
 
 
101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22812  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2156  NADH dehydrogenase subunit K  60.2 
 
 
101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853972  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1309  NADH dehydrogenase subunit K  60.2 
 
 
101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311292  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2277  NADH dehydrogenase subunit K  60.2 
 
 
101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0937  NADH dehydrogenase subunit K  60 
 
 
101 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142932  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1293  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  54 
 
 
101 aa  104  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2821  NADH dehydrogenase subunit K  58 
 
 
101 aa  101  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0637292  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0250  NADH dehydrogenase subunit K  58 
 
 
101 aa  101  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0279  NADH dehydrogenase subunit K  58 
 
 
101 aa  101  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.425403  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2247  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  65.31 
 
 
106 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000320581 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2620  NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  65.31 
 
 
105 aa  98.6  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>