More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4072 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4072  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  100 
 
 
109 aa  217  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.035212  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5943  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  67.92 
 
 
114 aa  152  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1372  NADH dehydrogenase I chain K  55.67 
 
 
97 aa  118  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00536426  normal  0.982278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3899  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  68.22 
 
 
117 aa  118  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7009  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  66.02 
 
 
105 aa  117  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1039  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  56.12 
 
 
100 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3248  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54.55 
 
 
101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.798847  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0695  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  57.45 
 
 
100 aa  110  8.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1110  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53.54 
 
 
101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1924  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  52.53 
 
 
100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.171281  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0919  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  54.64 
 
 
100 aa  106  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1236  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  57.41 
 
 
106 aa  105  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0711  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.23 
 
 
106 aa  104  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00926088  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0476  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  55.21 
 
 
102 aa  102  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1875  NADH dehydrogenase subunit K  51.58 
 
 
99 aa  100  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1306  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  50 
 
 
103 aa  100  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0477  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  52 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0157234  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0878  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.94 
 
 
100 aa  99.8  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174909  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1540  NADH dehydrogenase subunit K  52.63 
 
 
99 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0449834  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1101  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  48.48 
 
 
106 aa  98.6  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4234  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  57.58 
 
 
100 aa  99  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341359  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0549  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50.53 
 
 
99 aa  98.2  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.924204  normal  0.59827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1570  NADH dehydrogenase subunit K  52.63 
 
 
99 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1594  NADH dehydrogenase subunit K  52.63 
 
 
99 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1511  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.52 
 
 
101 aa  97.4  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505168 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3246  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  48.48 
 
 
102 aa  97.4  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244776  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0553  NADH dehydrogenase I, K subunit  50 
 
 
108 aa  97.4  6e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.719312  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1434  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  49.49 
 
 
102 aa  97.1  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.598892  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2051  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  49.49 
 
 
102 aa  97.1  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7681  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  58.33 
 
 
99 aa  96.7  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1212  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.98 
 
 
106 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0142409  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1881  NADH dehydrogenase subunit K  47.06 
 
 
103 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0882  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50.51 
 
 
102 aa  95.5  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2204  NADH dehydrogenase subunit K  47.06 
 
 
103 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1413  putative transmembrane NADH dehydrogenase I (chain K) oxidoreductase protein  49.49 
 
 
102 aa  95.9  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.272363  normal  0.0563536 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1273  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  50.51 
 
 
102 aa  95.9  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.326847 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4055  NADH dehydrogenase subunit K  53.85 
 
 
105 aa  95.1  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.7005  normal  0.327685 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0967  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  50.51 
 
 
102 aa  95.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0704138 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3128  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  56.7 
 
 
100 aa  94.7  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2052  NADH dehydrogenase subunit K  47.47 
 
 
101 aa  94.4  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0959  NADH dehydrogenase subunit K  47.47 
 
 
103 aa  94.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.158616  normal  0.425824 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4000  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  57.14 
 
 
100 aa  94.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.72795e-16 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1503  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  48.48 
 
 
102 aa  94.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0163297  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3916  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  56.12 
 
 
100 aa  94.4  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1246  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53.54 
 
 
101 aa  94.4  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0581596  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0971  NADH dehydrogenase subunit K  46 
 
 
101 aa  94.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593359  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1293  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  50.53 
 
 
101 aa  94.4  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1152  NADH dehydrogenase subunit K  46.46 
 
 
101 aa  94  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0148  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43.88 
 
 
100 aa  94  6e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000206273  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4491  NADH dehydrogenase subunit K  48.42 
 
 
99 aa  94  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1159  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50 
 
 
99 aa  93.6  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3500  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.46 
 
 
102 aa  93.6  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1607  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.62 
 
 
105 aa  93.6  8e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.267693  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5170  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  49.49 
 
 
102 aa  93.6  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.896952  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0191  NADH dehydrogenase subunit K  42.86 
 
 
101 aa  93.6  8e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13176  NADH dehydrogenase subunit K  50.52 
 
 
99 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0277  NADH dehydrogenase subunit K  54.74 
 
 
99 aa  93.2  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1565  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  45.45 
 
 
102 aa  92  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199091  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1752  NADH dehydrogenase subunit K  46.46 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504148  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1290  F420H2 dehydrogenase subunit K  51.52 
 
 
100 aa  92.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  7.20191e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0671  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)-like protein  55.56 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2803  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  50.51 
 
 
102 aa  91.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.383978  normal  0.173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4453  NADH dehydrogenase subunit K  51.92 
 
 
105 aa  91.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2049  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.47 
 
 
101 aa  92  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0548  NADH dehydrogenase subunit K  55.1 
 
 
99 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.530448  normal  0.623297 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03260  NADH dehydrogenase subunit K  55.21 
 
 
99 aa  91.3  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0348  NADH dehydrogenase I, K subunit  55.1 
 
 
100 aa  90.5  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5063  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54.64 
 
 
99 aa  90.1  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3345  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  57.61 
 
 
100 aa  90.1  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.552125  normal  0.40692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0594  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  52.63 
 
 
98 aa  90.1  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0322  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  50 
 
 
113 aa  89.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1057  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  46.15 
 
 
92 aa  89.7  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.722396  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6672  NADH dehydrogenase subunit K  53.68 
 
 
99 aa  89  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2706  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54.08 
 
 
99 aa  88.6  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01861  NADH dehydrogenase subunit K  49.04 
 
 
106 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3214  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  56.12 
 
 
100 aa  88.6  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1818  NADH dehydrogenase subunit K  38.78 
 
 
102 aa  88.2  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118979  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2995  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  43.43 
 
 
101 aa  87.8  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1346  NADH dehydrogenase subunit K  50.5 
 
 
103 aa  88.2  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.948415  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0984  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  55.21 
 
 
99 aa  87.8  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3385  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54.08 
 
 
100 aa  87.4  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4408  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.58 
 
 
99 aa  87.8  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2685  NADH dehydrogenase subunit K  55.32 
 
 
96 aa  87.4  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0903531  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4548  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  52.04 
 
 
99 aa  87.4  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2555  NADH dehydrogenase subunit K  45.45 
 
 
101 aa  87.4  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.485548  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0291  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  52.13 
 
 
98 aa  87.4  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.834143  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0159  NADH dehydrogenase subunit K  47.12 
 
 
107 aa  87.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6084  NADH dehydrogenase subunit K  54.08 
 
 
99 aa  87  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3744  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43.4 
 
 
110 aa  87  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3216  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  49.49 
 
 
102 aa  87  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2233  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  55.1 
 
 
100 aa  86.7  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315965  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  40.4 
 
 
101 aa  86.7  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0814  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  40.4 
 
 
101 aa  86.7  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_801  NADH:quinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)  40.4 
 
 
101 aa  86.7  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1299  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  43.43 
 
 
101 aa  86.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162862  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0530  NADH dehydrogenase subunit K  53.19 
 
 
99 aa  86.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0900  NADH dehydrogenase subunit K  50.51 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0252714  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01771  NADH dehydrogenase subunit K  46.67 
 
 
106 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2290  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  42.42 
 
 
101 aa  85.9  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1075  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  49.49 
 
 
101 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.203782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>