More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7009 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_7009  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  100 
 
 
105 aa  205  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5943  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  63.46 
 
 
114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4072  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  66.02 
 
 
109 aa  130  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.035212  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1039  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.43 
 
 
100 aa  104  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0919  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  50.96 
 
 
100 aa  100  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13176  NADH dehydrogenase subunit K  54.55 
 
 
99 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1875  NADH dehydrogenase subunit K  50.48 
 
 
99 aa  99  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1236  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  57.69 
 
 
106 aa  98.2  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1540  NADH dehydrogenase subunit K  54 
 
 
99 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0449834  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0549  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  49.52 
 
 
99 aa  98.2  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.924204  normal  0.59827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1570  NADH dehydrogenase subunit K  52.38 
 
 
99 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1594  NADH dehydrogenase subunit K  52.38 
 
 
99 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1372  NADH dehydrogenase I chain K  51.49 
 
 
97 aa  97.1  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00536426  normal  0.982278 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0476  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50.96 
 
 
102 aa  96.7  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1607  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.62 
 
 
105 aa  96.3  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.267693  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1110  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.04 
 
 
101 aa  95.9  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1924  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50 
 
 
100 aa  95.5  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.171281  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1306  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  48.08 
 
 
103 aa  94.7  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1159  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43.81 
 
 
99 aa  92.8  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1212  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.51 
 
 
106 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0142409  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3899  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  60.58 
 
 
117 aa  92.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7681  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  55.77 
 
 
99 aa  91.3  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0671  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)-like protein  51.43 
 
 
156 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4381  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45.71 
 
 
128 aa  91.3  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3248  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45.1 
 
 
101 aa  90.5  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.798847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3812  NADH dehydrogenase subunit K  51.46 
 
 
104 aa  90.1  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5469  NADH dehydrogenase subunit K  51.46 
 
 
104 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4491  NADH dehydrogenase subunit K  47.62 
 
 
99 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5091  NADH dehydrogenase subunit K  50.49 
 
 
104 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3294  NADH dehydrogenase subunit K  47.12 
 
 
104 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0322  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  48.57 
 
 
113 aa  89.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5418  NADH dehydrogenase subunit K  50.49 
 
 
104 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4975  NADH dehydrogenase subunit K  50.49 
 
 
104 aa  88.2  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4993  NADH dehydrogenase subunit K  50.49 
 
 
104 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5384  NADH dehydrogenase subunit K  50.49 
 
 
104 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.60096e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5536  NADH dehydrogenase subunit K  50.49 
 
 
104 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0475445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5414  NADH dehydrogenase subunit K  50.49 
 
 
104 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0984  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  52.88 
 
 
99 aa  87.4  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0277  NADH dehydrogenase subunit K  54.81 
 
 
99 aa  87.8  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03260  NADH dehydrogenase subunit K  53.85 
 
 
99 aa  87.4  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5143  NADH dehydrogenase subunit K  49.51 
 
 
104 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5535  NADH dehydrogenase subunit K  49.51 
 
 
104 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3744  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  44.55 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0695  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.46 
 
 
100 aa  86.3  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4234  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  56.57 
 
 
100 aa  86.3  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341359  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  41.35 
 
 
101 aa  85.5  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4000  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50.96 
 
 
100 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.72795e-16 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_801  NADH:quinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)  41.35 
 
 
101 aa  85.5  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1293  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  44 
 
 
101 aa  85.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6672  NADH dehydrogenase subunit K  52.88 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0711  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39.42 
 
 
106 aa  84.7  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00926088  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3916  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50 
 
 
100 aa  84.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0814  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  39.42 
 
 
101 aa  84.7  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4055  NADH dehydrogenase subunit K  54.46 
 
 
105 aa  84.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.7005  normal  0.327685 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0878  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  42.31 
 
 
100 aa  84  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174909  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1346  NADH dehydrogenase subunit K  48.54 
 
 
103 aa  84  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.948415  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0392  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50.96 
 
 
99 aa  84  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1511  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  44.55 
 
 
101 aa  83.2  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505168 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1246  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.08 
 
 
101 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0581596  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4453  NADH dehydrogenase subunit K  53.47 
 
 
105 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2706  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  49.52 
 
 
99 aa  82.8  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3345  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  54.64 
 
 
100 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.552125  normal  0.40692 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4408  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.92 
 
 
99 aa  82  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5063  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54 
 
 
99 aa  82  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1607  NADH dehydrogenase (ubiquinone), K subunit  44.86 
 
 
101 aa  82  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0548  NADH dehydrogenase subunit K  55.56 
 
 
99 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.530448  normal  0.623297 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0556  NADH-quinone oxidoreductase chain K  44.86 
 
 
101 aa  82  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1284  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.92 
 
 
99 aa  82  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1881  NADH dehydrogenase subunit K  41.9 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2204  NADH dehydrogenase subunit K  41.9 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4548  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.92 
 
 
99 aa  81.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1273  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  42.86 
 
 
102 aa  81.6  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.326847 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3128  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54.55 
 
 
100 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0291  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  49.51 
 
 
98 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.834143  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0882  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  42.86 
 
 
102 aa  81.3  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1101  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  41.9 
 
 
106 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0348  NADH dehydrogenase I, K subunit  50.49 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2685  NADH dehydrogenase subunit K  55 
 
 
96 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0903531  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0530  NADH dehydrogenase subunit K  53.85 
 
 
99 aa  80.5  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0967  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  42.86 
 
 
102 aa  80.1  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0704138 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2803  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  43.81 
 
 
102 aa  80.1  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.383978  normal  0.173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0594  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  52.94 
 
 
98 aa  80.1  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2052  NADH dehydrogenase subunit K  40.95 
 
 
101 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07480  NADH dehydrogenase subunit K  50.48 
 
 
99 aa  79.7  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0148  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39.05 
 
 
100 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000206273  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2826  NADH-quinone oxidoreductase chain K  44.76 
 
 
101 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2695  NADH-quinone oxidoreductase chain K  44.76 
 
 
101 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1152  NADH dehydrogenase subunit K  40 
 
 
101 aa  80.1  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1503  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  42.86 
 
 
102 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0163297  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5170  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  42.86 
 
 
102 aa  80.1  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.896952  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2039  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  42.57 
 
 
105 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0098763  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0971  NADH dehydrogenase subunit K  40.95 
 
 
101 aa  78.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593359  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01751  NADH dehydrogenase subunit K  46.15 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1413  putative transmembrane NADH dehydrogenase I (chain K) oxidoreductase protein  41.9 
 
 
102 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.272363  normal  0.0563536 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01771  NADH dehydrogenase subunit K  46.15 
 
 
106 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01741  NADH dehydrogenase subunit K  46.15 
 
 
107 aa  78.2  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.359361  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2555  NADH dehydrogenase subunit K  44 
 
 
101 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.485548  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6084  NADH dehydrogenase subunit K  53.4 
 
 
99 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2051  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  42.72 
 
 
102 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3246  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  41.9 
 
 
102 aa  78.2  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244776  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>