More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_07480 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_07480  NADH dehydrogenase subunit K  100 
 
 
99 aa  189  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0549  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  81.82 
 
 
99 aa  164  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.924204  normal  0.59827 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1540  NADH dehydrogenase subunit K  74.75 
 
 
99 aa  150  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0449834  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1570  NADH dehydrogenase subunit K  74.75 
 
 
99 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1594  NADH dehydrogenase subunit K  74.75 
 
 
99 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1875  NADH dehydrogenase subunit K  76.77 
 
 
99 aa  149  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13176  NADH dehydrogenase subunit K  76.53 
 
 
99 aa  148  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0479  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  84.69 
 
 
99 aa  146  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.476668  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4491  NADH dehydrogenase subunit K  73.74 
 
 
99 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2706  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  80.81 
 
 
99 aa  141  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0392  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  80.61 
 
 
99 aa  138  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5063  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  80.81 
 
 
99 aa  137  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7681  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  79.59 
 
 
99 aa  136  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0291  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  83.33 
 
 
98 aa  136  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.834143  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0594  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  82.11 
 
 
98 aa  134  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0548  NADH dehydrogenase subunit K  76.53 
 
 
99 aa  131  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.530448  normal  0.623297 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2685  NADH dehydrogenase subunit K  80 
 
 
96 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0903531  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4408  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  76.53 
 
 
99 aa  130  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6084  NADH dehydrogenase subunit K  77.55 
 
 
99 aa  130  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3219  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  78.79 
 
 
99 aa  125  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.893545  normal  0.177018 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4453  NADH dehydrogenase subunit K  78.49 
 
 
105 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0277  NADH dehydrogenase subunit K  80.65 
 
 
99 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4055  NADH dehydrogenase subunit K  76.34 
 
 
105 aa  122  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.7005  normal  0.327685 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03260  NADH dehydrogenase subunit K  74.49 
 
 
99 aa  122  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0530  NADH dehydrogenase subunit K  73.47 
 
 
99 aa  123  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4548  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  73.47 
 
 
99 aa  121  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6672  NADH dehydrogenase subunit K  75.51 
 
 
99 aa  121  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1284  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  71.43 
 
 
99 aa  117  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1039  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  62.5 
 
 
100 aa  117  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0984  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  71.43 
 
 
99 aa  116  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1159  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  57.58 
 
 
99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0476  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  58.76 
 
 
102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0919  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  58.51 
 
 
100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3178  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  71.76 
 
 
99 aa  105  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1372  NADH dehydrogenase I chain K  55.21 
 
 
97 aa  105  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00536426  normal  0.982278 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1607  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45.19 
 
 
105 aa  102  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.267693  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1306  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  54.08 
 
 
103 aa  101  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5943  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  57.14 
 
 
114 aa  101  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4072  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50.52 
 
 
109 aa  99  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.035212  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3916  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  59.38 
 
 
100 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4000  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  59.38 
 
 
100 aa  98.2  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.72795e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3128  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  58.76 
 
 
100 aa  97.8  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4234  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  55.21 
 
 
100 aa  97.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341359  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1293  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  52.13 
 
 
101 aa  96.3  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1236  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  59.18 
 
 
106 aa  94  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1212  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.55 
 
 
106 aa  93.6  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0142409  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1867  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  52.13 
 
 
96 aa  92.8  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.937168  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3744  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.15 
 
 
110 aa  92.8  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0322  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  57.45 
 
 
113 aa  92.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3214  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  56.99 
 
 
100 aa  91.3  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1881  NADH dehydrogenase subunit K  49.49 
 
 
103 aa  90.5  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2204  NADH dehydrogenase subunit K  49.49 
 
 
103 aa  90.5  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2052  NADH dehydrogenase subunit K  48.48 
 
 
101 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0348  NADH dehydrogenase I, K subunit  52.08 
 
 
100 aa  89  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0971  NADH dehydrogenase subunit K  47.47 
 
 
101 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593359  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2555  NADH dehydrogenase subunit K  49.48 
 
 
101 aa  89.4  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.485548  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1752  NADH dehydrogenase subunit K  45.45 
 
 
101 aa  89  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504148  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1246  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.98 
 
 
101 aa  88.6  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0581596  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1101  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  50 
 
 
106 aa  88.2  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1152  NADH dehydrogenase subunit K  46.46 
 
 
101 aa  88.2  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1511  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.42 
 
 
101 aa  88.2  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0671  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)-like protein  55.56 
 
 
156 aa  88.2  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1273  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  52.58 
 
 
97 aa  87.4  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1413  putative transmembrane NADH dehydrogenase I (chain K) oxidoreductase protein  47.42 
 
 
102 aa  87.4  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.272363  normal  0.0563536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0959  NADH dehydrogenase subunit K  45.45 
 
 
103 aa  87.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.158616  normal  0.425824 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3248  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.14 
 
 
101 aa  87.4  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.798847  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0695  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  56.96 
 
 
100 aa  87  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2051  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  45.36 
 
 
102 aa  87  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0996  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  49.49 
 
 
101 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3629  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43.88 
 
 
100 aa  86.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2233  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  58.95 
 
 
100 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315965  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3345  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  48.96 
 
 
100 aa  86.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.552125  normal  0.40692 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2928  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45.45 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5170  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45.45 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.896952  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1110  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.16 
 
 
101 aa  85.5  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3338  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.12599  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2995  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  47 
 
 
101 aa  85.1  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0373  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  57.58 
 
 
100 aa  85.1  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4381  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.08 
 
 
128 aa  84.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1503  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  44.44 
 
 
102 aa  84.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0163297  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0882  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  44.44 
 
 
102 aa  84.3  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1273  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  44.44 
 
 
102 aa  84.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.326847 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2803  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  45.45 
 
 
102 aa  84.3  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.383978  normal  0.173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1032  NADH dehydrogenase subunit K  50.52 
 
 
102 aa  84.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0470  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.58 
 
 
118 aa  84  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.144201 
 
 
-
 
NC_004310  BR0812  NADH dehydrogenase subunit K  49.49 
 
 
102 aa  84  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.907264  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0967  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  44.44 
 
 
102 aa  84  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0704138 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1954  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.46 
 
 
101 aa  83.6  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.287114  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2388  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  44.9 
 
 
102 aa  83.6  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00132006  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2413  NADH dehydrogenase subunit K  48.48 
 
 
102 aa  82.8  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.122214  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0148  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.11 
 
 
100 aa  82.8  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000206273  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0807  NADH dehydrogenase I, K subunit  50.52 
 
 
136 aa  82.8  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1353  NADH dehydrogenase subunit K  48.48 
 
 
101 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000622565  normal  0.0242296 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3246  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  44.44 
 
 
102 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244776  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3204  NADH dehydrogenase subunit K  48.48 
 
 
101 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00316387  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1999  NADH dehydrogenase subunit K  48.48 
 
 
101 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.211776 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2049  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  42.42 
 
 
101 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3385  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  56.84 
 
 
100 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1445  NADH dehydrogenase subunit K  48.48 
 
 
101 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2156  NADH dehydrogenase subunit K  48.48 
 
 
101 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853972  normal  0.650978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>