More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1236 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1236  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  100 
 
 
106 aa  204  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5943  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  60.95 
 
 
114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1372  NADH dehydrogenase I chain K  63.54 
 
 
97 aa  124  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00536426  normal  0.982278 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4072  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  57.41 
 
 
109 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.035212  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0549  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  60 
 
 
99 aa  110  7.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.924204  normal  0.59827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1039  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  56.38 
 
 
100 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13176  NADH dehydrogenase subunit K  55.79 
 
 
99 aa  105  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1540  NADH dehydrogenase subunit K  55.79 
 
 
99 aa  104  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0449834  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1594  NADH dehydrogenase subunit K  55.79 
 
 
99 aa  103  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1101  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  54 
 
 
106 aa  103  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1570  NADH dehydrogenase subunit K  55.79 
 
 
99 aa  103  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2204  NADH dehydrogenase subunit K  53.4 
 
 
103 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1881  NADH dehydrogenase subunit K  53.4 
 
 
103 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3248  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.46 
 
 
101 aa  102  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.798847  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1875  NADH dehydrogenase subunit K  55.79 
 
 
99 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1159  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.06 
 
 
99 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0959  NADH dehydrogenase subunit K  51.49 
 
 
103 aa  101  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.158616  normal  0.425824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7681  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  62.11 
 
 
99 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2052  NADH dehydrogenase subunit K  53.47 
 
 
101 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2555  NADH dehydrogenase subunit K  54.46 
 
 
101 aa  101  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.485548  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2051  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  51.49 
 
 
102 aa  100  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0476  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54.17 
 
 
102 aa  100  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1110  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45.45 
 
 
101 aa  100  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1152  NADH dehydrogenase subunit K  54 
 
 
101 aa  100  8e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0695  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  49.49 
 
 
100 aa  99.8  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1212  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50.49 
 
 
106 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0142409  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0919  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  52.13 
 
 
100 aa  99  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4491  NADH dehydrogenase subunit K  53.93 
 
 
99 aa  99  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1511  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53.47 
 
 
101 aa  97.8  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505168 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7009  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  57.69 
 
 
105 aa  97.4  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1413  putative transmembrane NADH dehydrogenase I (chain K) oxidoreductase protein  54.46 
 
 
102 aa  97.1  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.272363  normal  0.0563536 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1752  NADH dehydrogenase subunit K  50.5 
 
 
101 aa  96.7  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504148  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0971  NADH dehydrogenase subunit K  50 
 
 
101 aa  96.3  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593359  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1818  NADH dehydrogenase subunit K  44 
 
 
102 aa  96.3  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118979  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2995  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  50 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0671  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)-like protein  51.11 
 
 
156 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1565  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  47.52 
 
 
102 aa  95.9  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199091  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2290  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  50.5 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0392  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  57.89 
 
 
99 aa  95.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3629  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50.54 
 
 
100 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3812  NADH dehydrogenase subunit K  48.08 
 
 
104 aa  95.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5170  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  55.21 
 
 
102 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.896952  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0711  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  42.86 
 
 
106 aa  94.7  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00926088  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1924  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.94 
 
 
100 aa  94.7  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.171281  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3246  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  55.21 
 
 
102 aa  94.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244776  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1503  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  54.17 
 
 
102 aa  94  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0163297  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3338  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  49.51 
 
 
107 aa  94  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.12599  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1273  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  54.17 
 
 
102 aa  94  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.326847 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0548  NADH dehydrogenase subunit K  58.51 
 
 
99 aa  93.6  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.530448  normal  0.623297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3500  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  52.08 
 
 
102 aa  92.8  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5091  NADH dehydrogenase subunit K  47.12 
 
 
104 aa  92.8  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1434  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  53.12 
 
 
102 aa  92.8  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.598892  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2049  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48 
 
 
101 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0148  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.47 
 
 
100 aa  92.8  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000206273  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1306  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  48 
 
 
103 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0882  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54.17 
 
 
102 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5063  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  60.64 
 
 
99 aa  92.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2803  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  54.17 
 
 
102 aa  92  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.383978  normal  0.173 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0479  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  56.7 
 
 
99 aa  92.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.476668  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0967  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  54.17 
 
 
102 aa  92.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0704138 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3216  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53 
 
 
102 aa  92.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1326  NADH dehydrogenase subunit K  52.48 
 
 
101 aa  92  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.341038  normal  0.0221651 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1920  NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  46.39 
 
 
98 aa  91.7  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00149289  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07480  NADH dehydrogenase subunit K  59.18 
 
 
99 aa  91.7  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3294  NADH dehydrogenase subunit K  45.63 
 
 
104 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1740  NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  46.39 
 
 
98 aa  91.3  4e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2263  NADH dehydrogenase subunit K  54.08 
 
 
101 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157663 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5567  NADH dehydrogenase subunit K  54.08 
 
 
101 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1554  NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  46.39 
 
 
98 aa  91.3  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000262612  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1627  NADH dehydrogenase subunit K  54.08 
 
 
101 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2239  NADH dehydrogenase subunit K  54.08 
 
 
101 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150044  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1057  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  45.56 
 
 
92 aa  91.3  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.722396  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6084  NADH dehydrogenase subunit K  59.57 
 
 
99 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0322  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  50.54 
 
 
113 aa  90.5  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1960  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  51.49 
 
 
101 aa  90.5  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.308145  normal  0.0401346 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5143  NADH dehydrogenase subunit K  49.04 
 
 
104 aa  90.1  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5535  NADH dehydrogenase subunit K  49.04 
 
 
104 aa  90.1  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1999  NADH dehydrogenase subunit K  52 
 
 
101 aa  90.5  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.211776 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4381  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.39 
 
 
128 aa  90.1  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4000  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  56.12 
 
 
100 aa  90.1  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.72795e-16 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3204  NADH dehydrogenase subunit K  53.06 
 
 
101 aa  90.1  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00316387  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1353  NADH dehydrogenase subunit K  53.06 
 
 
101 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000622565  normal  0.0242296 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5469  NADH dehydrogenase subunit K  49.04 
 
 
104 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0423  NADH dehydrogenase subunit K  53.06 
 
 
101 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1658  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46 
 
 
100 aa  89.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.708964  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1038  NADH dehydrogenase subunit K  53.06 
 
 
101 aa  90.1  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198172  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1819  NADH dehydrogenase subunit K  53.06 
 
 
101 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.667027  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3916  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  56.12 
 
 
100 aa  89.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1445  NADH dehydrogenase subunit K  53.06 
 
 
101 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0727  NADH dehydrogenase subunit K  53.06 
 
 
101 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.458993  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1071  NADH dehydrogenase subunit K  53.06 
 
 
101 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1309  NADH dehydrogenase subunit K  53.06 
 
 
101 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311292  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2156  NADH dehydrogenase subunit K  53.06 
 
 
101 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853972  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1140  NADH dehydrogenase subunit K  53.06 
 
 
101 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22812  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0757  NADH dehydrogenase subunit K  53.47 
 
 
101 aa  89.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.588315  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1032  NADH dehydrogenase subunit K  53.47 
 
 
102 aa  89.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1300  NADH dehydrogenase subunit K  53.06 
 
 
101 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.607429  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2277  NADH dehydrogenase subunit K  53.06 
 
 
101 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2685  NADH dehydrogenase subunit K  59.57 
 
 
96 aa  89  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0903531  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0807  NADH dehydrogenase I, K subunit  53.47 
 
 
136 aa  89.4  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>