More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1403 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1403  NADH dehydrogenase subunit K  100 
 
 
100 aa  195  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186448  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2541  NADH dehydrogenase subunit K  97 
 
 
100 aa  188  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1501  NADH dehydrogenase subunit K  95 
 
 
100 aa  186  9e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2763  NADH dehydrogenase subunit K  95 
 
 
100 aa  186  9e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.369555  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3299  NADH dehydrogenase subunit K  92 
 
 
100 aa  185  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.347485  normal  0.702847 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1807  NADH dehydrogenase subunit K  93 
 
 
100 aa  182  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.637688 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1463  NADH dehydrogenase subunit K  93 
 
 
100 aa  182  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1569  NADH dehydrogenase subunit K  93 
 
 
100 aa  182  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02204  NADH dehydrogenase subunit K  92 
 
 
100 aa  180  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1378  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  92 
 
 
100 aa  180  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.110911  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2433  NADH dehydrogenase subunit K  92 
 
 
100 aa  180  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2572  NADH dehydrogenase subunit K  92 
 
 
100 aa  180  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1373  NADH dehydrogenase subunit K  92 
 
 
100 aa  180  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.25258 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2428  NADH dehydrogenase subunit K  92 
 
 
100 aa  180  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02164  hypothetical protein  92 
 
 
100 aa  180  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.971424  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3418  NADH dehydrogenase subunit K  92 
 
 
100 aa  180  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2655  NADH dehydrogenase subunit K  91 
 
 
100 aa  179  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2823  NADH dehydrogenase subunit K  91 
 
 
100 aa  179  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167717  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2547  NADH dehydrogenase subunit K  91 
 
 
100 aa  177  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2458  NADH dehydrogenase subunit K  91 
 
 
100 aa  177  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2503  NADH dehydrogenase subunit K  91 
 
 
100 aa  177  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2558  NADH dehydrogenase subunit K  91 
 
 
100 aa  177  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668631  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2665  NADH dehydrogenase subunit K  91 
 
 
100 aa  177  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29890  NADH dehydrogenase subunit K  74.75 
 
 
102 aa  154  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0682293  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2560  NADH dehydrogenase subunit K  74.75 
 
 
102 aa  154  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3206  NADH dehydrogenase subunit K  74.75 
 
 
102 aa  152  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00833679  normal  0.168152 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2421  NADH dehydrogenase subunit K  73.74 
 
 
102 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.141986 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3374  NADH dehydrogenase I, K subunit  73.74 
 
 
102 aa  150  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3123  NADH dehydrogenase subunit K  70.71 
 
 
102 aa  148  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.714884  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4128  NADH dehydrogenase subunit K  72.73 
 
 
102 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.816541  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1737  NADH dehydrogenase subunit K  72.73 
 
 
102 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0907851  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3612  NADH dehydrogenase subunit K  70.71 
 
 
102 aa  147  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3700  NADH dehydrogenase subunit K  72.73 
 
 
102 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.695488  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1864  NADH dehydrogenase subunit K  71.72 
 
 
102 aa  146  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0919453 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28530  NADH dehydrogenase subunit K  70.71 
 
 
102 aa  145  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146402  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1012  NADH dehydrogenase I, K subunit  75.76 
 
 
102 aa  142  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1690  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  62.63 
 
 
124 aa  135  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1350  NADH dehydrogenase I, K subunit  63.64 
 
 
102 aa  135  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0372  NADH-quinone oxidoreductase, chain K  73.74 
 
 
100 aa  134  5e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0593  NADH dehydrogenase I, K subunit  63 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0495543  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0582  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  63 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0916912  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3816  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53.26 
 
 
102 aa  114  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102397  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1022  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  66.67 
 
 
115 aa  113  8.999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1111  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  58.75 
 
 
102 aa  102  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.383646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0321  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  52.48 
 
 
102 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1118  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  60.61 
 
 
103 aa  100  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2869  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47 
 
 
100 aa  100  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.680399  normal  0.0281081 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0167  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  46.53 
 
 
102 aa  92.8  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1356  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  49.46 
 
 
102 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156431  normal  0.258523 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4062  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  45.16 
 
 
102 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.078452  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1335  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  46.24 
 
 
102 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0191  NADH dehydrogenase subunit K  40.4 
 
 
101 aa  86.3  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1511  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43.56 
 
 
101 aa  85.5  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505168 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0152  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  44 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0170  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  44 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.840543  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0556  NADH-quinone oxidoreductase chain K  41.58 
 
 
101 aa  85.1  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1607  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43.27 
 
 
105 aa  85.1  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.267693  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1607  NADH dehydrogenase (ubiquinone), K subunit  41.58 
 
 
101 aa  85.1  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0213  NADH dehydrogenase I chain K  47 
 
 
101 aa  84.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0878  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37 
 
 
100 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174909  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3629  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38 
 
 
100 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1039  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4491  NADH dehydrogenase subunit K  41.3 
 
 
99 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1818  NADH dehydrogenase subunit K  36.36 
 
 
102 aa  80.1  0.000000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118979  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0919  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  36 
 
 
100 aa  80.1  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1658  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39 
 
 
100 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.708964  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1306  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  35.71 
 
 
103 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1570  NADH dehydrogenase subunit K  40.22 
 
 
99 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1540  NADH dehydrogenase subunit K  40.22 
 
 
99 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0449834  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1594  NADH dehydrogenase subunit K  40.22 
 
 
99 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0711  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43.88 
 
 
106 aa  79.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00926088  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0476  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38.61 
 
 
102 aa  79  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3294  NADH dehydrogenase subunit K  44 
 
 
104 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0206  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  44.21 
 
 
102 aa  78.2  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.370737  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1413  putative transmembrane NADH dehydrogenase I (chain K) oxidoreductase protein  42 
 
 
102 aa  78.2  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.272363  normal  0.0563536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1159  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.56 
 
 
99 aa  78.2  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0148  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000206273  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4734  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.24 
 
 
102 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0754034  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1212  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38.14 
 
 
106 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0142409  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1875  NADH dehydrogenase subunit K  39.13 
 
 
99 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1057  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  41.76 
 
 
92 aa  77  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.722396  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1152  NADH dehydrogenase subunit K  36.63 
 
 
101 aa  76.6  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2052  NADH dehydrogenase subunit K  37.62 
 
 
101 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1881  NADH dehydrogenase subunit K  38 
 
 
103 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0814  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  38.38 
 
 
101 aa  75.5  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2204  NADH dehydrogenase subunit K  38 
 
 
103 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1752  NADH dehydrogenase subunit K  36.63 
 
 
101 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504148  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1924  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39.39 
 
 
100 aa  75.1  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.171281  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2995  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  38.61 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3432  NADH dehydrogenase I, K subunit  44.55 
 
 
102 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.298613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0971  NADH dehydrogenase subunit K  38 
 
 
101 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593359  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3500  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38 
 
 
102 aa  74.7  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0549  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39.78 
 
 
99 aa  74.7  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.924204  normal  0.59827 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3744  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38.38 
 
 
110 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13176  NADH dehydrogenase subunit K  34 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4072  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.65 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.035212  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0996  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43.56 
 
 
101 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4408  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  40.43 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3812  NADH dehydrogenase subunit K  41.58 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1503  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  37 
 
 
102 aa  72.4  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0163297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>