More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0152 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0152  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  100 
 
 
102 aa  203  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0170  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  99.02 
 
 
102 aa  202  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.840543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0167  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  72.55 
 
 
102 aa  155  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0321  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  70.59 
 
 
102 aa  152  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3432  NADH dehydrogenase I, K subunit  69.61 
 
 
102 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.298613  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02204  NADH dehydrogenase subunit K  47 
 
 
100 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1378  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47 
 
 
100 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.110911  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2558  NADH dehydrogenase subunit K  47 
 
 
100 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668631  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02164  hypothetical protein  47 
 
 
100 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.971424  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2547  NADH dehydrogenase subunit K  47 
 
 
100 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2458  NADH dehydrogenase subunit K  47 
 
 
100 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2665  NADH dehydrogenase subunit K  47 
 
 
100 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2433  NADH dehydrogenase subunit K  47 
 
 
100 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2428  NADH dehydrogenase subunit K  47 
 
 
100 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1373  NADH dehydrogenase subunit K  47 
 
 
100 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.25258 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2503  NADH dehydrogenase subunit K  47 
 
 
100 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3418  NADH dehydrogenase subunit K  47 
 
 
100 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2572  NADH dehydrogenase subunit K  47 
 
 
100 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2655  NADH dehydrogenase subunit K  46 
 
 
100 aa  91.7  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2823  NADH dehydrogenase subunit K  46 
 
 
100 aa  90.9  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167717  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0213  NADH dehydrogenase I chain K  50.98 
 
 
101 aa  90.1  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3816  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46 
 
 
102 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102397  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1569  NADH dehydrogenase subunit K  44 
 
 
100 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1807  NADH dehydrogenase subunit K  44 
 
 
100 aa  86.7  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.637688 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2541  NADH dehydrogenase subunit K  44 
 
 
100 aa  86.3  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1463  NADH dehydrogenase subunit K  44 
 
 
100 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1403  NADH dehydrogenase subunit K  44 
 
 
100 aa  85.5  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186448  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1350  NADH dehydrogenase I, K subunit  41.58 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3299  NADH dehydrogenase subunit K  41 
 
 
100 aa  83.6  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.347485  normal  0.702847 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2763  NADH dehydrogenase subunit K  42 
 
 
100 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.369555  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1501  NADH dehydrogenase subunit K  42 
 
 
100 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2560  NADH dehydrogenase subunit K  40.59 
 
 
102 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29890  NADH dehydrogenase subunit K  40.59 
 
 
102 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0682293  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3123  NADH dehydrogenase subunit K  40.59 
 
 
102 aa  78.2  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.714884  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1690  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  40.59 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1607  NADH dehydrogenase (ubiquinone), K subunit  37 
 
 
101 aa  76.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0556  NADH-quinone oxidoreductase chain K  37 
 
 
101 aa  76.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3206  NADH dehydrogenase subunit K  38.61 
 
 
102 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00833679  normal  0.168152 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2421  NADH dehydrogenase subunit K  39.6 
 
 
102 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.141986 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1818  NADH dehydrogenase subunit K  35.29 
 
 
102 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118979  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1938  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  45.54 
 
 
114 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.499668 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28530  NADH dehydrogenase subunit K  36.63 
 
 
102 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3374  NADH dehydrogenase I, K subunit  37.62 
 
 
102 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1881  NADH dehydrogenase subunit K  38.61 
 
 
103 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2204  NADH dehydrogenase subunit K  38.61 
 
 
103 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4128  NADH dehydrogenase subunit K  38.61 
 
 
102 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.816541  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3700  NADH dehydrogenase subunit K  38.61 
 
 
102 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.695488  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1737  NADH dehydrogenase subunit K  38.61 
 
 
102 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0907851  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3612  NADH dehydrogenase subunit K  36.63 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0967  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  38.24 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0704138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2051  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  38.24 
 
 
102 aa  72  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2803  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  37.25 
 
 
102 aa  72  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.383978  normal  0.173 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5170  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.25 
 
 
102 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.896952  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1273  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  37.25 
 
 
102 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.326847 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1864  NADH dehydrogenase subunit K  37.62 
 
 
102 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0919453 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0882  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.25 
 
 
102 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1101  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  38 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2388  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.27 
 
 
102 aa  70.9  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00132006  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2826  NADH-quinone oxidoreductase chain K  36 
 
 
101 aa  71.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2695  NADH-quinone oxidoreductase chain K  36 
 
 
101 aa  71.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0477  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  38.32 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.235495  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1012  NADH dehydrogenase I, K subunit  39 
 
 
102 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0148  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39 
 
 
100 aa  70.9  0.000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000206273  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0476  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.62 
 
 
102 aa  70.5  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3500  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  35.29 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2052  NADH dehydrogenase subunit K  37 
 
 
101 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1152  NADH dehydrogenase subunit K  36 
 
 
101 aa  69.7  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1565  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  36.27 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199091  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2869  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.68 
 
 
100 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.680399  normal  0.0281081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5943  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39 
 
 
114 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1413  putative transmembrane NADH dehydrogenase I (chain K) oxidoreductase protein  37.25 
 
 
102 aa  68.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.272363  normal  0.0563536 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1022  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  48.68 
 
 
115 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1503  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  35.29 
 
 
102 aa  68.2  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0163297  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0549  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  41.49 
 
 
99 aa  67.8  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.924204  normal  0.59827 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0996  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39 
 
 
101 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4072  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.36 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.035212  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0959  NADH dehydrogenase subunit K  35.29 
 
 
103 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.158616  normal  0.425824 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0971  NADH dehydrogenase subunit K  36.36 
 
 
101 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593359  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1511  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36 
 
 
101 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505168 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1752  NADH dehydrogenase subunit K  36 
 
 
101 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504148  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2555  NADH dehydrogenase subunit K  35 
 
 
101 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.485548  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1041  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  37.25 
 
 
102 aa  65.5  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0831  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.25 
 
 
102 aa  65.5  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.22951  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3629  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  34 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1372  NADH dehydrogenase I chain K  41.05 
 
 
97 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00536426  normal  0.982278 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3216  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38.24 
 
 
102 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3294  NADH dehydrogenase subunit K  41.75 
 
 
104 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1954  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  34 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.287114  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2548  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.02 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.252731 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0695  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.56 
 
 
100 aa  64.7  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1212  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.89 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0142409  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1960  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  38 
 
 
101 aa  64.3  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.308145  normal  0.0401346 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2234  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  36 
 
 
101 aa  64.3  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2995  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  34 
 
 
101 aa  63.9  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1118  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  44.55 
 
 
103 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1111  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  35.53 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.383646  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3246  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  34.31 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244776  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0919  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  32.32 
 
 
100 aa  63.9  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3338  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  34.65 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.12599  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1434  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  34.31 
 
 
102 aa  63.5  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.598892  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>