More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2095 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2095  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  100 
 
 
108 aa  212  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2996  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  99.07 
 
 
108 aa  210  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4987  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  73.33 
 
 
105 aa  148  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.666678  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1624  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  74.29 
 
 
105 aa  137  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0516518 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3294  NADH dehydrogenase subunit K  63.73 
 
 
104 aa  120  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1212  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  57.73 
 
 
106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0142409  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5469  NADH dehydrogenase subunit K  63.46 
 
 
104 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5091  NADH dehydrogenase subunit K  61.54 
 
 
104 aa  111  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2039  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  53.61 
 
 
105 aa  110  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0098763  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3812  NADH dehydrogenase subunit K  60.58 
 
 
104 aa  110  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4993  NADH dehydrogenase subunit K  62.5 
 
 
104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5418  NADH dehydrogenase subunit K  61.54 
 
 
104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4975  NADH dehydrogenase subunit K  61.54 
 
 
104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5384  NADH dehydrogenase subunit K  61.54 
 
 
104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.60096e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5536  NADH dehydrogenase subunit K  61.54 
 
 
104 aa  107  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0475445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5414  NADH dehydrogenase subunit K  61.54 
 
 
104 aa  107  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1658  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.49 
 
 
100 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.708964  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5143  NADH dehydrogenase subunit K  60.58 
 
 
104 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5535  NADH dehydrogenase subunit K  60.58 
 
 
104 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1346  NADH dehydrogenase subunit K  55.45 
 
 
103 aa  106  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.948415  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0814  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  53.06 
 
 
101 aa  105  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0477  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  45.1 
 
 
104 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.235495  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0159  NADH dehydrogenase subunit K  51.96 
 
 
107 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01861  NADH dehydrogenase subunit K  51.96 
 
 
106 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01771  NADH dehydrogenase subunit K  50.98 
 
 
106 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01741  NADH dehydrogenase subunit K  51.46 
 
 
107 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.359361  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01751  NADH dehydrogenase subunit K  50.98 
 
 
107 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_801  NADH:quinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)  52.04 
 
 
101 aa  100  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  52.04 
 
 
101 aa  100  7e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26871  NADH dehydrogenase subunit K  52.34 
 
 
109 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3744  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50.46 
 
 
110 aa  100  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0206  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  49.49 
 
 
102 aa  100  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.370737  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0984  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  58 
 
 
102 aa  97.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1306  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  45.19 
 
 
103 aa  96.7  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0878  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.52 
 
 
100 aa  96.3  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174909  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1511  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50 
 
 
101 aa  96.3  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0671  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)-like protein  52.87 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1152  NADH dehydrogenase subunit K  47.06 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2555  NADH dehydrogenase subunit K  48.04 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.485548  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1413  putative transmembrane NADH dehydrogenase I (chain K) oxidoreductase protein  47.57 
 
 
102 aa  95.9  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.272363  normal  0.0563536 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5943  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  42.06 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2526  NADH dehydrogenase subunit K  51 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1039  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.51 
 
 
100 aa  95.5  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1565  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  46.08 
 
 
102 aa  94.7  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199091  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1293  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  53.19 
 
 
101 aa  95.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0126  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  50.53 
 
 
101 aa  94.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125999  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2204  NADH dehydrogenase subunit K  46.15 
 
 
103 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1881  NADH dehydrogenase subunit K  46.15 
 
 
103 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02301  NADH dehydrogenase subunit K  51 
 
 
109 aa  94  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1524  NADH dehydrogenase subunit K  51 
 
 
109 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1101  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  46.08 
 
 
106 aa  94  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0283  NADH dehydrogenase subunit K  49.07 
 
 
109 aa  93.6  7e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2051  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  47.57 
 
 
102 aa  93.6  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2052  NADH dehydrogenase subunit K  47.06 
 
 
101 aa  93.6  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2409  NADH dehydrogenase subunit K  49.07 
 
 
109 aa  93.6  9e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1752  NADH dehydrogenase subunit K  47.06 
 
 
101 aa  93.2  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504148  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1057  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  52.17 
 
 
92 aa  92.8  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.722396  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0711  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50.54 
 
 
106 aa  92.4  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00926088  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0322  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  46.32 
 
 
113 aa  92.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1042  NADH dehydrogenase subunit K  53 
 
 
103 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.514853  hitchhiker  0.00000310035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1013  NADH dehydrogenase subunit K  53 
 
 
103 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1607  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43.27 
 
 
105 aa  90.9  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.267693  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2548  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  42 
 
 
103 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.252731 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0919  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  47 
 
 
100 aa  90.5  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3629  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  44.55 
 
 
100 aa  90.1  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3246  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  46.08 
 
 
102 aa  90.1  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244776  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2995  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  48.04 
 
 
101 aa  89.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0959  NADH dehydrogenase subunit K  45.1 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.158616  normal  0.425824 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0971  NADH dehydrogenase subunit K  44.55 
 
 
101 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593359  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0476  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.46 
 
 
102 aa  89  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1159  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.47 
 
 
99 aa  88.6  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4039  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54 
 
 
103 aa  89  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000963469 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1290  F420H2 dehydrogenase subunit K  48 
 
 
100 aa  89  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  7.20191e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1924  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43 
 
 
100 aa  88.6  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.171281  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3406  NADH dehydrogenase subunit K  62.24 
 
 
101 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3500  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45.1 
 
 
102 aa  88.2  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2049  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.06 
 
 
101 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5170  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45.1 
 
 
102 aa  87  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.896952  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3625  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  51.96 
 
 
100 aa  87  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.068454 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1434  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  44.12 
 
 
102 aa  86.7  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.598892  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1503  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  44.12 
 
 
102 aa  86.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0163297  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0882  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43.14 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0250  NADH dehydrogenase subunit K  49.02 
 
 
101 aa  85.9  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0279  NADH dehydrogenase subunit K  49.02 
 
 
101 aa  85.9  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.425403  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0556  NADH-quinone oxidoreductase chain K  44.12 
 
 
101 aa  85.9  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1607  NADH dehydrogenase (ubiquinone), K subunit  44.12 
 
 
101 aa  85.9  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3216  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.46 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2290  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  44.12 
 
 
101 aa  85.1  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1326  NADH dehydrogenase subunit K  51.96 
 
 
101 aa  85.1  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.341038  normal  0.0221651 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1273  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  42.16 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.326847 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2526  NADH dehydrogenase subunit K  50.98 
 
 
101 aa  84.3  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.313411  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1994  NADH dehydrogenase subunit K  50.98 
 
 
101 aa  84.3  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0298291  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1628  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  49.06 
 
 
112 aa  84.3  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1188  NADH dehydrogenase subunit K  50.98 
 
 
101 aa  84.3  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.288181  normal  0.242913 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3404  F420H2 dehydrogenase subunit K  47 
 
 
100 aa  84.3  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.143705  normal  0.76592 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1363  NADH dehydrogenase subunit K  50 
 
 
102 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0967  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  42.16 
 
 
102 aa  84.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0704138 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2617  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain K  42 
 
 
101 aa  84  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.109952 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2717  NADH dehydrogenase subunit K  53 
 
 
101 aa  83.6  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.290842 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2821  NADH dehydrogenase subunit K  49.51 
 
 
101 aa  83.6  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0637292  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>