More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3404 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3404  F420H2 dehydrogenase subunit K  100 
 
 
100 aa  200  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.143705  normal  0.76592 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1290  F420H2 dehydrogenase subunit K  74 
 
 
100 aa  140  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  7.20191e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1057  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  61.54 
 
 
92 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.722396  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1924  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  49 
 
 
100 aa  102  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.171281  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1212  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.96 
 
 
106 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0142409  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1346  NADH dehydrogenase subunit K  54.46 
 
 
103 aa  100  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.948415  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5943  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.52 
 
 
114 aa  97.4  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0695  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48 
 
 
100 aa  97.1  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0711  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.48 
 
 
106 aa  96.3  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00926088  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26871  NADH dehydrogenase subunit K  52.94 
 
 
109 aa  96.7  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3248  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.81 
 
 
101 aa  95.1  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.798847  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4072  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.46 
 
 
109 aa  94.7  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.035212  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3294  NADH dehydrogenase subunit K  52 
 
 
104 aa  94.7  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1110  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.32 
 
 
101 aa  94  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1372  NADH dehydrogenase I chain K  50 
 
 
97 aa  92.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00536426  normal  0.982278 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1658  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.46 
 
 
100 aa  92  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.708964  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0283  NADH dehydrogenase subunit K  53.12 
 
 
109 aa  92  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2409  NADH dehydrogenase subunit K  52.08 
 
 
109 aa  91.3  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3812  NADH dehydrogenase subunit K  50 
 
 
104 aa  91.3  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01741  NADH dehydrogenase subunit K  49.5 
 
 
107 aa  90.5  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.359361  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3744  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.52 
 
 
110 aa  90.1  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1293  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  50 
 
 
101 aa  90.1  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02301  NADH dehydrogenase subunit K  48.51 
 
 
109 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1013  NADH dehydrogenase subunit K  52.48 
 
 
103 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1524  NADH dehydrogenase subunit K  48.51 
 
 
109 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1042  NADH dehydrogenase subunit K  52.48 
 
 
103 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.514853  hitchhiker  0.00000310035 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01861  NADH dehydrogenase subunit K  47.52 
 
 
106 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5091  NADH dehydrogenase subunit K  50 
 
 
104 aa  90.1  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0159  NADH dehydrogenase subunit K  46.53 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1511  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47 
 
 
101 aa  88.6  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505168 
 
 
-
 
NC_002936  DET0930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  41.67 
 
 
101 aa  87.8  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_801  NADH:quinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)  41.67 
 
 
101 aa  87.8  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1306  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  42.86 
 
 
103 aa  87.8  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0814  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  41.67 
 
 
101 aa  87.8  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2526  NADH dehydrogenase subunit K  50.54 
 
 
103 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2052  NADH dehydrogenase subunit K  48 
 
 
101 aa  87  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01771  NADH dehydrogenase subunit K  46.53 
 
 
106 aa  87  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0671  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)-like protein  49.45 
 
 
156 aa  87  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5414  NADH dehydrogenase subunit K  51 
 
 
104 aa  87  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2039  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  41.24 
 
 
105 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0098763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5536  NADH dehydrogenase subunit K  51 
 
 
104 aa  87  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0475445 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0322  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  46.39 
 
 
113 aa  87  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5418  NADH dehydrogenase subunit K  51 
 
 
104 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4975  NADH dehydrogenase subunit K  51 
 
 
104 aa  86.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5384  NADH dehydrogenase subunit K  51 
 
 
104 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.60096e-18 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2204  NADH dehydrogenase subunit K  50 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1881  NADH dehydrogenase subunit K  50 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0919  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  42.42 
 
 
100 aa  86.3  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2617  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain K  42.42 
 
 
101 aa  86.3  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.109952 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01751  NADH dehydrogenase subunit K  45.54 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4993  NADH dehydrogenase subunit K  50 
 
 
104 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1159  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43.62 
 
 
99 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0971  NADH dehydrogenase subunit K  44.55 
 
 
101 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593359  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1039  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  42.42 
 
 
100 aa  85.5  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5143  NADH dehydrogenase subunit K  50 
 
 
104 aa  84.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0477  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  41 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.235495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5535  NADH dehydrogenase subunit K  50 
 
 
104 aa  84.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1607  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  41.35 
 
 
105 aa  85.1  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.267693  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1570  NADH dehydrogenase subunit K  47.31 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1594  NADH dehydrogenase subunit K  47.31 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0878  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  41.41 
 
 
100 aa  84.3  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174909  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2996  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  47 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1540  NADH dehydrogenase subunit K  47.31 
 
 
99 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0449834  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4491  NADH dehydrogenase subunit K  46.24 
 
 
99 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2095  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47 
 
 
108 aa  84  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5469  NADH dehydrogenase subunit K  49 
 
 
104 aa  84  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4987  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  52 
 
 
105 aa  83.6  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.666678  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0191  NADH dehydrogenase subunit K  45.45 
 
 
101 aa  83.6  8e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4381  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.25 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1867  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.39 
 
 
96 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.937168  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0556  NADH-quinone oxidoreductase chain K  43 
 
 
101 aa  83.2  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4548  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.87 
 
 
99 aa  83.2  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1413  putative transmembrane NADH dehydrogenase I (chain K) oxidoreductase protein  46.46 
 
 
102 aa  83.2  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.272363  normal  0.0563536 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1607  NADH dehydrogenase (ubiquinone), K subunit  43 
 
 
101 aa  83.2  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4055  NADH dehydrogenase subunit K  49.47 
 
 
105 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.7005  normal  0.327685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4453  NADH dehydrogenase subunit K  48.42 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1818  NADH dehydrogenase subunit K  42.86 
 
 
102 aa  81.3  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118979  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1403  NADH dehydrogenase subunit K  41.41 
 
 
100 aa  81.3  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186448  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2995  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  45 
 
 
101 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0476  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  44.55 
 
 
102 aa  80.9  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3246  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  44 
 
 
102 aa  80.9  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244776  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5170  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.81 
 
 
102 aa  80.5  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.896952  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2049  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43 
 
 
101 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1565  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  38.38 
 
 
102 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199091  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1875  NADH dehydrogenase subunit K  46.24 
 
 
99 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2717  NADH dehydrogenase subunit K  52.48 
 
 
101 aa  80.5  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.290842 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1752  NADH dehydrogenase subunit K  45 
 
 
101 aa  80.1  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504148  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3629  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39.39 
 
 
100 aa  79.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3500  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43.62 
 
 
102 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0470  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43.43 
 
 
118 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.144201 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1101  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  43 
 
 
106 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0399  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  51.49 
 
 
101 aa  79  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0148  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  42.42 
 
 
100 aa  78.6  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000206273  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1503  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  43.62 
 
 
102 aa  79  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0163297  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03260  NADH dehydrogenase subunit K  45 
 
 
99 aa  79  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1434  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  43 
 
 
102 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.598892  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1152  NADH dehydrogenase subunit K  43 
 
 
101 aa  78.6  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2763  NADH dehydrogenase subunit K  40.4 
 
 
100 aa  78.2  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.369555  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1501  NADH dehydrogenase subunit K  40.4 
 
 
100 aa  78.2  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0959  NADH dehydrogenase subunit K  43.62 
 
 
103 aa  77.8  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.158616  normal  0.425824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>