50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2740 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2740  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  100 
 
 		 102 aa  202  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.287866  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1396  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  75.49 
 
 		 102 aa  156  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2664  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  51.52 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0742  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  50 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1282  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  52.69 
 
 		 105 aa  98.2  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0814  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  48 
 
 		 100 aa  87.4  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1002  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.19 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0507  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  40.62 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105387  hitchhiker  0.0000332373 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01570  hypothetical protein  35.56 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2162  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  31.78 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1036  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.88 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0560094 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2862  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  37.5 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0381  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  35.64 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000428364  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1583  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  41.89 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12070  NADH dehydrogenase I subunit K  32.98 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000348654  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3665  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  29.35 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3283  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  29.35 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0233642  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0916  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  35.29 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.259781  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3952  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  29.35 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3448  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31.73 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.458831  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2968  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  30.11 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1636  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  30.43 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2211  membrane bound protein complex subunit mbxG  30.84 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.756272  normal  0.135903 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5154  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  30.56 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1614  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  33.33 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2572  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  35.29 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2285  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  25.66 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1474  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.76 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.273986 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3542  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  33.73 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148667  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4786  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  33.73 
 
 		 111 aa  47.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0843  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31.18 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0864644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  34.12 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0554454  normal  0.387715 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2762  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  34.12 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0792  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  24.76 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0031  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.1 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0804  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  33.78 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1841  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  28.05 
 
 		 151 aa  44.3  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.682129  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0536  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  25.45 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1299  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  26.97 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.11215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1161  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.43 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1608  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  28.28 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.439148  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1215  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  26.32 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0556  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29.89 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2872  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  27.47 
 
 		 113 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0969  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  25.53 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0950  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  25.53 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0670  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  29.55 
 
 		 114 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1639  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  34.43 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1712  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  34.43 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4835  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  22.77 
 
 		 122 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>