92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1639 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1639  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  100 
 
 
110 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1712  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  98.9 
 
 
106 aa  178  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2572  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  39.45 
 
 
111 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0804  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  39.39 
 
 
107 aa  84  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2762  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  46.07 
 
 
113 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  46.07 
 
 
113 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0554454  normal  0.387715 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4786  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  37.61 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0579  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.19 
 
 
111 aa  80.1  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1474  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  45.98 
 
 
111 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.273986 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3542  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  39.25 
 
 
111 aa  77  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148667  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1614  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  43.02 
 
 
114 aa  76.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1162  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  44.58 
 
 
114 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.660845  normal  0.977203 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0670  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39.81 
 
 
114 aa  66.6  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1608  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.21 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.439148  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1215  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  32.46 
 
 
114 aa  61.6  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0792  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  29.25 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2162  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  28.57 
 
 
130 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3952  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.41 
 
 
120 aa  60.1  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1352  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.13 
 
 
123 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.687552  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0381  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39.22 
 
 
111 aa  59.7  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000428364  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0954  hypothetical protein  34.65 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0333861  normal  0.110098 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2211  membrane bound protein complex subunit mbxG  38.2 
 
 
119 aa  57.4  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.756272  normal  0.135903 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1636  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  32.35 
 
 
121 aa  57  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3448  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31.48 
 
 
121 aa  57  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.458831  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12070  NADH dehydrogenase I subunit K  37 
 
 
110 aa  56.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000348654  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0507  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.38 
 
 
119 aa  55.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105387  hitchhiker  0.0000332373 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0892  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  40 
 
 
111 aa  55.5  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0510919  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0938  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  33.02 
 
 
118 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1282  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  32.94 
 
 
105 aa  54.3  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3283  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31.68 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0233642  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3665  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  30.69 
 
 
122 aa  52.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0572265  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4835  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.11 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1041  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  32.08 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.371299  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1780  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  32.08 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0876  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  32.08 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000659238 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1841  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  29.81 
 
 
151 aa  51.6  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.682129  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2285  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  30.3 
 
 
119 aa  51.2  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0469  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.68 
 
 
111 aa  50.8  0.000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5154  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  30.77 
 
 
125 aa  50.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1036  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  41.18 
 
 
112 aa  50.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0560094 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0843  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  30.1 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0864644  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2968  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  28.28 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0556  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  28.43 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1396  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  33.78 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0814  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  30.59 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2862  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  28.12 
 
 
118 aa  47.4  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0916  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  31.43 
 
 
121 aa  47  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.259781  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0045  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.33 
 
 
145 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1743  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.33 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1299  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  27.96 
 
 
103 aa  47  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.11215  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3220  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.91 
 
 
123 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2872  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  27.08 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0032  Na(+)/H(+) antiporter subunit C  32.89 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0031  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  39.71 
 
 
112 aa  45.4  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2740  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  31.08 
 
 
102 aa  45.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.287866  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0536  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  28.87 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1442  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  33.75 
 
 
109 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.312329  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4730  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  33.7 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0479151  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0076  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.28 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2342  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  32.32 
 
 
120 aa  44.7  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.556255  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1002  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.33 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1604  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  46.81 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5268  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  50 
 
 
111 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1583  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.31 
 
 
106 aa  43.5  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0742  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  28.28 
 
 
103 aa  43.5  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0969  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  27.84 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  36.36 
 
 
112 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0149  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  36.59 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2585  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  32.97 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3856  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.1 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1009  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  33 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0960292  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1385  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  42.31 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0502241  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3290  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  37.65 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.166006  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0950  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  27.84 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2475  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  42.31 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514033  normal  0.278156 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1773  Na(+)/H(+) antiporter subunit C  28.26 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1358  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  44.68 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.158438  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0402  hypothetical protein  28.26 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4323  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.95 
 
 
112 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.691095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50720  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.95 
 
 
112 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767976  hitchhiker  0.0034866 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14760  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhC subunit  30.51 
 
 
154 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.123185  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05160  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhC subunit  31.91 
 
 
160 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2664  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  31.87 
 
 
102 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2485  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43.4 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1288  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  38.37 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.97867  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35450  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhC subunit  32.41 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.975038 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0675  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  36.59 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1770  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  28.12 
 
 
115 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19540  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.53 
 
 
109 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00361637  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.85 
 
 
115 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1161  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29.07 
 
 
108 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0096  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  28.57 
 
 
122 aa  40  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>