52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1396 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1396  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  100 
 
 		 102 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2740  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  75.49 
 
 		 102 aa  156  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.287866  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1282  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  56.99 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0742  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  55.56 
 
 		 103 aa  100  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2664  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  57.45 
 
 		 102 aa  98.6  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0814  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  52.04 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1002  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0507  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  34.65 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105387  hitchhiker  0.0000332373 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2162  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  33.64 
 
 		 130 aa  62  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1036  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.92 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0560094 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01570  hypothetical protein  36.17 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0381  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.67 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000428364  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12070  NADH dehydrogenase I subunit K  32.98 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000348654  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2862  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  34.74 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0916  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  30.91 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.259781  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3448  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  28.16 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.458831  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3665  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  26.09 
 
 		 122 aa  50.4  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3283  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  26.09 
 
 		 120 aa  50.4  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0233642  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0792  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  25.44 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3952  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  25.25 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0843  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  30.77 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0864644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1583  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  40.54 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4786  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  36.14 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2285  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  29.17 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1474  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.21 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.273986 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0804  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  27.84 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2211  membrane bound protein complex subunit mbxG  32.65 
 
 		 119 aa  47  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.756272  normal  0.135903 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1841  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  29.07 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.682129  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5154  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  26.17 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2968  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  25.81 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1614  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  33 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2572  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  33.33 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1636  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  28.04 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2872  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  28.43 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0031  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29.91 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3542  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  33.73 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148667  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1712  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  29.67 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1639  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  29.67 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1288  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  45.45 
 
 		 114 aa  43.5  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.97867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2762  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.76 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.76 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0554454  normal  0.387715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3444  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.53 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.119387  normal  0.215433 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3511  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.53 
 
 		 114 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2229  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.53 
 
 		 114 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1009  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29.47 
 
 		 114 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0960292  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1852  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.53 
 
 		 114 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0548106 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3856  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5155  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29.81 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3714  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  40.91 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3448  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  40.91 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.378058 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  43.48 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1161  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29.35 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>