90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2162 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2162  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  100 
 
 		 130 aa  258  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0792  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  44.54 
 
 		 133 aa  105  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2862  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  39.84 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1636  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  38.26 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2968  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.61 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2285  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  33.04 
 
 		 119 aa  89  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0507  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.38 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105387  hitchhiker  0.0000332373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3952  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  35.14 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5154  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38.71 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3448  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.07 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.458831  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3283  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.11 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0233642  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3665  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  36.11 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0843  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.89 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0864644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0556  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  34.82 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0469  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  35.58 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1215  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  30.97 
 
 		 114 aa  70.1  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1299  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  32.69 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.11215  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0381  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  35.92 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000428364  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0916  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  32.31 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.259781  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0889  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  27.74 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.267574  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1396  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  33.64 
 
 		 102 aa  62  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0032  Na(+)/H(+) antiporter subunit C  43.37 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0892  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.94 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0510919  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1841  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  30.77 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.682129  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2740  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  31.78 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.287866  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0670  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31.25 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1474  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  32.43 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.273986 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3542  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.37 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148667  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0742  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  35.29 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2211  membrane bound protein complex subunit mbxG  32.32 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.756272  normal  0.135903 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2664  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  35.45 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4835  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  29.13 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0682  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.88 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1608  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  30.93 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.439148  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1041  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.62 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.371299  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4786  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29.41 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1780  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.62 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0876  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.62 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000659238 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5102  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.5 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1614  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.53 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2572  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  28.83 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0814  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  31.37 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12070  NADH dehydrogenase I subunit K  26.47 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000348654  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1352  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.82 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.687552  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0804  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  24.58 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1002  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31.3 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1282  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  32.69 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0938  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.15 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0579  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  27.62 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0954  hypothetical protein  33.04 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0333861  normal  0.110098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2100  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  32.38 
 
 		 115 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.696094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1161  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  35.19 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0402  hypothetical protein  29.13 
 
 		 123 aa  47.8  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1773  Na(+)/H(+) antiporter subunit C  29.13 
 
 		 123 aa  47.8  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1743  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  28.28 
 
 		 114 aa  47.8  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1770  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.53 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  27.37 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0554454  normal  0.387715 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2762  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  27.37 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1162  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  27.66 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.660845  normal  0.977203 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1712  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  24.73 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1639  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  25 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2342  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.77 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.556255  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0163  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  32.43 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.378789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0743  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  32.43 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2033  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  32.29 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0076  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  27.35 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0096  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.53 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.07 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0536  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  28 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0134  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.53 
 
 		 140 aa  43.5  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3220  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  27.27 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25190  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhC subunit  30.39 
 
 		 237 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.449884  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1036  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31.76 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0560094 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3659  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.99 
 
 		 208 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2585  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  31.11 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35450  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhC subunit  26.61 
 
 		 158 aa  41.6  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.975038 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1101  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  28.57 
 
 		 138 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0275819  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3186  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  26.28 
 
 		 169 aa  41.6  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3744  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.33 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2092  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.25 
 
 		 115 aa  40.8  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25025  normal  0.290063 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0950  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  27 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0969  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  27 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1679  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29.59 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1864  NADH dehydrogenase subunit K  28.28 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0919453 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1737  NADH dehydrogenase subunit K  28.28 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0907851  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3700  NADH dehydrogenase subunit K  28.28 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.695488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4128  NADH dehydrogenase subunit K  28.28 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.816541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0597  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.91 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.491478  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0585  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.91 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0575  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.91 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>