66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1041 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1780  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  100 
 
 
118 aa  228  2e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0876  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  100 
 
 
118 aa  228  2e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000659238 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1041  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  100 
 
 
118 aa  228  2e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.371299  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0938  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  94.07 
 
 
118 aa  215  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1352  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  76.47 
 
 
123 aa  172  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.687552  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0670  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  41.96 
 
 
114 aa  78.2  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1215  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  40.37 
 
 
114 aa  63.5  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2211  membrane bound protein complex subunit mbxG  36.27 
 
 
119 aa  60.5  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.756272  normal  0.135903 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0954  hypothetical protein  40.87 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0333861  normal  0.110098 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0381  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39.62 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000428364  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1608  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38.38 
 
 
112 aa  56.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.439148  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2162  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  31.62 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2285  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  35.19 
 
 
119 aa  55.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0507  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.27 
 
 
119 aa  55.1  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105387  hitchhiker  0.0000332373 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0792  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.03 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0843  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.5 
 
 
164 aa  53.5  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0864644  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0469  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  34.19 
 
 
111 aa  52  0.000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2585  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  36.56 
 
 
114 aa  50.4  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1282  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  37.74 
 
 
105 aa  50.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0804  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  29.31 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0556  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  33.33 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12070  NADH dehydrogenase I subunit K  37.25 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000348654  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0742  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  30.91 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3659  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  30.83 
 
 
208 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1636  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  33.01 
 
 
121 aa  47.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2862  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  32.69 
 
 
118 aa  47.4  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1743  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.67 
 
 
114 aa  47  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0045  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31.09 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25190  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhC subunit  31.97 
 
 
237 aa  46.2  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.449884  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1841  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31.43 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.682129  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5154  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31.48 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1161  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  37.14 
 
 
108 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1773  Na(+)/H(+) antiporter subunit C  31.87 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0402  hypothetical protein  31.87 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2968  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.02 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3448  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  29.25 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.458831  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0866  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.03 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719007  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3730  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  36.52 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488213  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3872  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  29.91 
 
 
212 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0349  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  32.08 
 
 
270 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00345986  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1283  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  36.36 
 
 
125 aa  44.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1639  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  31.52 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26940  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhC subunit  36.04 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0428774  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0814  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  33.68 
 
 
100 aa  43.9  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3817  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.22 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1002  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  35.96 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0859006  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3542  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  28.85 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148667  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1712  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31.52 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0876  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  38.37 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.325087  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05160  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhC subunit  28.83 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3220  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.28 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3952  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  28.57 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3186  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  28.7 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1474  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29.52 
 
 
111 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.273986 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3949  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.03 
 
 
124 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.100103 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5213  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31.48 
 
 
188 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00300785  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2711  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.65 
 
 
118 aa  41.6  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0209  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  27.27 
 
 
175 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2572  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  32.46 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35450  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhC subunit  30.84 
 
 
158 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.975038 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0979  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  35.24 
 
 
119 aa  40.4  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.215867  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4786  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  32.38 
 
 
111 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0076  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.86 
 
 
121 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6654  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhC subunit- like protein  29.66 
 
 
272 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0892  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.5 
 
 
111 aa  40.4  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0510919  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1614  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  28.57 
 
 
114 aa  40  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>