67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0682 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0682  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  100 
 
 
139 aa  279  8.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5102  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  69.64 
 
 
120 aa  166  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1674  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  52.68 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0954  hypothetical protein  41.82 
 
 
115 aa  91.3  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0333861  normal  0.110098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4835  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.07 
 
 
122 aa  83.6  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0670  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  41.82 
 
 
114 aa  77  0.00000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1215  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  34.86 
 
 
114 aa  68.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2211  membrane bound protein complex subunit mbxG  36.21 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.756272  normal  0.135903 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1608  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38.74 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.439148  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0381  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38.78 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000428364  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2862  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  36.28 
 
 
118 aa  63.5  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0507  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  34.26 
 
 
119 aa  61.2  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105387  hitchhiker  0.0000332373 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2585  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  34.55 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5154  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.28 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2162  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  33.88 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3146  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  33.33 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0270139  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3448  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.73 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.458831  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12070  NADH dehydrogenase I subunit K  33.33 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000348654  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0843  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31.39 
 
 
164 aa  52.8  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0864644  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0892  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  35.35 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0510919  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2711  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  35.09 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1352  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  34.95 
 
 
123 aa  52  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.687552  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2968  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  28.23 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0556  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.56 
 
 
111 aa  49.7  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0916  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  32.38 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.259781  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1743  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  30.43 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1841  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  26.89 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.682129  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2285  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  28.04 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2572  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29.52 
 
 
111 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0562  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.35 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.759234  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0485  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  34.69 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.374483 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3220  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  32.69 
 
 
123 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0579  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  29.9 
 
 
111 aa  44.3  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1636  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  31.07 
 
 
121 aa  44.7  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0814  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  32.63 
 
 
100 aa  44.3  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1002  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.98 
 
 
133 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2872  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.3 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0163  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29.79 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.378789 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0402  hypothetical protein  32.04 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0938  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  33.33 
 
 
118 aa  43.9  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0742  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  32 
 
 
103 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1773  Na(+)/H(+) antiporter subunit C  32.04 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0536  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  33.33 
 
 
115 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1780  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.78 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2444  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  34.86 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1041  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.78 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.371299  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1614  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29.29 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4786  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  27.37 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1799  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  30.08 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1009  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  35.11 
 
 
114 aa  42.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0960292  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0876  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.78 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000659238 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3542  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  28.42 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148667  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2421  NADH dehydrogenase subunit K  28.97 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.141986 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0134  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  28.06 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3949  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31.07 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.100103 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0950  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.73 
 
 
113 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0969  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.73 
 
 
113 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0647  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  34.95 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0662  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  34.95 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115013  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0283  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  35.11 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3186  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31.54 
 
 
169 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5268  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  37.78 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2664  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  33.91 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0743  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  28.06 
 
 
155 aa  40.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1299  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  27.88 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.11215  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4323  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  35.58 
 
 
112 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.691095  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2740  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  29.59 
 
 
102 aa  40  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.287866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>