34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1611 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1611  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.878183  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  27.17 
 
 
286 aa  65.1  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  25.09 
 
 
286 aa  62  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  25.41 
 
 
286 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  26.78 
 
 
287 aa  55.5  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2807  N-formylglutamate amidohydrolase  25.09 
 
 
286 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  26.43 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1317  N-formylglutamate amidohydrolase  25.64 
 
 
271 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.256514  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0386  N-formylglutamate amidohydrolase  25 
 
 
287 aa  49.7  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  25.51 
 
 
273 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  27.76 
 
 
291 aa  49.3  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  26.05 
 
 
285 aa  48.9  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  25.73 
 
 
295 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  26.61 
 
 
267 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  27.47 
 
 
266 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0136  N-formylglutamate amidohydrolase  31.27 
 
 
286 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  26.61 
 
 
267 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  26.86 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  26.61 
 
 
267 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  26.61 
 
 
267 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  26.45 
 
 
285 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  27.9 
 
 
266 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5957  N-formylglutamate amidohydrolase  24.79 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  26.86 
 
 
344 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  25.11 
 
 
266 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  25.1 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1455  N-formylglutamate amidohydrolase  25.63 
 
 
235 aa  43.9  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  25.11 
 
 
267 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  25.55 
 
 
266 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  22.96 
 
 
296 aa  42.7  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3899  N-formylglutamate amidohydrolase  23.32 
 
 
271 aa  42.7  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  25 
 
 
295 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  26.01 
 
 
267 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  27.57 
 
 
288 aa  42.4  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>