66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0159 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0159  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  100 
 
 		 300 aa  579  1e-164  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291568  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5452  hypothetical protein  54.51 
 
 		 307 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.649617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10143  hypothetical protein  54.67 
 
 		 308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1375  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  55.7 
 
 		 306 aa  281  9e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5073  hypothetical protein  53.47 
 
 		 307 aa  278  7e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5161  hypothetical protein  53.47 
 
 		 307 aa  278  7e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205602  normal  0.249883 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0745  putative regulatory protein Ada  53.57 
 
 		 324 aa  265  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.203798 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1111  hypothetical protein  54.64 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5701  hypothetical protein  52.76 
 
 		 303 aa  257  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4692  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  51.35 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4079  putative ADA-like transcriptional regulator-AraC family  52.55 
 
 		 297 aa  243  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6336  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  47.26 
 
 		 314 aa  225  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4314  putative DNA repair protein  46.92 
 
 		 309 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06190  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  47.59 
 
 		 303 aa  218  8.999999999999998e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2766  hypothetical protein  42.63 
 
 		 336 aa  215  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00029608 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3065  hypothetical protein  45.72 
 
 		 341 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37721  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0084  hypothetical protein  47.18 
 
 		 332 aa  209  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3854  hypothetical protein  45.7 
 
 		 335 aa  205  7e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00582151  normal  0.050909 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3470  hypothetical protein  46.46 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7615  hypothetical protein  45.36 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.416094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0748  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  44.18 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1304  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  44.21 
 
 		 311 aa  172  5.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.730307  decreased coverage  0.000389151 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2841  hypothetical protein  44.36 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71041  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17610  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  41.39 
 
 		 342 aa  165  6.9999999999999995e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.481854  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1548  hypothetical protein  38.23 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08520  hypothetical protein  40.13 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1492  hypothetical protein  37.98 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0551879  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3755  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 489 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051726  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0522  HhH-GPD  21.21 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.454329 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1101  Ada metal-binding domain-containing protein  31.03 
 
 		 511 aa  52.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12283  normal  0.610277 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11344  Ada regulatory protein alkA  32.28 
 
 		 496 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.334528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1638  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.34 
 
 		 504 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414253  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5912  transcriptional regulator Ada / DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  29.7 
 
 		 500 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06530  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  33.11 
 
 		 286 aa  50.4  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.937537 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0044  Ada metal-binding domain-containing protein  28.85 
 
 		 513 aa  49.7  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3139  AlkA domain protein  33.8 
 
 		 308 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3856  DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  29.96 
 
 		 496 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26438  hitchhiker  0.00733732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3726  transcriptional regulator, AraC family  31.17 
 
 		 534 aa  49.3  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3944  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada  29.96 
 
 		 517 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.445653  hitchhiker  0.00805865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3870  DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  29.96 
 
 		 517 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1829  transcriptional regulator, AraC family  30.34 
 
 		 517 aa  48.5  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.719428  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2913  alcohol dehydrogenase  33.1 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.304572 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3192  transcriptional regulator, AraC family  28.38 
 
 		 497 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0100093  hitchhiker  0.000000000975834 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2020  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada  31.03 
 
 		 517 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.416366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3357  transcriptional regulator Ada / DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  31.9 
 
 		 486 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2823  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada  30.41 
 
 		 534 aa  47.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1064  HhH-GPD family protein  22.73 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3470  AraC family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 523 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884533  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3037  AlkA domain protein  32.14 
 
 		 376 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0138739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1638  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  27.38 
 
 		 275 aa  46.6  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2419  AlkA domain protein  35.81 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.839778  hitchhiker  0.00593166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1888  alcohol dehydrogenase  31.21 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753852  normal  0.559526 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3585  DNA-3-methyladenine glycosidase II  30.61 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3550  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 485 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982033 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1213  HhH-GPD  28.48 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.235749  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1367  Ada metal-binding domain-containing protein  33.95 
 
 		 503 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2560  Ada metal-binding domain-containing protein  29.41 
 
 		 581 aa  43.9  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0353  HhH-GPD family protein  22.98 
 
 		 282 aa  44.3  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04780  DNA methylation and regulatory protein  32.52 
 
 		 487 aa  43.9  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1219  transcriptional regulator, AraC family  29.28 
 
 		 492 aa  43.5  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.627471  normal  0.0317838 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1593  base-excision DNA repair protein  28.08 
 
 		 219 aa  43.5  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.184582  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4053  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 		 330 aa  43.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2505  putative transcription regulator protein  30.5 
 
 		 490 aa  43.5  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0201165 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2326  alcohol dehydrogenase  29.73 
 
 		 503 aa  43.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3000  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 515 aa  42.7  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2773  transcriptional regulator, AraC family  32.43 
 
 		 491 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>