37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0084 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0084  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  629  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4692  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  50.16 
 
 
302 aa  268  8e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1375  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  48.82 
 
 
306 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0745  putative regulatory protein Ada  47.65 
 
 
324 aa  231  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.203798 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2766  hypothetical protein  43.96 
 
 
336 aa  218  7.999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00029608 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4079  putative ADA-like transcriptional regulator-AraC family  49.13 
 
 
297 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3854  hypothetical protein  46.71 
 
 
335 aa  216  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00582151  normal  0.050909 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0159  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  47.18 
 
 
300 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291568  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3470  hypothetical protein  45.93 
 
 
293 aa  215  8e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4314  putative DNA repair protein  44.81 
 
 
309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10143  hypothetical protein  48.64 
 
 
308 aa  212  7e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2841  hypothetical protein  46.46 
 
 
313 aa  210  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71041  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6336  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  45.54 
 
 
314 aa  205  9e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5452  hypothetical protein  46.8 
 
 
307 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.649617  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06190  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  47.57 
 
 
303 aa  203  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307458  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5161  hypothetical protein  46.13 
 
 
307 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205602  normal  0.249883 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5073  hypothetical protein  46.13 
 
 
307 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3065  hypothetical protein  42.18 
 
 
341 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37721  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7615  hypothetical protein  42.72 
 
 
345 aa  195  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.416094  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1304  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  49.45 
 
 
311 aa  192  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.730307  decreased coverage  0.000389151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5701  hypothetical protein  43.89 
 
 
303 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1111  hypothetical protein  44.48 
 
 
304 aa  175  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1548  hypothetical protein  40.45 
 
 
306 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0748  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  41.39 
 
 
295 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1492  hypothetical protein  40.26 
 
 
306 aa  172  9e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0551879  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08520  hypothetical protein  43.61 
 
 
337 aa  166  6.9999999999999995e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17610  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  42.9 
 
 
342 aa  145  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.481854  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4163  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
482 aa  49.7  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.813535  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0318  HhH-GPD family protein  25 
 
 
301 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.536275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2163  HhH-GPD family protein  27.78 
 
 
328 aa  46.2  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338559  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3783  alcohol dehydrogenase  30.91 
 
 
551 aa  46.2  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3301  DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  29.73 
 
 
494 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0977453  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3550  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
485 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42700  DNA-3-methyladenine glycosidase II  29.01 
 
 
297 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3585  DNA-3-methyladenine glycosidase II  29.11 
 
 
297 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3847  HhH-GPD family protein  29.38 
 
 
214 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583366  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1638  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  29.58 
 
 
275 aa  42.7  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.310239 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>