46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3854 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3854  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  652    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00582151  normal  0.050909 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0745  putative regulatory protein Ada  53.11 
 
 		 324 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.203798 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2841  hypothetical protein  49.35 
 
 		 313 aa  248  7e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71041  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4079  putative ADA-like transcriptional regulator-AraC family  52.31 
 
 		 297 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1375  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  50.34 
 
 		 306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0084  hypothetical protein  46.25 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5161  hypothetical protein  46.6 
 
 		 307 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205602  normal  0.249883 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4692  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  46.15 
 
 		 302 aa  215  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5073  hypothetical protein  46.6 
 
 		 307 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5452  hypothetical protein  46.6 
 
 		 307 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.649617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10143  hypothetical protein  45.94 
 
 		 308 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7615  hypothetical protein  46.95 
 
 		 345 aa  212  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.416094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0159  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  45.7 
 
 		 300 aa  209  7e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291568  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06190  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  48.11 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08520  hypothetical protein  44.97 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3470  hypothetical protein  45.15 
 
 		 293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3065  hypothetical protein  44.48 
 
 		 341 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37721  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5701  hypothetical protein  45.02 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2766  hypothetical protein  39.46 
 
 		 336 aa  192  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00029608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6336  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  43.64 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1111  hypothetical protein  43.69 
 
 		 304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4314  putative DNA repair protein  42.81 
 
 		 309 aa  182  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0748  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  41.84 
 
 		 295 aa  175  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1304  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  43.17 
 
 		 311 aa  152  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.730307  decreased coverage  0.000389151 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1548  hypothetical protein  39.16 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1492  hypothetical protein  40.53 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0551879  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17610  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  35.02 
 
 		 342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.481854  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3585  DNA-3-methyladenine glycosidase II  35.97 
 
 		 297 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2419  AlkA domain protein  38.46 
 
 		 302 aa  53.5  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.839778  hitchhiker  0.00593166 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42700  DNA-3-methyladenine glycosidase II  34.97 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2823  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada  34.27 
 
 		 534 aa  52.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2326  alcohol dehydrogenase  30.34 
 
 		 503 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2020  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada  35.88 
 
 		 517 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.416366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2560  Ada metal-binding domain-containing protein  34.88 
 
 		 581 aa  46.2  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1593  base-excision DNA repair protein  29.53 
 
 		 219 aa  46.2  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.184582  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1829  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 517 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.719428  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1888  alcohol dehydrogenase  33.57 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753852  normal  0.559526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3726  transcriptional regulator, AraC family  34.81 
 
 		 534 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0534  HhH-GPD family protein  28.24 
 
 		 219 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.723386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3037  AlkA domain protein  34.04 
 
 		 376 aa  43.5  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0138739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1271  HhH-GPD family protein  30.61 
 
 		 219 aa  43.5  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1638  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.78 
 
 		 504 aa  43.5  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414253  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3139  AlkA domain protein  34.06 
 
 		 308 aa  42.7  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3192  transcriptional regulator, AraC family  31.86 
 
 		 497 aa  42.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0100093  hitchhiker  0.000000000975834 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2773  transcriptional regulator, AraC family  32.81 
 
 		 491 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1646  base-excision DNA repair protein  29.93 
 
 		 232 aa  42.4  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>