33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2218 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2218  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  201  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102772  normal  0.371224 
 
 
-
 
NC_004310  BR0152  hypothetical protein  47.67 
 
 
107 aa  87.4  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2927  hypothetical protein  48.96 
 
 
98 aa  87.4  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.142227  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2443  hypothetical protein  41.8 
 
 
122 aa  87  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0394  hypothetical protein  45.79 
 
 
130 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0147  hypothetical protein  46.51 
 
 
107 aa  84.7  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.264223  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0164  hypothetical protein  44.21 
 
 
107 aa  83.6  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2199  hypothetical protein  46.3 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.983186  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0022  hypothetical protein  34.51 
 
 
114 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0120  hypothetical protein  46.22 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.598162  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0178  hypothetical protein  46.22 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2502  hypothetical protein  53.85 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.246451  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0203  hypothetical protein  45.38 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.164325  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0058  hypothetical protein  37.11 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772862  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0411  hypothetical protein  38.46 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0057  hypothetical protein  40.23 
 
 
115 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0688215  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0042  hypothetical protein  40.24 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.260618 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3673  hypothetical protein  41.89 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0065  hypothetical protein  38.46 
 
 
115 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0195  hypothetical protein  42.65 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119963  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0099  hypothetical protein  57.69 
 
 
130 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0070  hypothetical protein  40.85 
 
 
128 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0131159  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0146  hypothetical protein  43.48 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0637  hypothetical protein  41.18 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0145  hypothetical protein  48.91 
 
 
108 aa  57.4  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3586  hypothetical protein  40.28 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0216464  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3884  phosphoribosylanthranilate isomerase-like protein  31.03 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.852598  normal  0.497683 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3273  hypothetical protein  33.01 
 
 
126 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.343272 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3588  hypothetical protein  30.7 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1028  hypothetical protein  35.44 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.771567  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1372  hypothetical protein  27.27 
 
 
83 aa  43.5  0.0009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3788  hypothetical protein  36.9 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149286  hitchhiker  0.00561497 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0203  hypothetical protein  35.14 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.265477  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>