22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3586 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3586  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  245  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0216464  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1028  hypothetical protein  41.32 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.771567  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0203  hypothetical protein  41.38 
 
 
116 aa  90.1  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.265477  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3788  hypothetical protein  34.21 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149286  hitchhiker  0.00561497 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3273  hypothetical protein  31.97 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.343272 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3588  hypothetical protein  29.6 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3884  phosphoribosylanthranilate isomerase-like protein  32.26 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.852598  normal  0.497683 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0120  hypothetical protein  35.35 
 
 
122 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.598162  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0178  hypothetical protein  35.35 
 
 
122 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2443  hypothetical protein  27.93 
 
 
122 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0146  hypothetical protein  34.04 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0203  hypothetical protein  34.34 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.164325  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2199  hypothetical protein  31.58 
 
 
112 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.983186  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0152  hypothetical protein  29.41 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0057  hypothetical protein  27 
 
 
115 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0688215  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0164  hypothetical protein  30.1 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0065  hypothetical protein  31.07 
 
 
115 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0394  hypothetical protein  35.71 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2927  hypothetical protein  31.58 
 
 
98 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.142227  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0147  hypothetical protein  28.43 
 
 
107 aa  41.2  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.264223  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0042  hypothetical protein  27.1 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.260618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0058  hypothetical protein  26.67 
 
 
110 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772862  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>